Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-550I24.1 Gene 0 4.40 0.87 0.42 1.34 3.89 1.15 0.79 1.19 1.40 0.96 3.13 3.09 0.92 3.82 2.63 4.42 1.09 0.79 1.37 1.90 3.06 0.96 1.65 2 460796 Transcript 0 4.92 0.56 1.17 2.17 4.26 1.15 1.45 2.06 2.11 1.43 3.10 0.00 0.60 5.36 5.32 3.84 3.92 2.02 0.71 4.49 6.18 0.69 0.59 3 487238 Transcript 0 0.36 0.00 0.00 0.96 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 8.01 0.00 0.61 0.03 7.45 0.00 0.00 0.53 0.00 1.80 0.00 0.00 4 488040 Transcript 0 0.17 0.33 0.00 0.00 1.52 0.15 0.54 0.00 0.15 0.14 0.31 1.51 0.63 0.85 0.33 0.97 0.00 0.00 0.26 0.00 0.36 0.34 0.95 5 475102 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.72 3.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 494885 Transcript 0 2.59 0.20 0.52 0.64 3.25 0.00 0.30 1.16 0.38 0.12 1.80 2.16 1.74 1.44 0.31 0.00 0.00 0.28 1.37 0.65 1.22 1.53 0.66 7 IG31_SR4 SilentIntergenicRegion 0 2.12 2.03 0.00 3.41 0.00 2.75 1.32 1.73 8.65 16.63 1.61 0.00 0.00 2.44 2.90 3.47 2.20 9.24 3.19 4.26 8.08 4.17 2.94 8 ER1a ExonRegion 0 9.19 1.12 2.35 3.57 2.73 2.30 2.08 4.12 4.07 2.86 6.21 0.00 0.00 9.64 9.26 4.93 6.81 4.05 1.42 7.97 11.67 1.37 1.19 9 E1_Ab KnownBoundary 0 26.38 5.92 8.46 10.89 7.72 5.79 8.13 10.72 16.61 14.08 14.95 0.00 6.17 12.01 11.13 16.92 17.86 11.90 9.04 20.07 19.89 3.12 3.84 10 ER1b ExonRegion 0 33.54 9.65 3.24 5.08 11.56 16.72 5.45 6.67 13.48 10.37 20.15 9.94 0.00 16.62 20.83 24.96 7.36 6.94 8.82 11.27 17.29 2.27 15.85 11 E1_Ac KnownBoundary 0 64.60 5.92 0.00 3.76 30.22 12.72 1.99 6.20 22.63 7.79 15.11 12.30 0.00 19.19 17.80 36.57 4.30 13.97 14.12 5.56 7.85 5.82 4.35 12 ER1c ExonRegion 0 24.89 1.02 0.23 2.30 10.96 4.24 0.41 4.03 6.62 5.68 12.38 11.75 0.67 17.59 12.23 23.71 6.21 4.75 5.23 1.72 10.39 1.84 1.33 13 E1_Da NovelBoundary 0 12.08 8.81 11.41 3.76 0.00 0.00 8.08 12.45 18.63 18.16 11.11 7.65 0.00 4.71 0.00 26.83 4.77 5.14 0.00 16.04 21.56 0.00 0.00 14 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 2.63 0.00 2.00 0.00 0.00 0.00 2.14 0.00 2.85 6.95 0.00 0.00 3.00 0.00 15.89 9.44 0.00 0.00 2.68 8.15 0.00 0.00 15 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 9.25 4.92 8.09 3.39 10.42 4.71 3.72 9.13 19.92 11.68 7.55 19.33 6.45 11.66 10.59 9.39 6.70 5.18 4.98 10.19 3.04 3.34 3.49 16 I1_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.29 5.55 0.00 1.12 10.34 2.25 1.32 6.60 5.28 6.31 4.74 37.59 8.53 7.01 7.25 20.80 0.00 4.79 2.75 5.51 2.20 3.50 0.00 17 I1_AR4 ActiveIntronRegion 0 6.21 3.08 5.58 5.25 13.31 6.13 2.96 7.03 6.65 6.13 7.96 15.49 9.81 9.64 9.47 16.97 4.30 5.83 4.36 8.43 1.86 2.88 1.16 18 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 6.92 0.11 5.83 2.74 12.36 3.07 2.13 2.75 5.79 1.83 0.84 12.07 6.14 14.23 5.03 2.72 7.39 1.72 3.68 4.35 2.92 1.50 5.09 19 I1_AR5 ActiveIntronRegion 0 4.32 6.20 1.86 3.37 9.89 4.21 6.75 8.54 11.25 8.06 4.68 18.77 9.46 5.76 12.12 5.68 2.92 1.99 5.67 5.15 1.12 1.86 1.50 20 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER3a ExonRegion 0 2.10 0.90 0.00 3.59 1.71 0.00 0.00 1.42 1.59 0.60 4.60 2.74 1.94 7.07 4.49 8.15 1.71 0.70 1.55 4.26 6.22 0.51 2.14 22 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 23 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E3a_E5b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.43 7.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.32 0.00 0.00 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E3a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.60 0.00 0.00 0.00 12.13 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 26 ER3b ExonRegion 0 0.65 0.00 0.00 0.77 5.79 0.00 0.82 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 1.19 1.08 1.37 2.76 1.02 0.00 0.00 1.02 0.68 0.00 0.00 27 ER4a ExonRegion 0 0.34 0.66 0.00 0.00 3.04 0.30 1.08 0.00 0.30 0.28 0.63 3.02 1.25 1.71 0.67 1.93 0.00 0.00 0.52 0.00 0.72 0.68 1.91 28 ER5a ExonRegion 0 3.02 0.00 0.00 0.05 3.79 0.00 0.00 2.33 0.00 0.23 1.52 0.00 3.49 1.31 0.62 0.00 0.00 0.00 1.44 0.00 2.32 0.94 1.33 29 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 7.39 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 2.53 0.00 0.00 7.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.99 0.00 0.00 30 ER5b ExonRegion 0 4.88 0.00 0.00 2.61 7.14 0.00 0.00 2.13 0.00 0.88 1.82 2.51 0.00 4.71 0.50 4.91 0.00 0.00 0.00 1.54 2.71 0.00 0.00 31 E5_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.30 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 3.58 3.26 0.00 0.00 0.00 32 E5a_E6a KnownJunction 0 9.63 0.00 0.00 0.00 12.31 0.00 0.00 4.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER6a ExonRegion 0 8.54 0.02 0.22 0.08 7.56 0.00 0.59 2.91 0.00 0.00 2.02 2.50 0.00 1.80 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 1.30 2.31 2.50 0.00 34 E6_Da KnownBoundary 0 3.11 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 1.94 0.00 0.00 0.00 2.32 6.30 0.00 9.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 35 ER6b ExonRegion 0 2.16 0.40 1.04 1.24 2.72 0.00 0.61 0.00 0.75 0.00 2.07 4.31 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.56 1.30 1.30 0.11 2.13 0.00 36 ER7a ExonRegion 0 0.71 0.00 0.00 0.19 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 3.42 0.00 1.22 0.06 2.76 0.00 0.00 1.07 0.00 0.45 0.00 0.00