Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	RP11-385J1.1	Gene	0	0.38	0.74	0.22	3.00	1.53	0.88	8.54	0.23	1.05	0.72	0.64	4.40	1.28	1.44	1.16	0.72	0.90	0.80	0.38	0.96	0.27	0.25	0.27
2	425330	Transcript	0	0.00	0.04	0.54	1.53	0.66	1.47	5.59	0.83	0.13	1.02	0.00	2.57	0.01	1.39	0.85	0.32	0.00	0.49	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00
3	437488	Transcript	0	0.11	0.11	0.00	0.76	1.89	0.10	1.49	0.00	0.18	0.00	0.08	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00
4	451742	Transcript	0	0.12	0.60	0.00	1.82	0.16	0.22	2.20	0.15	0.33	0.30	0.11	1.48	1.59	0.55	0.24	0.18	0.85	0.32	0.00	0.50	0.13	0.12	0.00
5	432385	Transcript	0	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.43	0.00	0.00	4.35	0.00	0.58	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	421498	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.59	0.77	0.00	0.43	0.00	0.00	1.27	0.00	0.10	0.00	0.32	0.00	0.13	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.37	1.98	3.09	1.25	2.50	0.00	0.00	0.00	2.97	0.00	1.08	1.93	0.00	0.00	1.47	0.00	3.55	0.00	0.00	0.00
8	E1_Ab	KnownBoundary	0	7.04	0.00	6.27	5.79	0.00	0.00	0.00	4.68	6.66	4.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.59	0.00	2.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.09	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.73	2.68	1.83	0.00	3.46	0.00	0.00	0.00	4.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	4.26	0.00	0.00	0.00
11	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.31	3.94	0.27	17.31	2.14	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	2.37	0.00	0.00	2.25	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00
12	E1_Da	NovelBoundary	0	20.74	21.71	25.66	32.60	12.48	5.51	8.30	19.02	31.19	33.12	4.90	0.00	0.00	0.00	5.19	12.30	8.88	89.54	0.00	18.54	11.80	5.63	0.00
13	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	10.95	0.00	47.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.90	3.54	0.00	15.30	0.00	0.78	0.65	0.00	0.00	2.66	0.22	7.14	1.37	0.00	1.07	1.89	1.58	0.86	0.00	0.75
16	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.96	4.07	0.00	0.00	0.00	1.77	1.67	0.00	0.00	0.00	2.35	4.45	7.86	0.00	0.00	9.60	6.39	3.15	0.00	4.18
17	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.87	0.00	0.67	1.45	0.00	3.43	0.00	0.59	0.64	0.00	0.00	0.00	0.85	1.19	3.31	2.76	1.85	3.03	1.64	0.79	0.00	1.54
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	3.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2a_E5b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.71	0.00	3.43	3.79	0.00	3.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.28	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00
21	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E3a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	4.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER4b	ExonRegion	0	1.53	0.00	0.66	0.06	0.00	0.04	6.23	0.00	0.75	0.00	0.70	1.29	0.00	0.59	0.74	1.16	0.12	0.00	1.15	0.77	0.00	0.75	0.10
25	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E4a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.55	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	1.23	1.97	0.00	4.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER6a	ExonRegion	0	1.70	0.85	0.51	10.88	2.74	2.17	27.06	0.00	4.61	0.63	3.18	30.37	1.59	5.01	3.22	1.80	4.34	1.82	0.00	1.01	1.77	0.61	2.24
31	E6_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.60	21.81	3.74	0.00	49.02	0.00	6.28	3.17	9.11	18.31	6.01	2.41	6.06	4.36	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	2.03	0.00	0.00	2.08	0.00	1.79	0.00	2.68	0.00	6.17	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.56	0.00	2.76	0.00
33	ER6b	ExonRegion	0	0.00	1.56	0.44	11.09	7.36	5.73	23.19	0.00	3.38	3.75	3.50	3.45	0.44	5.91	0.82	2.46	2.89	3.29	0.00	0.96	0.00	0.00	0.00
34	E6_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.74	4.02	0.00	3.15	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	0.00	4.27	0.00	3.48	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00
35	E6b_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	7.13	0.00	8.12	15.41	0.00	0.00	4.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER6c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.77	1.87	0.00	1.28	0.00	0.00	3.81	0.00	0.31	0.00	0.97	0.00	0.38	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00
37	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	4.55	1.66	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00	0.00	0.00	37.81	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER7a	ExonRegion	0	0.00	2.36	0.00	5.52	2.45	1.54	10.62	0.00	1.22	2.45	0.73	0.00	4.35	1.01	0.64	0.51	2.01	0.61	0.00	1.79	0.00	0.36	0.00
39	E7_Da	KnownBoundary	0	0.00	2.50	0.00	2.06	0.00	2.84	24.16	0.00	1.79	4.35	0.00	0.00	0.00	4.89	4.45	3.67	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00
40	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	3.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E7a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	E7a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	9.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER7b	ExonRegion	0	0.00	0.12	1.62	2.22	0.00	1.32	15.51	0.00	0.39	3.05	0.00	4.74	0.04	3.09	0.61	0.96	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00
44	E7_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.66	5.76	0.00	0.00	37.98	0.00	4.40	4.43	0.00	24.76	0.00	4.89	0.00	0.00	4.68	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00
45	E8_Aa	NovelBoundary	0	32.45	80.91	483.04	514.59	29.71	18.80	76.05	431.65	483.27	350.28	19.11	6.15	12.82	12.24	44.26	56.57	27.30	296.47	26.64	54.65	27.24	5.27	24.07
46	ER8a	ExonRegion	0	0.62	3.00	0.00	5.66	0.79	1.08	9.34	0.76	1.63	1.51	0.57	7.38	7.97	1.92	1.21	0.88	0.97	1.62	0.00	2.52	0.65	0.61	0.00
47	E8_Da	NovelBoundary	0	201.07	257.26	503.83	657.09	201.70	99.60	387.62	475.10	504.91	488.32	44.85	55.82	41.88	7.30	37.46	143.72	159.05	417.15	177.61	244.10	101.13	43.97	89.80
48	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	6.62	0.00	0.00	0.00	0.35	16.14	0.43	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	6.05	0.00	0.00	0.00	1.93	19.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	E9_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.80	0.00	1.74	0.00	0.00	13.05	0.00	2.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.86	0.00	0.00	8.70	0.00	1.16	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.55	0.93	0.59	1.23	0.35	1.11	2.81	0.00	1.33	0.00	0.50	14.48	0.00	1.31	0.36	0.64	1.40	0.81	1.24	1.01	0.00	0.27	1.02
53	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	0.08	3.23	0.32	1.30	1.07	0.72	13.26	0.00	1.37	0.00	0.74	0.82	0.17	0.00	1.06	0.27	0.00	2.56
54	Ix_SR5	SilentIntronRegion	0	1.35	0.61	0.31	1.47	1.71	0.85	4.44	0.22	1.22	0.56	0.66	20.51	3.39	2.22	2.76	0.88	0.98	0.19	0.81	1.48	0.00	0.00	0.60
55	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	1.87	0.00	0.95	0.00	0.96	3.58	0.00	2.18	0.79	0.00	15.81	0.00	0.42	0.80	0.92	1.47	0.46	0.52	0.66	0.69	0.00	2.81
56	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.62	0.46	1.44	0.00	0.19	4.03	0.00	0.47	0.43	0.00	16.50	0.20	0.66	0.31	0.00	0.67	0.14	0.00	0.65	0.00	0.00	0.89
57	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.59	1.03	1.00	0.59	0.79	2.09	0.00	1.20	0.38	0.10	19.11	0.04	1.18	0.51	1.37	1.16	0.18	0.35	1.28	0.20	0.06	1.89
58	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.50	0.00	0.40	0.96	0.00	0.34	0.00	0.00	22.27	0.00	2.50	0.00	0.00	0.72	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53
59	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.19	0.35	0.71	0.07	0.81	1.66	0.00	0.37	0.23	0.34	23.22	0.00	2.01	0.19	1.21	1.26	0.16	0.17	1.33	0.18	0.00	1.16
60	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.23	0.42	0.00	0.00	0.83	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	33.62	0.00	3.37	0.00	0.99	0.28	0.10	0.72	1.66	0.00	0.00	0.00
61	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.21	0.09	0.42	0.00	0.28	1.15	0.00	0.38	0.26	0.20	29.58	0.10	2.36	0.58	0.53	1.01	0.14	0.16	0.71	0.11	0.00	0.45
62	ER10a	ExonRegion	0	0.73	0.76	0.00	0.76	2.54	0.69	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
63	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
64	ER11a	ExonRegion	0	0.05	0.00	0.00	1.11	0.73	0.00	2.31	0.00	0.50	0.00	0.53	0.00	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
66	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	3.42	0.00	0.00	4.32	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00