Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 HGD Gene 0 1.63 0.17 0.37 1.00 0.91 0.50 0.99 0.53 0.35 0.47 0.16 0.60 0.15 0.46 0.74 0.25 0.39 0.34 0.76 1.16 0.11 0.25 0.60 2 283871 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.75 2.23 0.00 0.61 0.00 0.00 2.43 0.00 1.37 1.15 0.00 0.00 0.00 1.02 0.89 0.00 0.00 0.00 3 400813 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 480862 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 5 488183 Transcript 0 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 3.19 0.08 0.00 0.27 0.00 6 466528 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.78 0.00 7 485313 Transcript 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 476082 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 492108 Transcript 0 0.00 1.41 0.00 0.00 0.00 0.00 1.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 475447 Transcript 0 0.35 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 0.81 0.00 1.60 0.00 0.18 0.00 0.00 11 494453 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.06 0.00 12 470321 Transcript 0 0.96 0.02 0.13 0.77 0.00 1.24 0.05 0.00 0.53 0.48 0.49 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.02 0.03 1.05 0.00 0.98 0.00 13 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.75 2.23 0.00 0.61 0.00 0.00 2.43 0.00 1.37 1.15 0.00 0.00 0.00 1.02 0.89 0.00 0.00 0.00 14 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 3.36 0.00 2.61 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 5.56 0.00 0.00 0.00 15 ER1b ExonRegion 0 1.53 0.00 0.00 1.72 3.22 0.51 0.64 0.11 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.45 0.00 2.04 0.66 1.86 2.31 0.00 0.00 1.41 16 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 8.90 0.00 4.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1_Ad KnownBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 18 ER1c ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 4.35 0.00 2.79 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 19 ER1d ExonRegion 0 1.70 0.00 0.00 0.91 1.34 0.00 0.86 1.79 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 0.08 0.00 3.56 1.59 1.32 0.51 3.65 0.00 0.00 2.19 20 E1_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.23 3.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 21 E1_Af KnownBoundary 0 3.63 0.00 0.00 0.00 7.56 0.00 5.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 3.26 0.00 0.00 0.00 22 ER1e ExonRegion 0 3.53 0.00 0.00 1.14 8.03 0.00 3.97 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 3.19 2.13 0.00 0.00 2.94 23 ER1f ExonRegion 0 3.29 0.00 0.00 0.00 6.69 0.00 3.97 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 3.19 2.13 0.00 0.00 2.77 24 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E1a_E2b KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER1g ExonRegion 0 4.10 0.38 0.00 0.00 5.35 0.00 3.97 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 3.58 1.33 0.00 0.00 0.00 28 ER2a ExonRegion 0 0.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 6.37 0.16 0.00 0.53 0.00 29 E2_Ab KnownBoundary 0 5.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.53 0.00 0.00 2.45 0.00 30 ER2b ExonRegion 0 3.89 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 1.71 0.00 0.00 0.59 3.15 0.00 0.98 0.00 31 E2_Da NovelBoundary 0 64.83 77.62 331.04 346.74 57.30 49.74 123.79 276.02 261.72 305.02 14.85 0.00 36.20 0.00 18.05 37.85 40.21 138.45 82.64 98.50 22.80 11.45 62.57 32 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 33 ER3a ExonRegion 0 2.23 1.36 0.00 0.00 2.08 0.00 0.94 0.00 0.00 0.43 0.00 1.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 34 E3a_E4a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 7.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.62 0.00 0.00 0.00 35 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER4a ExonRegion 0 2.95 1.17 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 3.51 0.00 2.97 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 2.68 1.26 0.00 2.05 37 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.59 39 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 40 ER5a ExonRegion 0 0.06 0.00 0.00 0.96 0.00 0.00 1.27 1.27 0.00 0.19 0.00 1.72 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 3.93 41 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 42 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.78 0.00 44 ER6a ExonRegion 0 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 45 E6_Da NovelBoundary 0 14.22 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 2.08 2.26 0.00 3.01 0.00 0.00 0.00 4.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER6b ExonRegion 0 5.46 0.00 0.00 0.53 0.00 0.00 2.14 1.73 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 4.30 0.00 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E6b_E7a KnownJunction 0 3.04 0.00 0.00 5.73 3.74 0.00 6.62 1.85 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.22 0.00 0.00 0.00 0.00 48 ER6c ExonRegion 0 5.52 0.00 0.00 2.37 1.51 0.00 5.30 1.73 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 2.05 0.00 0.00 0.00 0.00 6.37 0.00 0.00 0.00 0.00 49 ER7a ExonRegion 0 0.76 0.00 0.00 2.73 2.68 0.00 3.36 0.86 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 4.40 50 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.20 2.52 0.00 1.85 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 2.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.34 51 E7b_E8a KnownJunction 0 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.51 52 ER7c ExonRegion 0 2.72 0.00 0.00 0.68 2.68 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 5.87 53 ER8a ExonRegion 0 4.23 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.19 0.00 2.18 54 E8a_E9b KnownJunction 0 3.04 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 55 ER9a ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.68 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.59 0.00 1.10 0.00 0.00 56 ER9b ExonRegion 0 4.42 1.00 0.00 0.57 0.00 1.18 1.09 0.00 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 2.13 0.94 3.95 0.00 1.31 0.00 0.00 57 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 7.53 0.00 0.00 0.00 0.00 58 E9a_E13b KnownJunction 0 0.00 2.83 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.65 0.00 0.00 4.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.64 1.79 1.33 0.00 0.00 0.00 60 ER10b ExonRegion 0 2.80 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 2.98 0.00 1.18 0.00 0.00 0.00 1.38 0.50 0.00 0.00 2.09 0.00 1.08 2.57 1.65 0.00 0.00 61 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 3.65 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 62 E10a_E12a KnownJunction 0 3.19 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63 E11a_E13b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 1.20 0.00 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 65 ER12a ExonRegion 0 1.54 0.00 1.20 0.00 2.18 0.00 0.05 1.05 0.00 0.00 0.00 1.49 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 66 E12a_E13b KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 ER13a ExonRegion 0 0.96 0.02 0.13 0.77 0.00 1.24 0.05 0.00 0.53 0.48 0.49 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.02 0.03 1.05 0.00 0.98 0.00 68 E13_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.24 1.43 0.00 5.00 0.00 0.00 1.71 2.90 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 69 ER13b ExonRegion 0 1.81 0.22 2.46 0.94 0.28 3.86 3.03 2.06 0.95 1.37 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.51 0.15 1.96 0.00 0.96 0.00 70 E13a_E14a KnownJunction 0 3.48 0.00 1.09 1.53 3.57 0.00 0.00 2.42 1.56 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71 E13a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72 E13a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 73 E14a_E16b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 74 ER14a ExonRegion 0 2.42 0.00 0.31 0.73 2.68 0.59 0.00 1.73 1.01 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 75 ER14b ExonRegion 0 5.39 0.00 0.00 1.27 0.43 0.94 0.12 1.92 0.00 0.32 0.14 2.01 0.00 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.67 0.00 76 E14b_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.06 0.00 77 E14b_E16a KnownJunction 0 2.74 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 78 ER15a ExonRegion 0 0.84 0.00 0.00 1.21 0.00 0.36 0.26 0.28 0.37 0.00 0.71 0.94 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 0.57 0.00 79 ER15b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 80 ER16a ExonRegion 0 1.34 0.83 0.00 3.85 1.01 1.50 2.09 0.00 0.00 1.11 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 81 E16_Ab KnownBoundary 0 7.56 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 82 ER16b ExonRegion 0 2.67 0.00 0.00 1.05 0.00 1.00 2.79 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 3.72 0.00 0.00 0.00 2.74 1.87 0.00 0.00 0.00 83 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 2.70 0.00 1.93 0.00 2.90 3.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 84 ER17a ExonRegion 0 1.42 0.63 2.30 3.47 2.95 0.22 1.73 0.54 1.08 0.99 0.00 0.00 0.00 0.42 5.11 0.09 0.00 0.00 0.04 1.34 0.00 0.65 0.00 85 E17_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.67 1.23 4.33 0.00 3.36 2.18 1.30 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 10.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 86 ER17b ExonRegion 0 2.24 0.00 1.42 1.12 1.03 0.00 1.15 0.22 1.52 0.97 1.02 0.00 0.00 0.35 2.18 0.71 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.00 0.00 87 ER17c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00