Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 CTD-2049J23.2 Gene 0 0.47 0.65 1.34 1.01 0.44 1.14 1.46 0.85 1.65 1.06 0.59 1.08 0.89 0.73 1.05 0.82 0.55 1.77 0.66 0.91 0.61 0.55 1.50 2 486168 Transcript 0 0.00 0.11 0.00 1.11 0.00 0.98 0.51 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.17 0.32 0.00 0.54 1.24 3 497452 Transcript 0 0.51 0.54 0.32 0.00 0.62 1.18 1.99 0.01 0.78 0.03 0.28 0.90 0.87 0.81 1.03 0.68 0.24 0.12 0.35 0.53 0.41 0.26 0.79 4 462431 Transcript 0 0.65 0.48 3.23 2.26 0.31 0.78 1.22 2.17 3.10 2.50 0.92 2.06 1.18 0.48 1.31 1.14 1.01 4.66 1.25 1.55 0.85 0.57 1.92 5 IG45 Intergenic 0 0.00 0.43 1.17 0.65 0.29 2.15 0.57 0.82 0.39 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.20 0.00 1.14 1.65 1.56 13.16 6 IG45_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.96 0.00 0.00 3.55 0.00 1.16 0.00 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 0.73 0.00 0.00 3.12 1.32 11.45 7 IG45_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.52 1.22 0.78 0.34 1.88 0.68 0.76 0.47 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.09 0.00 1.37 1.36 1.61 13.57 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.66 0.00 1.99 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 2.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.03 0.72 0.00 2.03 5.72 9 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 5.79 1.83 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 6.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 2.88 0.00 0.00 12.55 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 4.66 0.00 5.31 3.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 1.21 1.70 12 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 I2_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 2.86 3.69 17.83 2.54 1.39 2.50 2.18 0.51 3.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.89 3.30 0.00 0.87 5.59 14 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 15 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.01 1.19 0.46 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 1.30 17 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER5a ExonRegion 0 0.00 2.27 0.00 0.00 1.00 0.98 1.97 0.00 1.30 0.00 0.00 2.65 2.88 4.27 4.57 2.21 0.00 0.00 1.19 0.79 0.00 0.75 0.00 21 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 2.11 23 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E7a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER8a ExonRegion 0 5.18 3.12 25.82 18.10 2.47 6.21 9.76 17.40 23.75 19.98 3.56 5.95 9.41 3.22 8.79 9.13 8.11 37.23 8.85 12.43 6.77 2.57 15.34 27 E8_Da NovelBoundary 0 2.74 15.72 14.34 23.61 8.66 0.00 17.09 19.80 11.86 6.61 0.00 7.35 0.00 0.00 5.93 4.36 0.00 25.37 8.09 6.39 0.00 0.00 3.24 28 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER9a ExonRegion 0 0.01 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 0.24 2.94 0.02 0.63 0.47 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 1.31 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.03 32 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER11a ExonRegion 0 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 2.03 0.47 0.00 0.01 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.03 0.77 0.73 1.01 34 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 E11a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E12_Aa NovelBoundary 0 129.06 158.13 112.53 108.24 142.19 93.92 89.34 94.22 87.35 91.55 86.23 19.66 85.06 54.56 64.03 182.69 152.88 123.28 143.72 144.07 63.94 36.99 173.20 37 ER12a ExonRegion 0 9.16 6.58 0.00 0.00 10.16 15.92 33.76 0.00 0.03 0.02 1.05 2.35 9.88 6.20 10.93 9.68 1.69 2.01 5.18 8.04 5.98 2.26 9.56 38 E12_Da NovelBoundary 0 116.69 100.05 102.66 92.83 136.16 80.81 167.73 94.72 104.92 80.24 7.48 5.70 19.80 15.83 57.61 55.88 116.04 140.40 75.67 127.07 68.26 17.15 94.92 39 E12a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.74 0.00 41 ER14a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 3.30 0.32 1.51 0.69 0.00 0.01 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 42 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E15_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.90 13.05 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER15a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 1.43 10.54 2.72 1.95 1.64 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER16a ExonRegion 0 0.00 0.53 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 1.00 0.00 0.05 2.03 0.57 0.00 2.55 0.00 0.00 0.55 1.14 0.54 0.76 47 E16_Da NovelBoundary 0 3.63 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 3.36 6.32 11.10 0.00 2.35 14.59 3.59 9.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.29 48 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 4.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 ER17a ExonRegion 0 0.00 0.39 0.45 0.00 0.00 0.70 0.06 0.24 0.09 0.16 0.00 0.00 0.18 0.15 0.00 0.28 0.00 0.13 0.00 0.10 0.21 0.30 0.00