Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 UTS2D Gene 0 0.70 0.81 0.41 0.62 0.96 1.26 0.46 0.58 1.41 0.41 6.09 2.18 1.55 1.04 1.84 0.31 0.09 0.21 0.63 0.71 1.63 0.80 0.31 2 340524 Transcript 0 1.28 1.06 0.48 0.37 1.55 3.53 0.56 0.45 0.48 0.55 3.24 0.77 0.79 1.51 1.43 0.20 0.13 0.00 0.12 0.83 3.47 0.62 2.40 3 432514 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.00 0.86 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 490825 Transcript 0 0.23 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.15 0.15 0.31 0.00 0.00 2.93 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 5 464814 Transcript 0 0.32 0.30 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.39 0.42 0.51 3.59 2.13 0.00 1.40 1.35 0.44 0.00 0.82 1.54 0.64 0.66 0.62 0.44 6 463450 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 427544 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.35 0.00 0.00 0.93 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 440476 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 425357 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 446788 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 ER1a ExonRegion 0 3.08 1.62 0.00 0.00 3.09 3.61 0.58 0.00 0.00 0.84 1.54 0.00 0.00 1.07 1.63 0.42 0.00 0.00 0.00 0.73 6.40 1.37 2.94 12 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 7.81 6.98 3.89 0.00 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.33 0.00 0.00 0.00 3.26 5.07 2.51 8.28 13 ER1b ExonRegion 0 0.29 0.00 0.00 0.00 1.27 0.84 1.66 0.00 0.15 0.56 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 4.68 0.00 0.00 0.00 1.05 3.03 2.51 1.89 14 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.94 6.25 0.00 15 E2_Aa NovelBoundary 0 6.96 20.33 18.69 19.31 7.05 16.35 9.85 12.40 28.88 21.38 352.88 18.16 33.76 337.93 322.27 99.20 204.77 35.24 8.38 30.62 39.91 36.19 33.80 16 ER2a ExonRegion 0 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2_Da NovelBoundary 0 3.33 3.35 1.21 0.00 0.00 10.51 2.25 1.73 6.22 4.89 11.79 0.00 7.63 39.03 42.40 0.00 53.39 12.93 0.00 5.62 23.35 5.39 20.32 18 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3_Aa NovelBoundary 0 6.82 2.76 2.84 0.00 0.00 8.01 1.81 0.00 6.22 4.62 30.43 0.00 0.00 42.38 80.60 23.50 17.67 28.19 9.60 11.51 8.28 19.35 11.01 20 ER3a ExonRegion 0 0.32 0.30 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.39 0.42 0.51 3.59 2.13 0.00 1.40 1.35 0.44 0.00 0.82 1.54 0.64 0.66 0.62 0.44 21 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.86 0.00 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.62 1.66 0.00 0.81 0.56 0.00 0.78 1.38 0.52 1.51 6.73 0.00 0.35 0.88 0.00 0.00 0.00 2.67 0.72 0.00 0.00 0.00 23 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.20 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 6.74 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 1.84 3.81 1.60 0.00 25 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 2.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.76 0.00 26 E4b_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 27 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 1.46 0.00 0.00 2.89 0.00 1.26 0.32 0.00 0.00 0.00 2.60 0.00 1.22 1.08 0.00 28 ER5a ExonRegion 0 0.48 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.60 0.58 1.24 0.00 0.00 5.43 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 29 E5_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 31.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 30 E6_Aa NovelBoundary 0 3.41 5.59 12.18 7.82 18.17 9.65 16.74 10.39 14.15 2.47 2.16 5.85 0.00 2.12 5.32 29.65 16.08 10.90 25.41 25.82 13.90 7.78 27.06 31 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.47 0.59 0.47 1.23 1.26 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 1.37 0.00 0.00 1.27 1.42 0.98 4.01 0.00 0.00 32 E6_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER6b ExonRegion 0 1.19 0.45 0.81 0.57 0.75 2.49 0.74 1.44 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 1.19 5.91 0.05 0.00 34 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.42 0.00 0.00 35 E6a_E9c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.39 0.39 0.05 0.00 1.51 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.53 0.00 1.96 37 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 E7a_E9c KnownJunction 0 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 3.76 39 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 0.00 0.17 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 E8a_E9c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.35 0.00 0.00 0.93 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E9_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E9_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 E9_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER9b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.14 0.08 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.12 0.16 46 ER9c ExonRegion 0 0.00 0.00 1.63 1.36 0.00 7.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 3.47 2.94 47 ER9d ExonRegion 0 0.00 0.87 1.60 2.70 0.00 1.95 0.00 0.00 0.96 0.00 2.01 0.00 0.00 2.45 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 5.87 0.54 48 E9_Ae KnownBoundary 0 0.00 3.35 2.42 3.66 0.00 0.00 0.00 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.76 0.00 49 ER9e ExonRegion 0 1.24 1.01 1.00 0.98 2.35 4.61 0.78 0.31 3.58 0.49 1.13 0.00 0.27 2.37 3.75 0.87 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 3.69 0.00 50 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.73 0.00 2.55 3.12 0.00 0.00 0.00 6.66 0.00 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 51 ER10a ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 2.50 0.00 2.67 2.47 0.00 0.00 0.00 4.69 0.00 5.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 3.03 0.00 52 ER10b ExonRegion 0 1.83 1.43 0.00 0.96 1.85 1.90 0.77 2.04 3.13 0.86 4.24 0.00 3.36 0.15 1.55 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 3.91 3.50 0.00 53 E10b_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 E10b_E12a KnownJunction 0 6.52 0.00 0.00 1.50 0.00 2.84 0.00 0.00 1.79 1.10 1.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 55 E10b_E13a KnownJunction 0 0.00 3.35 0.00 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 2.39 0.00 56 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 ER12a ExonRegion 0 1.45 0.00 0.00 0.50 0.00 1.54 0.00 0.00 2.73 0.30 1.17 0.23 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.49 0.00 58 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 0.00 59 E13_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 0.00 0.00 2.55 0.00 1.67 68.02 6.30 19.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 ER13a ExonRegion 0 1.15 1.47 1.98 0.65 2.65 4.60 0.00 0.86 4.64 0.32 52.46 4.61 9.43 3.37 4.10 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 2.91 1.88 0.00 61 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 E13a_E15a KnownJunction 0 0.00 2.50 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 2.46 7.00 1.53 23.01 24.61 13.64 2.41 9.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.25 0.00 0.00 63 ER14a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.51 1.74 1.52 0.14 0.00 0.00 1.80 0.00 7.71 3.27 1.13 1.09 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 64 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 0.00 0.00 1.10 0.00 10.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 E15_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 12.32 0.00 6.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 66 ER15a ExonRegion 0 0.87 0.19 0.67 0.40 0.00 5.03 0.59 0.48 4.49 2.17 33.21 8.49 15.54 0.15 1.99 0.79 0.00 0.00 0.85 0.00 4.97 2.50 0.00 67 E15_Da KnownBoundary 0 6.22 0.00 1.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 23.53 0.00 0.00 0.00 6.30 4.36 0.00 0.00 4.80 0.00 5.37 3.12 0.00 68 E15_Db KnownBoundary 0 13.34 20.72 51.51 69.79 7.05 12.72 2.03 73.11 66.64 40.19 8.74 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 51.90 0.00 19.05 8.46 0.00 0.00 69 ER15b ExonRegion 0 0.74 4.77 1.23 0.00 0.00 0.32 0.75 0.00 2.69 1.05 17.82 0.75 2.85 0.00 5.05 2.97 0.00 1.12 3.19 1.76 1.05 2.45 0.00 70 ER15c ExonRegion 0 3.51 3.24 0.48 0.84 2.22 2.28 0.45 0.00 1.02 0.54 14.98 4.44 1.14 1.36 0.99 0.00 0.00 1.70 2.64 1.44 1.72 0.86 1.22 71 E15_Dc KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.16 0.00 0.00 0.00 3.97 7.85 4.34 0.00 20.22 0.00 6.01 0.00 0.00 0.00 4.39 0.00 0.00 0.00 2.29 0.00 0.00 72 ER15d ExonRegion 0 1.31 1.38 0.25 1.21 0.00 0.00 0.45 0.00 1.13 0.00 12.43 1.30 3.81 3.08 5.16 1.01 0.00 0.00 1.08 0.00 1.87 0.64 0.00 73 E15_Dd KnownBoundary 0 2.96 0.00 6.65 22.31 0.00 2.67 2.03 6.94 12.82 4.57 22.90 11.85 6.49 0.00 0.00 0.00 0.00 11.77 0.00 0.00 5.93 0.00 0.00 74 ER15e ExonRegion 0 0.76 1.55 0.00 1.10 1.57 1.18 1.09 1.35 1.43 0.81 8.19 2.32 2.37 1.00 2.67 0.17 0.39 0.00 0.37 1.75 0.85 0.50 0.51