Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C3orf25 Gene 0 2.14 0.64 0.86 0.32 1.98 1.40 0.65 3.41 2.56 2.53 1.04 0.59 1.13 2.18 3.69 2.33 0.44 1.36 1.43 0.53 0.49 1.50 3.82 2 439888 Transcript 0 0.00 0.00 1.35 0.11 0.00 0.00 0.66 0.13 1.36 0.73 0.82 0.00 1.64 1.15 1.69 2.53 0.00 1.88 1.19 0.00 0.00 2.10 1.91 3 326085 Transcript 0 4.66 0.44 1.68 0.10 0.74 4.18 0.13 3.82 4.56 3.11 1.12 0.19 0.28 3.09 5.83 2.49 0.16 0.38 5.76 0.10 0.00 3.24 2.33 4 ER1a ExonRegion 0 2.55 0.00 0.00 0.49 2.22 0.00 0.32 1.69 1.37 2.47 2.82 0.00 2.79 2.10 3.76 5.00 0.79 1.32 1.16 0.00 1.06 1.11 3.55 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 2.18 1.13 1.42 0.00 0.00 0.00 2.47 8.90 0.00 0.00 0.00 8.28 0.00 0.00 2.57 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.25 0.71 0.24 0.00 2.05 1.50 0.62 2.90 2.36 2.17 0.89 0.71 1.35 1.87 1.78 2.43 0.00 0.64 2.04 0.74 0.26 0.68 4.11 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 4.23 2.66 3.22 2.84 0.00 0.00 2.30 10.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.53 0.41 0.00 0.00 0.96 0.67 3.15 1.93 2.52 0.51 0.00 0.00 2.20 4.88 0.78 0.86 2.06 1.67 1.12 0.00 1.09 4.61 9 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 9.77 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER4a ExonRegion 0 0.82 0.00 1.73 0.00 2.10 1.52 0.46 4.03 2.08 0.88 2.08 0.00 1.25 3.02 2.00 0.72 1.07 2.52 1.03 1.37 0.00 0.00 5.70 11 E4a_E5a KnownJunction 0 2.89 0.00 1.09 0.00 7.05 5.51 0.00 4.89 1.79 0.00 5.00 0.00 0.00 0.00 5.19 3.76 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 16.73 12 ER5a ExonRegion 0 1.75 0.00 1.32 0.53 2.72 1.46 1.49 3.02 2.11 1.66 1.34 0.00 0.00 2.89 3.06 0.81 0.00 1.43 0.82 0.55 0.57 0.54 3.82 13 E5a_E6a KnownJunction 0 3.78 0.00 3.08 0.00 4.07 2.44 3.97 5.75 0.00 7.60 0.00 0.00 0.00 2.41 4.94 3.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER6a ExonRegion 0 2.43 0.48 0.59 0.97 2.34 1.04 1.16 4.87 1.34 4.17 0.46 2.91 0.37 1.79 5.97 2.29 0.00 1.31 0.00 0.51 1.91 0.50 4.76 15 E6a_E7a KnownJunction 0 3.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.80 0.00 0.00 0.00 0.00 6.66 0.00 4.45 0.00 4.49 0.00 0.00 0.00 5.81 0.00 3.50 16 ER7a ExonRegion 0 1.94 0.00 1.32 0.58 1.71 2.82 0.36 5.59 4.37 3.41 0.00 0.00 2.03 3.27 3.91 3.85 1.09 0.97 1.21 0.00 1.72 1.80 4.55 17 E7_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.51 1.37 0.00 0.00 4.50 1.64 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 3.06 4.35 18 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.35 0.11 0.00 0.00 0.66 0.13 1.36 0.73 0.82 0.00 1.64 1.15 1.69 2.53 0.00 1.88 1.19 0.00 0.00 2.10 1.91 20 ER8a ExonRegion 0 7.26 0.00 2.21 0.00 0.14 3.73 0.00 3.73 4.79 3.19 1.10 0.00 0.00 3.02 8.03 4.72 0.00 0.00 8.02 0.00 0.00 3.87 3.25 21 E8a_E9a KnownJunction 0 6.67 0.00 3.34 0.00 0.00 5.79 0.00 7.48 9.69 6.12 2.58 0.00 0.00 4.94 10.75 3.16 0.00 0.00 13.74 0.00 0.00 5.88 3.33 22 ER9a ExonRegion 0 4.73 1.76 1.17 0.39 2.83 1.78 0.51 4.07 3.75 3.10 0.81 0.76 1.11 1.94 4.55 2.08 0.64 1.50 1.29 0.41 0.00 3.20 2.75 23 IG47_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 34.06 12.40 1.02 1.81 18.83 20.66 13.69 1.69 1.58 1.50 10.97 11.67 7.54 25.28 25.34 16.86 5.20 3.76 16.95 12.21 8.10 6.54 6.74 24 IG47_SR1 SilentIntergenicRegion 0 20.35 7.86 9.39 5.13 10.52 0.58 6.23 2.19 2.54 3.94 4.95 4.43 1.10 10.04 19.87 11.64 10.28 8.44 12.65 8.61 5.54 2.76 6.16 25 IG47_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 9.95 8.30 12.40 5.85 16.89 1.06 6.03 7.71 3.60 6.89 11.03 15.13 4.81 9.33 11.30 17.38 12.92 4.88 14.24 5.63 4.05 3.60 7.36