Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	DPPA4	Gene	0	14.49	4.82	1.44	1.91	8.22	4.23	6.12	2.89	2.54	2.13	2.17	5.65	6.69	3.95	7.62	6.10	4.61	3.14	5.01	6.12	3.98	2.23	5.69
2	335658	Transcript	0	4.14	0.00	0.00	0.07	2.26	0.00	0.12	0.83	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.22	0.00
3	489281	Transcript	0	3.32	0.00	0.00	0.00	2.30	0.00	0.14	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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9	475135	Transcript	0	14.93	7.95	1.78	2.50	10.67	4.84	10.73	2.00	2.43	1.77	3.66	3.41	4.18	4.03	7.58	12.80	10.05	3.54	10.99	8.92	6.53	4.91	11.97
10	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1_Ae	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.57	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER1b	ExonRegion	0	1.75	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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16	ER1d	ExonRegion	0	4.23	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	1.32	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER1e	ExonRegion	0	20.25	0.00	0.00	0.91	3.57	0.00	2.52	0.44	1.70	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.52	0.87	0.00	0.71	0.09	0.00	0.00
18	E1a_E3a	KnownJunction	0	53.05	0.00	3.43	1.76	4.33	0.00	1.72	2.38	6.31	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E1a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER3a	ExonRegion	0	11.35	0.00	0.00	2.17	1.01	0.00	3.58	1.47	1.37	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.95	1.30	0.00	2.44	1.46	0.00	0.00
23	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.08	0.00	0.00	0.00	1.99	2.26	1.59	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.21	0.00	0.00	3.20	0.00	0.00	0.00
24	ER3b	ExonRegion	0	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E3_Da	KnownBoundary	0	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER3c	ExonRegion	0	3.32	0.00	0.00	0.00	2.30	0.00	0.14	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E4_Aa	NovelBoundary	0	88.16	96.82	107.60	111.34	68.85	59.51	84.75	111.31	96.70	93.64	27.16	12.30	33.11	7.12	29.30	85.70	73.02	157.61	62.59	68.01	23.17	34.90	74.52
29	ER4a	ExonRegion	0	6.64	1.94	0.00	0.00	1.04	1.17	6.33	0.00	0.02	0.00	0.00	2.27	2.29	0.43	1.96	0.97	0.00	0.00	2.03	0.00	0.00	0.66	0.00
30	E4_Ab	KnownBoundary	0	7.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER4b	ExonRegion	0	4.84	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.76	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E4_Da	KnownBoundary	0	3.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.09	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER4c	ExonRegion	0	4.21	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	1.83	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00
34	E4b_E5a	KnownJunction	0	3.78	0.00	0.00	0.00	4.33	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00
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36	E5a_E6a	KnownJunction	0	26.08	0.00	4.70	1.60	0.00	0.00	4.37	4.85	3.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.36	0.00	4.44	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00
37	E5a_E6d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	I5	Intron	0	11.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	11.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER6a	ExonRegion	0	18.37	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	3.60	0.07	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	1.32	0.00	0.00	1.08	0.20	0.00
41	E6_Ab	KnownBoundary	0	26.30	0.00	0.00	0.00	4.33	0.00	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER6b	ExonRegion	0	3.55	0.00	0.39	0.21	3.56	0.00	1.75	1.37	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	1.09	0.45	0.00
43	E6_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.80	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E6a_E6c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	2.06	4.33	0.00	0.00	2.18	1.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.84	0.00	0.00
45	ER6c	ExonRegion	0	21.74	19.12	6.64	6.74	19.58	19.97	18.67	11.85	11.83	11.62	7.92	27.38	37.76	16.93	29.81	23.49	15.65	12.93	14.53	27.92	11.36	5.82	17.20
46	E6_Db	KnownBoundary	0	24.15	0.00	0.00	2.03	3.99	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00
47	ER6d	ExonRegion	0	14.93	7.95	1.78	2.50	10.67	4.84	10.73	2.00	2.43	1.77	3.66	3.41	4.18	4.03	7.58	12.80	10.05	3.54	10.99	8.92	6.53	4.91	11.97
48	E6_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.16	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	E6_Ad	KnownBoundary	0	3.78	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00
50	ER6e	ExonRegion	0	2.12	0.00	0.00	1.36	2.68	0.00	0.00	3.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.20	0.00	0.00
51	ER6f	ExonRegion	0	2.75	0.00	0.00	0.69	0.72	0.00	0.88	1.18	0.12	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	2.26	5.39	0.00	0.00
52	E6_Dc	KnownBoundary	0	8.74	0.00	3.67	1.60	0.00	0.00	4.15	6.33	1.56	4.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.20	6.18	0.00	0.00
53	ER6g	ExonRegion	0	16.63	0.81	0.00	0.38	3.97	0.00	2.06	0.81	1.70	0.36	0.57	1.42	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	0.62	0.98	2.22	0.00	1.17
54	E6d_E7a	KnownJunction	0	20.82	0.00	0.00	5.53	8.66	0.00	11.57	0.00	4.28	2.74	2.32	12.60	0.00	0.00	0.00	4.36	0.00	4.48	9.60	6.20	0.00	0.00	0.00
55	ER7a	ExonRegion	0	24.11	3.84	0.54	1.40	8.51	3.68	5.03	2.15	2.24	1.09	1.80	9.28	10.36	8.32	19.27	3.11	3.54	2.79	4.31	4.97	4.42	1.76	5.49
56	E7_Da	KnownBoundary	0	1569.91	1866.18	1315.95	1547.62	2108.91	1215.66	2200.94	1453.20	1348.16	1401.71	782.25	400.78	321.25	290.60	436.49	1378.70	1609.63	1959.38	1596.66	1818.00	1383.13	851.33	1434.70
57	ER7b	ExonRegion	0	28.87	6.24	2.37	3.66	14.71	5.74	8.18	4.45	2.60	2.83	3.39	7.44	5.16	3.96	7.55	6.13	4.38	5.60	6.82	6.56	6.58	3.12	8.18
58	E7_Db	KnownBoundary	0	16.82	0.00	0.00	0.00	4.16	0.00	6.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
59	ER7c	ExonRegion	0	8.28	0.00	0.00	0.15	4.52	0.00	0.25	1.66	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.44	0.00