Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-85M11.1 Gene 0 0.17 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.05 0.20 0.21 0.22 0.91 0.08 0.27 0.08 0.35 2.04 0.06 0.00 0.16 2 470138 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 3 498616 Transcript 0 0.00 1.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 7.57 0.00 0.00 0.00 4 494915 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 496693 Transcript 0 0.12 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.15 0.15 0.59 0.06 0.13 0.05 0.12 0.57 0.04 0.00 0.11 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 1.79 0.00 0.00 0.00 8 ER1c ExonRegion 0 0.00 1.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.92 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 2.56 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.17 0.00 0.00 0.00 16 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E4a_E5b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5c ExonRegion 0 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.38 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 23 E5b_E6a KnownJunction 0 0.00 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E5b_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E6_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 17.95 0.00 0.00 0.00 10.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60.53 0.00 0.00 0.00 26 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.71 0.00 0.00 0.00 27 E6_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 18.42 0.00 0.00 0.00 6.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51.26 0.00 0.00 0.00 28 I6_SR1 SilentIntronRegion 0 1.36 0.07 34.53 0.20 0.00 0.45 8.32 0.08 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 76.89 0.00 0.00 0.00 29 I6_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.29 0.64 28.68 0.00 0.00 0.00 8.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71.86 0.00 0.00 0.00 30 I6_SR2 SilentIntronRegion 0 0.79 3.61 28.80 0.00 0.00 0.00 8.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 88.59 0.00 0.00 0.00 31 I6_AR2 ActiveIntronRegion 0 4.44 0.00 25.41 0.00 0.00 0.00 10.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 106.38 0.00 0.00 0.00 32 I6_AR3 ActiveIntronRegion 0 4.23 0.00 23.28 0.00 0.00 0.00 14.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 105.74 0.00 0.00 0.00 33 I6_AR4 ActiveIntronRegion 0 1.73 0.00 24.95 0.00 0.00 0.00 12.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 90.14 0.00 0.00 0.00 34 I6_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.46 1.34 21.24 0.00 0.00 0.00 6.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67.40 0.00 0.00 0.00 35 I6_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.90 18.42 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48.27 0.00 0.00 0.00 36 I6_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.60 1.17 14.40 0.00 0.00 0.70 2.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58.30 0.00 0.00 0.00 37 I6_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.91 0.00 8.96 0.00 0.00 0.00 4.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53.63 0.00 0.00 0.00 38 I6_SR3 SilentIntronRegion 0 0.14 0.70 12.19 0.07 0.00 0.06 2.62 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48.89 0.00 0.00 0.00 39 I6_AR9 ActiveIntronRegion 0 0.98 0.85 6.08 0.00 0.00 3.40 5.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 117.66 0.00 0.00 0.00 40 I6_SR4 SilentIntronRegion 0 0.00 0.19 3.58 0.00 0.00 0.00 1.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39.31 0.00 0.00 0.00 41 I6_AR10 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 6.52 0.00 0.00 0.00 2.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 75.50 0.00 0.00 0.00 42 I6_SR5 SilentIntronRegion 0 0.18 0.09 2.39 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.16 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43.53 0.00 0.00 0.00 43 I6_SR6 SilentIntronRegion 0 0.31 0.00 2.27 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.97 0.00 0.00 0.00 44 I6_SR8 SilentIntronRegion 0 0.51 0.18 4.56 0.00 0.00 0.07 2.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30.26 0.00 0.00 0.00 45 I6_AR14 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.18 2.42 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45.29 0.00 0.00 0.00 46 E7_Aa NovelBoundary 0 6.59 28.74 47.63 41.29 36.42 22.03 20.49 30.48 36.37 30.97 0.00 6.30 0.00 2.47 0.00 4.10 13.56 25.70 13.37 20.71 9.02 8.33 0.00 47 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.50 0.00 0.00 0.00 48 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 50 E8b_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58 ER12a ExonRegion 0 1.33 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 1.62 1.68 6.52 0.62 1.39 0.58 1.34 1.79 0.46 0.00 1.23