Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-513G11.3 Gene 0 2.60 2.85 1.57 1.87 1.91 0.77 2.15 1.83 1.72 1.68 1.26 1.14 1.42 0.99 3.19 3.18 3.28 2.66 4.54 2.12 2.76 1.74 2.56 2 429578 Transcript 0 1.74 2.17 1.56 1.88 1.43 0.74 1.59 1.97 1.65 1.58 0.59 0.65 0.65 0.47 1.41 2.45 2.10 2.43 1.93 1.51 1.92 0.93 1.95 3 414120 Transcript 0 1.21 1.11 0.29 0.44 0.73 0.13 0.92 0.19 0.67 0.52 0.89 1.00 0.73 0.64 2.34 1.24 1.43 0.54 1.70 0.89 1.43 0.63 0.89 4 456816 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.71 0.00 0.20 0.46 0.26 5 397644 Transcript 0 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.64 0.00 0.88 0.42 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 3.37 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.07 0.86 0.00 1.04 0.00 8 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25.98 2.81 0.00 0.00 0.00 9 ER1c ExonRegion 0 0.97 1.01 0.00 0.45 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.37 0.25 5.26 2.75 0.00 10 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.42 0.00 2.47 2.94 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 1.76 0.83 0.00 12 ER2b ExonRegion 0 0.82 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.17 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 2.19 0.25 0.00 0.56 4.36 1.04 8.25 0.80 4.20 1.71 0.55 13 E2_Da NovelBoundary 0 10.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 3.12 0.00 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2a_E4c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 0.00 0.00 0.75 1.05 18 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 2.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.27 0.00 3.15 5.45 0.00 19 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.52 0.00 3.50 1.99 0.00 21 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E4a_E4c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 0.00 23 ER4b ExonRegion 0 1.99 2.23 0.58 0.47 1.47 0.27 1.83 0.37 0.58 0.69 1.78 1.26 1.46 1.29 4.68 2.49 2.86 1.09 3.40 1.78 2.87 1.26 1.78 24 E4_Ab KnownBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E4_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER4c ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.00 0.00 27 ER4d ExonRegion 0 2.65 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 0.00 1.72 0.00 0.00 28 E4_Db KnownBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E4b_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER4e ExonRegion 0 3.15 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.07 0.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E4_Dc KnownBoundary 0 3.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E4c_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E4_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER4f ExonRegion 0 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER4g ExonRegion 0 0.44 0.00 0.00 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 0.35 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER5a ExonRegion 0 6.97 8.69 6.23 7.51 5.72 2.97 6.35 7.88 6.59 6.32 2.34 2.62 2.60 1.87 5.64 9.78 8.39 9.71 7.73 6.02 4.58 3.73 7.80 37 E5_Da NovelBoundary 0 501.20 282.78 123.21 139.68 396.10 229.13 363.33 193.50 112.33 115.13 52.86 21.01 44.96 45.85 47.72 142.61 146.05 81.17 183.63 195.08 77.22 139.67 150.67 38 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 2.12 0.00 0.59 1.39 0.78