Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-255N4.2 Gene 0 1.17 1.02 1.21 0.72 1.04 0.59 0.67 0.63 0.66 0.64 1.88 3.59 1.49 1.28 4.30 1.49 2.03 0.64 0.77 0.93 4.74 2.16 2.42 2 495094 Transcript 0 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.22 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.10 0.23 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 1.41 0.44 0.37 3 466836 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 460016 Transcript 0 0.63 0.03 1.35 0.11 0.71 0.04 0.06 0.04 0.79 0.53 0.82 0.93 0.00 0.09 0.67 0.77 0.40 0.04 0.05 0.04 6.54 1.14 1.52 5 479752 Transcript 0 0.27 0.00 0.00 0.26 0.04 0.24 0.09 0.50 0.12 0.11 3.08 1.70 0.00 0.34 1.43 0.95 1.06 0.51 0.00 0.00 1.63 1.61 0.38 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 7 E1_Ab KnownBoundary 0 10.45 12.23 21.44 6.99 0.00 2.21 13.87 7.48 11.66 11.26 45.75 0.00 19.97 7.42 0.00 18.46 24.40 0.00 0.00 0.00 539.19 344.50 189.25 8 E1_Ac KnownBoundary 0 7.26 0.00 12.89 5.79 3.65 2.61 0.00 5.01 16.70 2.79 14.74 0.00 13.47 2.35 8.90 3.85 16.83 0.00 0.00 0.00 227.34 190.62 79.13 9 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.21 0.00 0.00 10 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.18 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 7.28 3.51 2.66 11 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.80 3.12 0.00 12 E1a_E1d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1a_E1e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER1d ExonRegion 0 1.12 0.00 4.34 0.36 1.42 0.00 0.23 0.00 3.09 0.97 1.81 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 26.16 4.57 5.02 15 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.57 3.12 0.00 16 E1_Ae NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.39 0.00 17.16 17 ER1e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.39 1.46 5.87 18 E1_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.49 0.00 4.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.76 4.27 19 E1b_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER1f ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.84 1.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 0.00 5.31 21 ER1g ExonRegion 0 0.00 0.00 0.42 0.59 1.61 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 22 E1_Dc KnownBoundary 0 3.63 0.00 10.97 8.56 0.00 0.00 0.00 6.53 13.02 2.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 3.46 0.00 0.00 0.00 94.15 120.39 133.25 23 ER1h ExonRegion 0 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.17 0.65 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.29 0.68 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 2.95 1.32 1.11 24 E1_Af KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 11.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER1i ExonRegion 0 1.05 0.00 0.00 0.00 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 4.17 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 5.02 2.04 0.00 26 E1_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.37 2.69 3.93 27 ER1j ExonRegion 0 0.54 0.00 0.00 0.52 0.09 0.47 0.17 0.99 0.24 0.22 3.63 3.40 0.00 0.69 2.85 1.91 2.12 1.02 0.00 0.00 3.25 3.23 0.75 28 E1e_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER2a ExonRegion 0 0.20 0.11 0.25 0.09 1.42 0.18 0.00 0.16 0.08 0.31 1.46 3.74 0.00 0.36 2.12 3.07 0.42 0.15 0.22 0.17 0.00 0.00 1.05 30 E2_Ab KnownBoundary 0 3.63 5.53 11.77 11.35 0.00 6.93 0.00 10.47 9.32 14.99 2.26 5.85 0.00 0.00 0.00 8.20 4.02 3.86 7.91 0.00 2.66 0.00 3.50 31 ER2b ExonRegion 0 2.60 3.39 1.92 1.84 2.30 1.75 1.94 1.22 1.08 1.42 3.46 9.18 4.77 3.80 11.51 3.52 4.74 1.51 2.54 3.08 2.03 2.60 4.54 32 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER3a ExonRegion 0 0.57 0.00 1.62 0.43 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.49 0.11 2.14 0.76 0.00 0.97 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.87 0.41 0.00 34 E3_Da KnownBoundary 0 3.63 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER3b ExonRegion 0 1.21 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00