Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	C3orf16	Gene	0	0.43	0.24	0.10	0.21	0.40	0.17	0.73	0.10	0.23	0.29	0.25	0.90	0.98	0.55	1.10	0.62	0.67	0.09	0.30	0.55	0.43	0.40	0.41
2	481585	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.26	0.67	0.00	0.17	0.00	0.23	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00
3	473672	Transcript	0	1.33	0.64	0.60	0.97	1.28	0.28	2.05	0.48	1.30	1.56	0.70	1.44	1.92	0.29	1.05	1.76	1.42	0.42	0.42	0.47	0.79	1.90	0.21
4	383050	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	484019	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	446160	Transcript	0	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60
7	462519	Transcript	0	0.78	0.30	0.00	0.00	0.59	0.54	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.79	1.71	1.46	2.78	0.66	0.98	0.14	0.71	0.94	0.81	0.00	0.65
8	497728	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	474404	Transcript	0	0.16	0.17	0.00	0.00	0.42	0.10	0.35	0.00	0.00	0.00	0.17	0.70	0.67	0.50	0.94	0.38	0.46	0.02	0.20	0.48	0.17	0.22	0.34
10	462561	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	474224	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	11.82	55.87	33.48	47.06	48.81	33.43	40.70	27.02	35.96	36.11	5.74	38.15	6.73	0.38	0.59	1.07	2.13	19.24	14.33	50.39	7.07	17.54	8.42
14	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	27.01	6.66	4.01	18.03	22.87	5.21	10.82	3.30	13.71	7.08	2.64	7.92	15.56	2.84	4.65	4.39	1.09	1.62	0.00	11.75	0.00	2.11	7.84
15	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	15.49	11.09	6.94	18.33	25.51	3.65	12.41	4.36	13.23	9.71	2.40	7.66	7.53	2.40	3.99	2.83	0.85	1.72	4.30	8.81	1.25	5.56	4.08
16	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	10.98	8.49	4.20	16.57	14.16	6.73	10.76	5.10	14.07	7.10	3.77	7.11	17.27	3.61	3.62	5.23	2.02	4.02	5.11	18.06	0.52	10.22	4.87
17	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	5.50	8.96	3.39	9.26	9.11	7.16	11.20	2.79	9.26	6.30	3.58	10.82	12.11	1.61	1.21	10.68	6.02	10.06	12.06	25.41	3.77	4.51	11.35
18	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	29.90	3.67	2.10	9.82	8.09	2.91	8.73	2.70	8.11	5.92	3.21	8.16	12.71	1.44	2.14	4.13	3.29	3.06	4.58	18.58	1.71	7.03	3.25
19	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	18.28	6.99	1.02	6.27	1.65	4.53	7.85	3.68	5.41	2.69	0.00	3.38	14.75	0.00	3.90	4.00	3.12	0.00	0.00	19.92	0.00	2.92	0.00
20	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.51	5.80	1.89	9.76	7.97	2.88	11.95	5.19	6.36	3.39	1.26	7.40	7.87	1.50	3.88	5.75	5.19	4.38	5.20	20.10	2.12	2.55	5.87
21	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.03	2.68	0.00	0.67	0.00	0.93	0.00	0.00	5.06	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94	0.00	0.00
22	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	2.12	5.92	2.45	5.45	13.87	5.50	17.09	12.41	10.78	6.88	4.57	5.90	4.69	0.00	5.80	5.94	6.60	0.00	0.00	5.80	0.00	0.00	0.00
24	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	6.61	2.45	5.45	13.38	0.00	7.28	15.56	14.82	5.16	3.87	4.33	3.52	0.00	5.08	0.00	6.19	0.00	0.00	6.38	0.00	4.17	0.00
25	ER3a	ExonRegion	0	0.67	0.43	0.00	0.86	0.56	0.38	1.95	0.81	1.35	0.36	0.81	1.12	0.41	0.00	0.43	1.25	1.39	0.58	0.00	0.25	1.83	0.00	0.62
26	E3_Da	NovelBoundary	0	10.59	0.00	0.00	5.79	0.00	0.00	1.77	4.39	1.77	0.00	0.00	6.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E4_Aa	NovelBoundary	0	45.79	15.98	63.66	84.70	34.13	27.31	32.02	53.77	103.88	68.12	78.13	44.71	97.72	71.05	72.56	114.07	88.83	44.77	43.20	140.17	40.83	245.24	177.13
29	ER4a	ExonRegion	0	1.37	0.00	2.27	3.23	0.02	0.00	0.00	1.08	1.80	5.47	1.85	0.50	2.15	0.17	0.86	1.80	1.98	0.00	1.83	1.50	0.07	3.30	0.00
30	E4_Da	KnownBoundary	0	11.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65	5.00	7.90	6.30	6.82	2.47	0.00	7.26	8.88	0.00	4.71	2.43	0.00	8.14	0.00
31	E4a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER4b	ExonRegion	0	3.33	1.49	1.79	2.05	3.26	0.45	4.20	0.63	2.54	4.31	1.28	3.19	5.34	0.88	2.71	4.02	2.87	0.67	1.27	1.15	0.54	5.70	0.00
33	E4_Db	NovelBoundary	0	13.41	0.00	1.54	1.27	3.99	0.00	20.09	2.55	1.79	0.00	0.00	6.30	5.84	0.00	0.00	6.49	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	E5_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.05	0.00	0.00
37	E5_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00
38	ER5c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00
39	E5a_E6b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	E5a_E6c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER6b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER6c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E6a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	ER9b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00
51	E9_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00
52	E9a_E9c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	ER9c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00
55	E9_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
56	ER9d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	E9_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
58	E9c_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
59	ER9e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00
60	E9_Dd	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
61	ER9f	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
62	E9_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
63	ER9g	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
64	E9_De	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	E9e_E9d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
66	ER9h	ExonRegion	0	0.64	0.70	0.00	0.00	0.69	0.39	1.42	0.00	0.00	0.00	0.66	2.78	2.66	2.01	3.75	1.53	1.84	0.08	0.82	1.92	0.66	0.89	1.38
67	E9_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
68	ER9i	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
69	E9_Df	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
70	ER9j	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
71	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
72	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
73	ER11a	ExonRegion	0	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
74	E11_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
75	E11a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
76	ER11b	ExonRegion	0	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
77	E11_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
78	E11b_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
79	ER11c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
80	E11c_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
81	ER12a	ExonRegion	0	2.35	0.90	0.00	0.00	1.78	1.63	4.11	0.00	0.00	0.00	0.00	2.37	5.14	4.39	8.33	1.98	2.93	0.41	2.12	2.83	2.44	0.00	1.95
82	E12_Da	NovelBoundary	0	6.82	0.00	4.23	7.66	0.00	5.34	4.06	5.54	7.75	4.94	2.68	0.00	0.00	2.71	0.00	3.93	0.00	1.91	4.33	2.94	2.84	8.27	4.01
83	ER13a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
84	ER14a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57
85	E14_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.10
86	ER14b	ExonRegion	0	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60