Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 ZIC1 Gene 0 1.55 0.15 0.00 0.00 0.16 0.00 0.02 0.48 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.99 4.64 9.88 2 472523 Transcript 0 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.34 2.04 2.21 3 488404 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.15 0.00 0.00 4 282928 Transcript 0 0.72 0.05 0.00 0.00 0.07 0.00 0.01 0.86 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.44 7.91 15.78 5 474034 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 0.15 1.32 6 481840 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 473372 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1a ExonRegion 0 2.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.68 4.08 4.42 9 E1_Ab KnownBoundary 0 13.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.22 4.96 14.85 10 ER1b ExonRegion 0 6.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.65 1.86 6.25 11 E1_Da NovelBoundary 0 7.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.33 10.90 4.35 12 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.15 0.00 0.00 13 E1a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 Ix Intron 0 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.79 3.62 11.93 15 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.00 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.12 7.53 11.82 16 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.79 2.57 11.97 17 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.22 1.45 6.57 18 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.58 1.39 4.62 19 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.02 1.70 0.00 20 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.59 0.00 0.00 21 Ix_AR8 ActiveIntronRegion 0 2.02 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.44 2.92 8.33 22 Ix Intron 0 1.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.35 3.18 6.73 23 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.53 5.35 2.00 24 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.30 1.10 10.04 25 Ix Intron 0 0.30 0.29 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.90 2.15 8.67 26 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.46 0.36 0.00 0.00 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.25 2.63 12.53 27 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.19 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.83 1.88 5.96 28 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.06 0.00 1.10 29 I1 Intron 0 1.64 0.13 0.04 0.00 0.35 0.08 0.23 0.06 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.02 3.28 8.24 30 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.25 0.17 0.16 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.98 2.86 5.57 31 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.83 0.23 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.13 2.96 10.14 32 I1_AR2 ActiveIntronRegion 0 2.76 0.10 0.00 0.00 0.51 0.00 0.38 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.17 4.14 9.78 33 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 1.69 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 0.53 0.52 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.37 1.25 4.70 34 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.95 0.00 8.45 35 ER2a ExonRegion 0 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.36 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.87 3.58 11.07 36 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.41 16.66 32.10 37 ER3a ExonRegion 0 7.21 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.24 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 85.38 23.96 54.02 38 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.15 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 108.05 21.74 38.84 39 ER4a ExonRegion 0 7.79 1.27 0.00 0.00 1.07 0.00 0.21 5.34 0.00 2.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71.12 26.06 71.75 40 E4_Da KnownBoundary 0 16.74 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 1.81 0.00 4.41 0.00 0.00 0.00 0.00 5.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64.50 25.78 80.16 41 ER4b ExonRegion 0 1.15 0.14 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.09 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.03 3.50 4.18 42 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 0.46 2.24 43 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 44 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.32 3.95 45 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 3.12 4.35 46 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 2.08 2.94 47 ER6c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.64 0.92 1.25 48 E6b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 E6b_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 E6c_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 ER6d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 0.00 52 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.28 0.00 0.00 53 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.74 0.00 0.00 54 E7_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 55 ER7c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 0.59 56 E7_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 ER7d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00