Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	UPK1B	Gene	0	6.10	3.98	8.42	9.28	3.86	3.30	5.45	9.51	9.49	8.92	1.17	3.06	2.84	2.59	4.39	3.14	2.97	12.61	4.44	5.55	2.28	1.45	4.43
2	497685	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	264234	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.18
4	479520	Transcript	0	0.32	0.62	1.37	0.92	0.81	0.84	0.20	0.00	0.00	0.24	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00
5	494855	Transcript	0	0.03	0.00	0.77	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04
6	460625	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	2.37	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1_Ac	KnownBoundary	0	6.52	5.72	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1c	ExonRegion	0	3.12	3.85	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35
14	E1a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	0.96	1.85	4.10	2.76	2.44	2.51	0.60	0.00	0.00	0.73	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2_Da	NovelBoundary	0	13.85	9.27	6.30	3.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER3a	ExonRegion	0	0.06	0.00	1.53	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08
19	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.83	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E3_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	6.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3b	ExonRegion	0	0.26	0.00	3.68	0.34	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	4.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.94
22	ER3c	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.89	1.33	0.00	0.00	0.94	1.68	0.00	2.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08
23	E3_Da	NovelBoundary	0	13.34	0.00	0.00	4.69	0.00	0.00	0.00	4.64	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER4a	ExonRegion	0	0.54	0.04	0.00	1.03	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	0.00	0.54	0.00	0.00	1.49
26	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER5a	ExonRegion	0	0.00	1.38	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14
28	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.60
29	E5a_E6b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.15	0.16	0.00	0.00	0.37	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.64
31	ER6b	ExonRegion	0	1.10	0.00	0.95	2.07	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.77
32	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.33	1.38	1.51	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E7_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	0.00	1.81	2.55	3.21	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER7b	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.90	1.73	2.12	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.48
36	E7_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35
37	ER7c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	0.00	0.84	1.30	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14
38	E7c_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	2.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03
40	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	ER9a	ExonRegion	0	5.00	2.12	0.63	1.57	0.70	0.00	1.03	0.67	0.91	2.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.72	0.26	0.00	0.57	0.00	1.51
42	E9_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.22	4.46	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	3.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.42	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER9b	ExonRegion	0	11.84	7.76	17.44	19.33	7.83	7.00	11.42	20.43	20.45	18.36	2.59	6.39	6.26	5.71	9.57	6.92	6.54	27.49	9.57	12.12	4.91	3.20	8.29
44	ER9c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	IG5_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	12.75	3.02	4.82	4.19	6.62	1.96	2.40	2.55	2.28	4.65	0.32	2.93	0.32	0.00	4.51	1.47	1.09	0.83	2.37	1.40	0.73	0.34	2.67