Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 FGF12 Gene 0 1.04 4.71 5.03 1.53 1.49 3.75 0.86 2.46 13.04 5.55 0.20 1.21 0.00 0.06 0.13 0.03 0.00 1.21 0.03 2.85 0.05 0.57 0.43 2 450716 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 445105 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 491636 Transcript 0 0.00 3.12 1.21 0.44 0.00 0.00 0.45 0.07 3.21 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.54 3.63 0.00 0.00 0.00 5 466144 Transcript 0 0.00 1.19 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.22 1.49 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 6 448795 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 418610 Transcript 0 0.00 0.66 1.20 0.00 0.00 0.05 0.00 0.02 1.09 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.02 0.00 1.28 0.00 0.00 0.00 8 430714 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 264730 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 454309 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 392454 Transcript 0 0.67 3.07 2.03 0.76 1.74 0.78 0.00 0.29 5.46 1.65 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 0.35 0.00 0.00 0.31 12 440901 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E1a_E2f KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER2b ExonRegion 0 0.00 2.30 1.73 0.00 1.28 13.16 0.00 0.38 1.07 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.01 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 17 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 3.35 1.66 0.00 4.33 22.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 18 E2_Ad KnownBoundary 0 0.00 16.31 6.68 0.00 0.00 31.74 0.00 2.30 6.48 6.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.17 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 19 ER2c ExonRegion 0 0.00 10.17 4.90 0.00 4.35 35.53 0.00 1.84 6.25 4.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.81 0.00 4.92 0.00 0.00 0.00 20 ER2d ExonRegion 0 0.00 9.92 4.90 0.00 4.07 29.71 0.00 3.46 14.08 4.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.39 0.00 5.02 0.00 0.00 0.00 21 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E2a_E2f KnownJunction 0 0.00 3.16 2.66 0.00 0.00 7.15 0.00 2.55 17.97 2.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E2a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER2e ExonRegion 0 0.00 4.07 3.60 0.00 2.68 10.32 0.00 3.46 15.90 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.73 0.00 3.06 0.00 0.00 0.00 25 ER2f ExonRegion 0 0.00 0.66 1.20 0.00 0.00 0.05 0.00 0.02 1.09 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.02 0.00 1.28 0.00 0.00 0.00 26 E2_Af KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER2g ExonRegion 0 0.00 1.00 9.36 2.45 0.00 1.74 0.95 2.98 20.31 5.42 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 0.00 5.93 0.00 7.36 0.00 0.00 0.00 28 E2_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.93 1.70 0.00 0.00 0.00 1.77 5.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E2b_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 3.84 3.03 0.00 0.00 0.00 1.56 21.56 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.79 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 31 E2b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER2h ExonRegion 0 0.00 3.12 1.21 0.44 0.00 0.00 0.45 0.07 3.21 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.54 3.63 0.00 0.00 0.00 33 ER3a ExonRegion 0 0.00 2.38 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.43 1.34 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 3.91 0.00 0.00 0.00 34 ER4a ExonRegion 0 0.21 0.71 0.91 0.41 0.64 1.37 0.33 0.26 1.74 1.29 0.87 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.22 0.10 0.00 35 E4a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.92 1.02 2.01 0.46 0.00 0.86 4.94 2.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.31 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 38 ER6b ExonRegion 0 3.33 2.53 6.43 2.97 2.70 13.24 0.30 1.27 24.78 10.59 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.52 0.00 4.78 0.00 0.97 0.19 39 E6a_E7a KnownJunction 0 3.63 3.35 15.79 4.73 0.00 13.12 2.25 4.81 28.18 14.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.77 0.00 3.26 0.00 0.00 3.24 40 ER7a ExonRegion 0 4.64 11.30 10.14 4.08 2.83 2.19 1.64 4.49 28.81 12.85 0.00 5.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 0.00 2.74 0.00 1.58 2.68 41 E7a_E9a KnownJunction 0 7.26 9.01 13.96 0.00 3.65 0.00 0.00 6.28 41.90 10.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 42 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER9a ExonRegion 0 2.75 13.80 17.72 3.05 6.62 2.60 2.49 7.16 35.86 14.56 0.00 0.93 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 1.67 0.00 4.48 0.00 2.60 3.22 45 E9_Da KnownBoundary 0 7.48 20.92 10.44 5.46 8.23 9.31 2.25 18.98 33.13 6.88 0.00 12.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.15 0.00 8.25 0.00 2.45 0.00 46 ER9b ExonRegion 0 2.10 8.82 20.16 4.76 5.38 6.54 3.41 13.06 30.45 15.53 0.00 8.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.05 0.00 5.06 0.00 2.18 0.33 47 E9b_E10a KnownJunction 0 7.26 5.92 30.25 10.75 8.06 0.00 4.37 19.76 30.21 29.25 0.00 6.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.01 0.00 15.15 0.00 0.00 3.67 48 ER10a ExonRegion 0 5.85 7.84 23.05 11.50 3.42 1.67 3.06 14.39 35.24 26.08 0.00 2.42 0.00 0.38 1.54 0.00 0.00 3.51 0.00 13.30 0.00 2.70 3.89 49 E10_Da KnownBoundary 0 0.00 14.93 25.25 6.59 4.07 2.38 8.35 6.94 30.73 18.08 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 4.52 0.00 8.63 0.00 2.69 0.00 50 ER10b ExonRegion 0 2.94 12.65 21.00 9.48 1.86 5.14 2.92 12.94 26.98 16.01 1.37 4.81 0.00 1.47 0.00 2.11 0.00 6.52 0.00 10.17 0.00 1.88 0.00 51 E10_Db KnownBoundary 0 10.89 6.31 13.36 8.22 4.33 5.79 0.00 13.92 17.13 11.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 8.95 0.00 0.00 0.00 52 E10_Dc KnownBoundary 0 0.00 0.00 8.22 7.72 0.00 2.84 0.00 4.35 16.23 14.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 53 ER10c ExonRegion 0 6.35 4.47 16.67 11.45 2.68 9.17 0.00 14.17 25.81 21.45 0.00 1.73 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 3.70 0.00 8.72 0.00 0.00 0.00 54 ER10d ExonRegion 0 3.27 9.90 5.29 3.32 1.89 5.39 2.71 3.25 24.67 12.17 0.00 1.95 0.00 0.36 0.28 0.00 0.00 1.14 0.00 3.51 0.00 0.28 0.79 55 E10_Dd KnownBoundary 0 0.00 6.71 1.30 0.00 0.00 0.00 9.80 7.72 17.88 10.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 ER10e ExonRegion 0 0.79 5.12 5.46 1.01 1.73 4.90 1.04 3.73 17.79 6.85 0.00 1.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 2.54 0.00 1.11 0.41 57 E10_De KnownBoundary 0 0.00 5.92 5.59 2.03 3.31 0.00 0.00 0.00 10.85 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 0.00 9.46 0.00 3.12 0.00 58 ER10f ExonRegion 0 0.96 8.23 8.30 1.93 2.22 7.84 0.30 2.04 19.96 6.18 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 4.93 0.00 0.61 0.66 59 E10_Df KnownBoundary 0 0.00 5.66 3.40 0.00 8.66 10.45 0.00 0.00 6.45 9.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 ER10g ExonRegion 0 2.00 9.22 5.17 1.27 3.20 1.87 0.00 0.00 11.43 2.94 0.00 2.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 61 IG50_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 0.38 5.18 4.82 1.23 1.35 4.08 0.24 0.41 15.64 4.15 0.00 1.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 1.20 0.00 0.38 0.00 62 IG50_SR5 SilentIntergenicRegion 0 0.00 11.25 3.51 3.45 0.00 5.50 0.00 3.46 20.42 11.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 2.15 63 IG50_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 9.26 3.68 4.32 0.00 2.65 0.00 3.46 21.34 8.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 2.94 64 IG50_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.00 3.89 6.27 4.63 3.82 0.94 0.00 5.33 18.56 7.11 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.61 0.00 0.95 1.26