Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC017007.3 Gene 0 0.78 5.01 1.57 10.44 4.29 3.37 7.33 9.49 9.03 4.39 0.71 0.88 2.36 0.00 0.25 1.08 0.41 16.13 1.56 11.49 0.27 0.00 0.00 2 413345 Transcript 0 0.44 2.80 7.77 14.12 2.45 2.15 4.13 15.31 8.36 8.16 0.39 0.48 1.73 0.00 0.15 1.02 0.20 16.03 0.81 7.19 0.14 0.00 0.00 3 IG19 Intergenic 0 0.47 12.72 3.93 18.59 6.54 7.70 17.28 14.66 9.76 5.19 0.56 2.47 8.66 0.02 0.55 1.29 1.54 11.59 1.69 23.44 0.49 0.05 0.28 4 IG19_AR28 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 19.66 4.80 15.81 4.05 1.12 8.75 22.58 20.25 9.15 0.00 1.87 7.01 0.00 0.00 4.69 1.74 21.93 13.40 23.95 1.16 0.00 0.45 5 IG19_SR20 SilentIntergenicRegion 0 0.00 11.48 5.37 22.18 9.92 7.78 17.78 35.89 31.35 16.12 0.00 1.78 5.33 0.00 0.85 1.46 1.97 35.07 6.59 26.01 2.33 0.00 1.04 6 IG19_AR27 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 17.79 5.47 35.17 8.34 6.88 25.56 60.99 50.33 20.45 0.00 2.33 0.00 0.00 2.34 12.06 2.60 51.74 14.40 35.15 1.91 0.00 0.00 7 IG19_AR26 ActiveIntergenicRegion 0 0.53 19.73 4.30 31.08 7.79 6.71 23.44 41.84 34.41 16.87 0.00 0.58 5.58 0.00 1.27 2.89 2.05 15.40 3.63 26.42 0.27 0.00 0.36 8 IG19_AR23 ActiveIntergenicRegion 0 0.24 10.98 5.59 15.72 12.88 2.90 16.78 7.90 5.76 3.62 0.00 1.71 5.04 0.00 0.56 0.34 0.00 3.33 1.09 10.23 0.00 0.00 0.00 9 IG19_AR16 ActiveIntergenicRegion 0 0.63 17.38 2.43 8.08 4.94 2.98 11.58 2.92 2.96 2.24 0.38 2.18 5.16 0.00 0.00 1.03 1.14 1.98 0.54 10.97 0.00 0.00 0.51 10 IG19_SR12 SilentIntergenicRegion 0 0.39 9.39 2.64 11.70 5.99 7.83 16.18 14.06 7.79 3.64 0.57 2.37 8.21 0.03 0.35 0.85 1.47 10.40 1.16 20.75 0.53 0.04 0.15 11 IG19_AR15 ActiveIntergenicRegion 0 0.78 23.08 5.31 23.36 20.26 10.57 29.31 21.66 10.79 3.47 0.36 2.06 18.30 0.00 0.00 1.79 1.22 13.45 2.35 32.89 0.41 0.00 0.00 12 IG19_AR14 ActiveIntergenicRegion 0 1.22 33.95 6.55 33.71 2.68 17.84 28.01 25.66 12.87 5.60 0.00 12.82 24.17 0.00 0.00 2.97 0.00 5.40 3.19 41.08 0.00 0.00 0.00 13 IG19_SR11 SilentIntergenicRegion 0 0.51 15.50 3.96 16.42 7.70 5.49 19.02 15.56 9.02 6.57 0.37 2.49 9.10 0.03 0.55 1.66 1.07 12.05 1.92 31.24 0.13 0.04 0.51 14 IG19_AR13 ActiveIntergenicRegion 0 0.74 14.87 16.54 48.22 17.23 5.68 20.64 32.23 12.90 18.31 0.33 3.15 7.15 0.00 1.73 2.01 3.36 28.54 5.40 43.83 0.37 0.00 0.50 15 IG19_SR10 SilentIntergenicRegion 0 0.28 12.67 4.87 19.28 7.21 5.43 23.23 18.36 11.97 7.46 0.36 3.29 11.85 0.00 0.55 2.14 2.27 21.24 2.71 37.57 0.61 0.10 1.06 16 IG19_AR12 ActiveIntergenicRegion 0 0.26 5.63 0.87 8.81 4.06 2.87 15.36 7.32 5.33 1.94 0.60 3.24 11.64 0.00 0.25 1.11 1.59 7.26 1.94 19.99 0.54 0.00 0.00 17 IG19_SR9 SilentIntergenicRegion 0 0.00 6.83 2.75 13.23 1.88 6.34 20.33 9.89 6.78 4.25 0.45 1.69 8.84 0.00 0.00 5.00 1.54 16.83 0.00 32.42 1.03 0.00 0.00 18 IG19_AR11 ActiveIntergenicRegion 0 0.48 9.25 3.47 15.79 3.47 8.11 24.91 14.39 9.26 5.93 0.44 2.41 20.97 0.00 0.88 3.39 1.46 15.03 5.17 45.00 0.00 0.00 0.00 19 IG19_SR8 SilentIntergenicRegion 0 1.22 17.61 4.28 20.82 12.10 7.56 26.19 11.43 6.91 3.85 0.77 2.58 9.70 0.03 0.88 1.62 1.75 12.71 2.08 28.73 0.56 0.05 0.24 20 IG19_AR10 ActiveIntergenicRegion 0 0.30 10.46 5.08 21.61 5.35 24.10 25.72 12.10 6.53 3.77 0.00 8.66 33.50 0.00 2.90 4.67 0.00 30.62 4.55 39.82 0.00 0.00 2.94 21 IG19_AR9 ActiveIntergenicRegion 0 9.88 31.18 10.05 41.34 32.29 67.85 66.02 23.28 11.53 7.26 0.00 12.99 35.33 0.00 0.58 8.92 0.00 39.30 6.37 42.84 0.00 0.00 2.35 22 IG19_AR8 ActiveIntergenicRegion 0 3.26 18.91 7.21 26.75 15.69 42.11 39.92 16.52 9.84 5.86 1.70 2.31 10.33 0.00 2.90 3.39 2.81 23.77 3.62 36.10 1.67 0.15 0.00 23 IG19_SR7 SilentIntergenicRegion 0 0.67 27.32 4.07 25.69 8.33 17.02 27.36 16.56 14.74 8.33 1.00 4.49 15.06 0.03 1.25 3.01 3.00 25.31 2.15 38.36 1.22 0.20 0.42 24 IG19_SR6 SilentIntergenicRegion 0 0.44 18.50 6.71 29.08 8.67 14.87 20.36 35.50 24.08 13.08 0.73 3.06 13.86 0.04 0.65 1.50 1.21 11.84 1.82 30.65 0.40 0.10 0.18 25 IG19_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 1.51 44.35 24.76 72.97 19.60 23.63 25.83 52.89 30.52 18.04 0.50 1.60 6.92 0.00 1.07 5.58 3.47 68.64 5.85 48.50 0.73 0.00 0.57 26 IG19_SR5 SilentIntergenicRegion 0 0.88 43.35 17.66 70.14 26.39 29.46 30.71 57.15 30.31 19.54 2.15 6.02 13.19 0.00 1.11 4.95 5.29 29.22 10.15 43.94 1.04 0.00 0.76 27 IG19_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 1.16 43.71 10.12 42.08 21.51 18.24 25.80 27.12 16.87 9.71 1.85 4.71 4.79 0.00 2.05 1.68 1.79 27.36 3.25 29.72 1.40 0.00 0.64 28 IG19_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.46 14.74 4.72 30.99 8.17 14.08 22.12 14.68 10.99 5.13 0.89 2.54 10.95 0.03 0.75 1.78 2.37 16.25 1.89 30.08 0.87 0.06 0.38 29 IG19_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 1.09 17.47 4.38 50.99 16.31 9.25 31.38 17.14 13.86 7.80 0.85 5.24 16.61 0.00 0.54 0.94 3.19 15.37 1.15 38.21 1.44 0.00 0.00 30 IG19_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.55 20.00 5.85 27.67 8.13 8.92 23.52 20.76 13.76 6.99 0.66 3.62 12.77 0.03 0.77 1.82 2.04 14.16 2.39 35.31 0.57 0.02 0.42 31 IG19_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 1.80 3.39 0.33 7.34 0.00 8.80 11.19 4.87 1.85 0.25 8.12 5.70 5.55 1.14 0.00 2.53 2.81 12.13 6.42 67.16 13.04 0.00 0.00 32 ER1a ExonRegion 0 0.52 3.51 1.80 4.49 1.32 2.26 4.57 6.98 6.31 2.10 0.48 0.88 0.97 0.00 0.00 0.00 0.81 14.73 2.35 8.40 0.54 0.00 0.00 33 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 27.26 26.34 0.00 0.00 0.00 37.58 10.33 19.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 5.79 9.02 9.36 0.00 0.00 8.21 4.89 4.51 16.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER2a ExonRegion 0 1.22 7.61 1.47 17.83 8.48 5.01 11.78 13.51 13.13 7.13 1.10 1.03 4.05 0.00 0.59 2.22 0.00 19.65 0.90 16.38 0.00 0.00 0.00 36 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 3.22 6.83 33.70 3.74 7.15 1.99 32.61 24.04 13.40 0.00 0.00 6.82 0.00 4.45 4.36 0.00 21.76 0.00 26.14 0.00 0.00 0.00 37 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.07 0.53 7.81 0.00 1.34 0.18 3.17 3.66 4.09 0.00 0.00 1.88 0.00 0.00 1.88 0.00 5.05 0.00 3.97 0.00 0.00 0.00 38 IG18_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 1.85 16.33 10.78 27.56 4.24 9.18 16.91 24.44 21.91 14.02 0.28 1.04 4.14 0.00 1.44 1.13 1.47 22.29 0.93 21.51 0.00 0.00 1.17 39 IG18_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.52 17.36 7.26 32.21 0.20 6.80 13.21 21.88 15.45 9.01 1.51 0.00 2.17 0.00 0.00 2.54 0.24 35.38 0.00 23.14 0.00 0.00 0.00