Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-443P15.1 Gene 0 1.32 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.05 0.05 0.00 0.00 0.08 5.77 0.00 0.10 0.05 2.89 0.13 0.00 0.00 0.00 0.77 5.30 5.71 2 423298 Transcript 0 0.70 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.02 0.04 0.00 0.00 0.00 3.11 0.00 0.04 0.00 1.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 2.54 2.23 3 422108 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 436375 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 416764 Transcript 0 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.11 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 2.51 1.56 6 445507 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 1.84 7 306399 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 441600 Transcript 0 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.52 0.00 0.00 0.39 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 2.74 2.90 9 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 10 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 11 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.17 0.00 12 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.17 0.00 13 ER1e ExonRegion 0 3.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.95 0.00 0.00 0.00 0.00 2.92 5.58 13.00 14 E1_Af KnownBoundary 0 2.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.35 0.00 0.00 0.00 0.00 2.72 2.69 0.00 15 ER1f ExonRegion 0 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 6.68 2.33 16 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.27 4.35 17 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 6.41 0.06 0.00 0.00 0.00 0.77 4.39 8.67 19 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 20 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 2.33 4.10 21 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 22 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E2c_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER3a ExonRegion 0 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 3.79 0.00 0.00 0.00 6.02 0.73 0.00 0.00 0.00 1.37 1.63 7.58 26 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.60 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E3_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 3.59 30 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 1.84 31 E3_Dc NovelBoundary 0 7.04 0.00 0.00 0.00 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.54 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 7.72 16.99 32 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.01 8.63 33 E4_Da KnownBoundary 0 3.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.40 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 16.48 34 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.92 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 4.19 4.24 35 E4_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E4b_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER4c ExonRegion 0 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.72 0.00 0.34 0.00 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 7.52 4.68 38 E4_Dc NovelBoundary 0 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.70 3.41 39 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 14.06 0.00 0.00 0.00 4.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.04 1.71 40 E5_Aa NovelBoundary 0 3.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 6.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.96 7.09 41 ER5a ExonRegion 0 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.04 0.00 0.00 0.79 0.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 5.48 5.80 42 E5_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.60 0.00 0.00 0.00 3.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.51 15.54 43 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER6a ExonRegion 0 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E6_Da KnownBoundary 0 3.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 E6_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 ER6b ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 ER6c ExonRegion 0 2.10 0.00 0.00 0.00 0.53 0.00 0.07 0.13 0.00 0.00 0.00 9.34 0.00 0.11 0.00 3.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 7.21 6.68 49 IG41_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 4.14 0.64 2.00 1.91 13.19 2.01 4.56 4.84 5.61 4.28 0.00 1.67 0.67 0.42 2.58 1.63 6.45 5.60 3.24 5.82 8.10 10.59 8.27