Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-147N17.1 Gene 0 0.59 4.84 1.17 2.84 0.27 0.04 3.49 0.21 0.07 0.96 0.00 0.00 0.15 0.00 0.04 0.00 0.33 0.95 0.32 1.70 0.26 0.00 0.00 2 493123 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 492031 Transcript 0 0.00 2.26 1.41 2.37 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 4 463703 Transcript 0 0.00 2.00 1.08 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.01 1.01 0.71 0.00 0.00 0.00 5 482372 Transcript 0 0.07 0.99 0.36 0.84 0.09 0.00 0.97 0.06 0.00 0.32 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.08 0.11 0.00 0.26 0.08 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 5.13 3.99 1.30 0.00 0.00 5.87 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 1.49 0.08 0.41 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 9 ER1c ExonRegion 0 7.27 26.34 3.11 8.69 2.62 0.00 7.99 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 0.00 1.62 11.74 0.37 10.35 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 2.57 2.81 8.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 3.45 0.43 2.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.40 3.02 2.13 0.00 0.00 0.00 15 E2_Da NovelBoundary 0 6.30 9.54 26.67 3.53 12.39 12.49 60.59 4.72 5.06 22.94 15.85 0.00 21.26 9.30 0.00 0.00 12.16 9.08 17.60 9.08 19.52 5.57 12.80 16 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 Ix Intron 0 1.35 20.19 8.12 10.16 0.43 0.29 4.31 2.05 0.44 0.95 0.31 0.00 2.45 0.00 0.65 0.00 0.00 0.73 1.01 4.39 0.70 0.83 0.23 18 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 1.35 20.25 8.15 10.20 0.43 0.29 4.32 2.05 0.44 0.95 0.31 0.00 2.46 0.00 0.65 0.00 0.00 0.73 1.02 4.41 0.70 0.83 0.23 19 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 1.36 0.75 0.83 1.41 0.48 16.37 1.34 0.75 1.64 1.89 0.00 3.38 0.43 0.33 0.00 1.16 0.30 0.00 0.69 0.00 0.67 0.00 20 Ix Intron 0 1.11 1.77 1.91 1.06 3.73 1.92 21.20 1.35 1.28 3.27 0.34 0.00 2.83 0.47 0.36 0.00 0.57 1.12 1.11 5.18 0.00 0.73 0.51 21 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.96 1.85 2.17 1.39 4.26 1.56 23.33 1.76 1.68 3.86 0.44 0.00 1.76 0.61 0.23 0.00 0.75 1.47 1.01 5.87 0.00 0.65 0.67 22 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4a ExonRegion 0 0.77 7.91 2.26 3.89 0.00 0.00 5.14 0.00 0.00 1.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 3.08 0.53 0.00 0.00 25 E4_Da KnownBoundary 0 3.70 5.99 3.67 3.86 0.00 0.00 10.29 0.00 0.00 3.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER4b ExonRegion 0 1.75 12.33 1.92 7.58 0.00 0.00 5.54 0.00 0.00 1.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 28 E4_Db KnownBoundary 0 0.00 11.64 4.88 12.39 0.00 0.00 17.62 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER4c ExonRegion 0 0.00 4.52 2.81 4.73 0.00 0.00 7.34 0.00 0.00 1.03 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.44 0.00 0.00 0.00 30 ER5a ExonRegion 0 0.25 4.14 0.43 1.29 0.00 0.22 3.88 0.61 0.44 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.33 1.13 2.11 0.50 0.00 0.00 31 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 13.55 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.07 0.00 0.00 0.00 32 ER5b ExonRegion 0 0.22 2.98 1.09 2.53 0.28 0.00 2.92 0.18 0.00 0.96 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.23 0.32 0.00 0.79 0.24 0.00 0.00