Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C5orf36 Gene 0 2.60 13.94 1.37 2.20 4.08 5.26 3.66 2.24 5.44 4.62 2.41 5.82 4.18 1.67 1.03 3.01 1.82 2.43 7.42 6.84 6.23 9.03 6.81 2 427991 Transcript 0 1.35 9.15 0.00 0.64 1.24 1.32 0.64 1.58 2.86 1.74 1.59 4.73 0.27 0.16 0.00 2.45 1.34 1.25 3.93 4.43 5.27 1.75 3.40 3 329378 Transcript 0 3.26 7.19 2.95 3.39 3.72 6.88 2.87 4.57 3.94 7.01 0.43 4.92 0.99 1.01 2.34 0.00 0.13 0.80 3.36 2.64 0.41 12.92 2.34 4 312498 Transcript 0 2.16 9.01 0.37 0.00 0.00 2.62 0.96 0.00 0.69 1.72 0.00 2.07 1.47 0.29 0.00 0.50 0.88 1.36 2.61 3.15 1.72 3.52 4.94 5 403033 Transcript 0 0.91 19.81 1.96 0.44 3.97 5.53 2.02 1.72 6.10 1.06 0.00 0.00 2.38 0.00 0.89 2.63 0.71 1.57 3.37 1.77 6.65 2.32 3.15 6 ER1a ExonRegion 0 2.65 1.27 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 2.60 0.00 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 4.69 12.94 0.96 0.63 2.90 9.02 4.26 0.00 2.38 1.99 2.93 0.00 2.03 1.36 0.00 1.35 2.89 4.21 4.37 5.26 4.63 3.91 6.60 8 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 3.29 0.00 1.60 0.00 0.00 2.03 0.00 3.65 0.00 2.63 0.00 0.00 2.41 0.00 3.93 0.00 14.09 3.86 5.88 0.00 19.96 7.34 9 E1a_E2a KnownJunction 0 6.82 28.02 0.00 2.06 11.80 12.61 12.45 0.00 7.32 3.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.30 1.78 8.09 3.13 0.00 14.88 3.84 10 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 1.70 7.61 2.55 4.35 4.41 1.80 5.98 2.44 4.39 6.45 7.82 4.20 2.09 6.40 4.29 7.33 6.81 7.43 4.56 6.94 2.01 2.63 2.64 11 ER2a ExonRegion 0 1.14 2.61 0.29 0.28 4.87 7.53 0.96 0.70 6.77 2.75 6.21 10.41 2.61 2.16 0.00 2.07 3.08 3.41 12.57 8.45 3.14 10.50 7.39 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 0.00 4.33 5.00 1.99 1.89 5.70 0.00 2.68 12.00 6.49 0.00 0.00 14.78 4.77 0.00 15.81 9.08 2.59 14.27 15.37 13 ER3a ExonRegion 0 0.00 7.70 0.41 1.57 6.28 4.64 7.05 1.35 3.97 1.06 5.13 19.55 7.04 1.69 0.00 7.59 2.53 3.40 9.73 10.80 10.23 14.95 7.12 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 18.55 0.00 0.00 12.14 10.73 6.49 4.35 5.58 1.67 2.11 25.81 40.91 4.94 0.00 4.36 4.77 5.97 14.21 8.37 8.28 9.25 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 4.36 12.61 2.41 2.20 6.84 9.02 2.73 2.60 6.96 4.07 6.93 14.60 11.82 2.49 1.24 10.59 1.58 6.21 4.69 9.61 9.38 15.64 10.67 16 E4a_E5a KnownJunction 0 2.89 3.29 1.83 3.30 0.00 10.73 8.21 9.65 8.48 4.38 2.21 24.46 0.00 4.71 0.00 16.49 0.00 11.32 0.00 6.52 14.02 5.33 13.83 17 ER5a ExonRegion 0 3.71 16.32 1.54 3.86 5.66 7.96 7.65 3.24 9.01 11.97 3.59 10.18 12.52 3.47 1.75 5.70 2.78 4.79 11.01 9.82 8.03 14.90 11.11 18 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 15.39 2.96 3.50 0.00 5.05 2.25 2.30 4.60 8.00 2.68 5.70 6.82 2.47 0.00 0.00 8.70 4.06 3.76 0.00 2.90 16.66 8.54 19 E5a_E6a KnownJunction 0 6.45 9.41 0.00 1.33 3.65 0.00 0.00 4.35 4.43 6.47 0.00 12.60 0.00 0.00 0.00 4.02 3.65 4.68 4.80 6.20 19.65 3.12 3.76 20 ER5b ExonRegion 0 3.26 7.19 2.95 3.39 3.72 6.88 2.87 4.57 3.94 7.01 0.43 4.92 0.99 1.01 2.34 0.00 0.13 0.80 3.36 2.64 0.41 12.92 2.34 21 ER6a ExonRegion 0 2.70 18.35 0.00 1.69 3.57 0.77 4.48 2.35 5.40 3.82 2.73 12.99 2.43 0.84 0.00 1.41 1.20 3.06 8.18 6.78 5.58 4.93 4.88 22 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 21.05 0.00 1.63 0.00 5.11 0.00 2.55 7.70 1.32 6.95 6.30 0.00 0.00 0.00 3.50 0.00 0.00 12.52 9.59 0.00 0.00 8.54 23 E7_Ab NovelBoundary 0 0.00 23.55 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 4.40 1.45 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 12.90 2.24 11.20 7.61 6.24 3.00 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 0.38 20.52 0.00 1.12 0.00 2.50 1.32 1.73 6.51 1.36 4.66 4.33 0.00 0.00 0.00 2.97 7.20 1.85 9.85 8.51 4.51 2.08 5.74 25 ER7b ExonRegion 0 1.48 20.17 0.00 0.00 1.87 0.10 4.03 0.26 4.99 0.57 1.99 6.11 4.30 0.29 1.43 5.41 7.05 1.14 6.89 9.59 4.05 2.08 4.14 26 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER8a ExonRegion 0 1.40 16.05 0.40 0.00 1.76 0.81 2.65 1.70 4.60 0.75 2.97 5.88 1.80 1.59 0.90 3.77 2.90 0.61 5.45 9.13 8.47 1.40 6.53 28 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 31 ER10a ExonRegion 0 1.22 19.38 0.00 1.63 3.49 1.37 4.44 1.41 5.70 1.78 1.95 5.27 2.22 3.52 0.39 1.37 2.49 2.52 12.61 8.75 9.55 3.72 6.61 32 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 7.63 0.00 3.90 11.80 0.00 10.20 1.73 4.17 2.53 2.58 11.10 0.00 2.47 0.00 4.36 0.00 4.39 38.87 9.59 9.08 12.37 11.87 33 ER11a ExonRegion 0 0.00 16.59 0.00 2.24 3.79 1.31 3.35 2.50 5.68 3.55 3.74 6.37 2.89 2.07 0.00 1.59 1.44 1.46 15.59 8.16 5.30 7.31 7.72 34 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 19.34 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 1.93 7.75 4.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.02 0.00 9.41 5.62 2.66 5.51 16.39 35 ER12a ExonRegion 0 0.22 14.55 0.00 0.29 1.60 2.09 5.08 0.83 5.91 4.13 1.03 4.51 3.51 2.90 0.00 1.59 3.84 1.66 11.29 7.50 7.21 8.06 8.95 36 E12a_E13a KnownJunction 0 3.78 15.72 0.00 0.00 3.65 2.56 2.25 0.00 4.20 1.56 0.00 5.85 6.01 4.94 0.00 0.00 4.49 4.97 4.61 0.00 5.75 0.00 8.71 37 ER13a ExonRegion 0 1.17 13.49 0.00 2.15 6.67 3.58 2.47 0.77 4.76 1.28 3.32 3.10 2.77 3.06 0.57 1.66 2.22 2.96 9.49 6.53 5.12 9.17 8.46 38 E13a_E14a KnownJunction 0 3.70 26.18 0.00 3.23 3.40 11.13 0.00 0.00 4.31 1.48 4.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.12 9.60 11.06 4.88 4.84 10.84 39 ER14a ExonRegion 0 3.53 21.25 0.55 2.98 4.22 5.55 4.39 0.62 3.98 3.00 4.96 6.67 3.93 1.07 0.94 1.20 4.40 4.41 10.10 7.05 6.29 6.93 7.57 40 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 24.40 1.69 1.93 3.48 5.79 6.23 5.05 6.31 6.47 0.00 6.30 6.49 2.35 0.00 0.00 0.00 6.38 0.00 9.33 3.15 9.86 3.24 41 ER15a ExonRegion 0 3.58 23.94 0.79 0.74 7.21 2.34 3.93 0.44 5.62 4.33 2.29 2.26 1.11 1.46 0.75 1.29 2.33 2.01 6.30 14.03 9.71 3.87 8.41 42 E15a_E16a KnownJunction 0 7.11 15.33 1.27 0.00 0.00 2.16 2.25 0.00 1.65 5.32 0.00 5.40 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 4.44 4.71 2.94 5.07 9.92 15.71 43 E15a_E16b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER16a ExonRegion 0 5.03 29.74 0.92 0.00 0.00 12.84 2.98 0.00 2.47 4.95 0.00 7.04 8.79 1.73 0.00 2.97 1.65 3.70 9.76 12.50 5.23 10.42 13.95 45 ER16b ExonRegion 0 3.03 18.79 0.00 0.63 4.75 6.71 2.82 2.23 4.71 2.90 0.00 2.90 6.35 0.63 0.64 4.80 1.03 1.46 6.55 11.33 13.54 7.58 4.60 46 E16_Da KnownBoundary 0 0.00 12.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.26 0.00 0.00 0.00 47 E16a_E18a KnownJunction 0 0.00 11.77 0.00 0.00 3.90 2.33 0.00 3.20 1.68 2.66 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 7.52 0.00 0.00 0.00 8.82 17.67 5.63 7.68 48 ER16c ExonRegion 0 0.81 8.98 0.00 0.00 0.00 0.70 0.50 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 3.46 0.00 0.79 0.00 49 E16b_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 I16 Intron 0 1.49 17.26 0.41 0.86 0.98 0.59 1.64 0.43 0.93 0.65 0.08 0.35 0.63 0.09 0.11 0.17 0.19 0.62 1.30 3.44 0.09 0.56 0.33 51 I16_SR1 SilentIntronRegion 0 1.49 17.27 0.41 0.86 0.98 0.59 1.64 0.43 0.93 0.65 0.08 0.35 0.63 0.09 0.11 0.17 0.19 0.62 1.30 3.44 0.09 0.56 0.33 52 E17a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 ER17a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER18a ExonRegion 0 1.24 10.71 0.22 1.91 2.00 5.66 1.99 1.57 2.58 2.32 1.39 3.77 3.50 1.39 0.93 4.93 0.00 4.07 4.33 8.78 12.69 6.69 6.10 55 E18a_E19a KnownJunction 0 3.78 5.79 1.83 1.40 0.00 8.52 2.16 2.55 4.57 3.01 6.79 18.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 2.68 4.94 2.57 4.18 56 ER19a ExonRegion 0 4.34 9.83 3.63 4.68 5.04 6.59 1.84 0.74 4.61 2.64 2.32 4.43 0.83 0.56 0.39 4.25 0.62 1.45 4.21 4.19 5.66 8.83 10.02 57 E19_Ab KnownBoundary 0 3.78 19.54 0.00 6.39 3.14 16.13 0.00 0.00 8.13 4.78 9.42 0.00 0.00 0.00 0.00 7.52 0.00 2.36 0.00 2.62 7.10 7.41 3.84 58 ER19b ExonRegion 0 1.98 13.30 2.81 3.48 2.66 5.90 1.01 1.68 8.64 4.94 4.48 1.31 5.47 0.86 0.75 3.68 2.42 1.78 8.32 5.62 10.16 8.78 14.37 59 E19a_E20a KnownJunction 0 0.00 19.80 4.41 0.00 3.99 13.80 5.70 1.97 13.17 2.69 5.32 0.00 0.00 5.30 0.00 7.35 0.00 4.35 24.75 5.62 14.27 8.39 7.77 60 ER20a ExonRegion 0 0.67 24.00 1.59 1.93 4.68 6.06 2.98 2.46 7.80 5.20 4.87 2.52 3.69 1.54 0.65 6.71 2.10 2.36 9.83 8.40 10.89 9.88 10.65 61 E20a_E21a KnownJunction 0 0.00 43.02 0.00 0.00 3.06 18.28 8.66 1.97 7.38 3.33 10.27 0.00 0.00 0.00 0.00 8.46 0.00 4.85 13.55 6.52 2.84 3.12 19.97 62 ER21a ExonRegion 0 4.65 26.55 1.66 1.30 5.17 5.39 4.19 1.11 6.19 1.38 2.02 0.00 7.26 1.22 0.66 3.65 2.12 2.79 9.32 5.34 7.39 6.36 7.79 63 E21a_E22a KnownJunction 0 7.33 29.86 1.15 0.00 10.10 5.68 0.00 1.60 13.95 4.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 0.00 3.81 8.56 3.13 8.90 6.25 12.46 64 E21b_E22b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 ER21b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 66 ER22a ExonRegion 0 6.35 22.37 2.45 0.00 8.03 3.67 0.26 3.11 11.12 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.16 0.00 3.70 9.56 5.96 6.61 6.25 11.75 67 ER22b ExonRegion 0 7.03 24.02 0.86 0.00 2.62 7.84 4.37 3.67 5.45 2.96 0.00 2.02 0.00 0.00 0.00 3.17 3.74 0.45 11.01 3.29 8.33 5.21 4.37 68 E22a_E23a KnownJunction 0 0.00 28.88 1.39 0.00 3.57 7.10 1.68 2.05 3.59 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 4.42 3.20 9.20 2.63 4.35 69 ER22c ExonRegion 0 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 70 ER23a ExonRegion 0 1.83 10.74 2.53 0.88 4.38 3.96 2.37 1.39 8.60 0.88 0.00 0.00 4.77 0.00 1.77 1.59 1.43 3.15 2.32 0.34 4.09 2.01 1.94