Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	CLDN18	Gene	0	1.39	0.94	2.07	2.78	1.87	0.96	2.96	0.75	1.38	2.09	0.41	1.43	2.10	1.25	0.96	0.27	3.91	2.91	1.01	4.23	6.49	3.04	7.73
2	343735	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00
3	183605	Transcript	0	1.49	0.60	4.17	5.73	4.40	3.88	4.58	0.12	1.50	6.97	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	7.58	0.00	5.59	10.59	7.37	11.60
4	479660	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	2.52	2.18	8.77	8.80	8.35	3.74	4.92	2.51	4.55	6.44	0.00	0.00	0.67	0.00	0.06	0.00	0.00	2.16	0.98	4.97	3.94	10.50	8.79
8	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.83	5.09	7.81	2.50	0.00	1.85	4.14	10.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.81	0.00	6.07	2.59	16.72	26.63
9	ER2a	ExonRegion	0	1.49	0.60	4.17	5.73	4.40	3.88	4.58	0.12	1.50	6.97	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	7.58	0.00	5.59	10.59	7.37	11.60
10	E2_Ab	KnownBoundary	0	3.78	6.18	5.77	4.36	0.00	0.00	6.40	1.85	1.79	4.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	2.75	18.35	8.88	12.04
11	ER2b	ExonRegion	0	0.47	2.15	4.55	4.06	0.60	1.62	3.33	1.61	3.05	2.91	0.00	0.79	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	6.74	0.71	4.18	12.06	9.81	16.48
12	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	8.34	7.09	3.99	0.00	2.08	4.39	4.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.75	0.00	6.26	21.99	11.39	12.29
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	I2	Intron	0	1.93	1.24	3.52	4.89	5.32	3.36	5.20	1.44	3.02	4.75	0.01	0.05	1.86	0.01	0.08	0.00	0.20	4.65	1.47	8.13	9.04	11.11	14.73
15	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.21	1.38	5.63	5.37	9.64	3.18	7.76	2.33	5.10	6.88	0.00	0.24	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	4.83	0.94	10.66	8.43	17.41	15.40
16	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.96	1.41	6.66	6.88	6.33	4.23	8.44	3.36	7.58	11.59	0.00	0.00	3.90	0.00	0.00	0.00	0.00	7.70	2.02	8.88	6.71	18.28	16.71
17	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	1.95	0.74	2.35	4.91	6.11	4.18	6.00	1.26	2.55	4.70	0.00	0.00	2.81	0.00	0.12	0.00	0.00	3.79	0.93	8.64	8.18	11.10	17.76
18	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.29	1.20	2.94	2.80	5.05	5.11	2.41	1.14	3.49	6.00	0.00	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.72	8.57	2.34	9.54	19.85	13.01	23.16
19	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	2.43	1.20	2.15	4.08	6.66	3.66	8.86	1.50	2.61	4.83	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.40	4.83	1.86	10.93	10.14	17.27	9.82
20	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.71	2.03	2.08	5.50	3.81	2.61	5.47	1.47	3.93	5.36	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	4.55	1.88	9.20	7.53
21	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	1.26	1.54	1.97	4.60	4.33	3.66	3.65	0.70	1.79	3.42	0.10	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.18	3.43	0.86	7.36	8.21	8.55	12.70
22	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.80	1.64	11.40	13.66	5.24	2.65	4.62	3.42	6.39	3.20	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	1.06	5.19	0.00	8.17	7.96	11.21	16.26
23	I2_SR6	SilentIntronRegion	0	2.80	1.37	11.68	9.59	2.17	6.42	7.36	1.31	4.80	6.07	0.00	0.00	2.56	0.00	0.00	0.00	0.00	3.42	3.12	9.91	7.60	13.94	18.36
24	I2_AR6	ActiveIntronRegion	0	3.27	1.98	5.44	4.57	5.99	3.04	5.18	1.35	1.81	2.95	0.00	0.29	0.94	0.11	0.50	0.00	0.27	5.36	0.27	6.38	9.77	8.09	14.10
25	I2_SR7	SilentIntronRegion	0	1.49	1.24	2.94	4.13	4.36	2.44	4.28	1.24	2.39	4.04	0.00	0.06	1.47	0.02	0.04	0.00	0.17	4.57	2.40	7.34	8.27	9.07	12.62
26	I2_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.83	0.56	1.15	3.34	1.05	1.20	3.96	1.01	1.86	3.78	0.00	0.00	1.52	0.00	0.40	0.00	0.65	4.31	1.25	7.39	13.81	8.62	12.30
27	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.35	1.42	6.53	3.82	7.55	2.21	2.55	1.65	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.15	8.75	16.04	13.53	11.70	12.72
28	ER3a	ExonRegion	0	0.65	0.00	2.87	2.51	0.83	1.16	0.82	0.80	4.60	4.21	0.00	0.00	1.28	0.00	0.62	0.00	0.00	11.85	0.98	4.85	15.65	4.41	10.89
29	E3_Da	NovelBoundary	0	3.70	3.35	1.33	3.66	0.00	0.00	0.00	2.55	1.68	9.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.34	0.00	15.08	17.05	9.31	3.93
30	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E3a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	3.00	0.00	0.00	5.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.23	0.00	11.38	5.44	2.69	12.12
33	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.88	1.58	2.62	2.31	0.00	1.72	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	1.55	0.00	0.02	0.00	1.43	0.80	1.38	4.53	4.69	1.77	6.30
34	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.02	6.86	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	6.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.98	6.12	0.00	12.55
35	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.43	0.97	3.24	1.42	1.89	1.20	0.55	1.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	4.96	10.47	2.74	5.54
37	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	4.76	0.00	0.00	4.50	2.46	1.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.47	0.00	11.38	8.96	3.12	8.71
38	ER5a	ExonRegion	0	5.80	0.00	1.68	0.95	2.46	3.37	1.85	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.89	2.63	2.93	5.52	8.26	1.91	10.79
39	E5_Da	NovelBoundary	0	3.78	0.00	1.83	1.33	0.00	0.00	6.80	0.00	1.71	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	2.53	0.00	8.95	19.52	5.82	8.19
40	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.67	2.06	0.00	5.00	7.91	1.77	0.00	5.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.82	18.22	3.12	3.76
42	ER6a	ExonRegion	0	2.14	1.09	1.92	3.04	2.37	0.92	4.06	0.77	1.35	1.98	0.68	3.39	4.61	2.65	2.23	0.69	6.62	2.20	1.58	4.77	6.53	2.50	6.69
43	E6_Da	KnownBoundary	0	3.41	2.50	1.71	1.86	4.50	0.00	5.92	0.00	0.00	3.17	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.74	2.28	9.60	3.20	8.77	0.00	4.27
44	ER6b	ExonRegion	0	0.82	1.07	1.98	2.71	1.60	0.49	2.58	1.03	1.15	1.84	0.47	0.16	0.59	0.56	0.18	0.00	3.64	2.08	0.58	4.31	5.28	2.59	8.43
45	ER6c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00
46	IG18_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	1.55	5.18	6.93	5.43	3.91	3.03	5.94	6.18	4.00	5.82	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	7.36	0.88	9.70	4.52	3.79	11.21