Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-674P14.1 Gene 0 0.31 0.20 1.39 2.49 2.50 0.86 6.82 6.19 2.89 2.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 3.44 3.03 0.00 0.10 0.14 2 471265 Transcript 0 0.12 0.03 0.53 0.95 1.06 0.19 3.08 1.94 1.08 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.91 1.10 0.00 0.01 0.02 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.96 1.07 1.41 0.96 2.78 1.35 0.97 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 4 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 3.09 0.00 8.46 0.00 0.00 22.52 7.60 8.30 6.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.15 0.00 3.13 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.30 1.06 0.47 0.00 3.94 1.79 0.32 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 7.33 7.82 0.00 0.00 16.87 4.03 1.48 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 9 ER3a ExonRegion 0 0.09 0.00 0.03 2.90 2.86 0.00 10.39 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.27 3.04 0.00 0.00 0.00 10 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 2.03 1.23 21.57 21.99 1.83 32.70 14.73 6.34 7.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.14 0.00 0.00 0.00 12 Ix Intron 0 0.90 1.65 2.39 19.81 40.95 34.43 34.86 19.26 12.91 12.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.83 5.77 6.73 0.00 0.00 0.45 13 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.90 1.65 2.40 19.84 41.01 34.48 34.91 19.29 12.93 12.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.84 5.78 6.74 0.00 0.00 0.45 14 Ix Intron 0 2.19 0.00 1.51 23.58 44.37 31.55 36.51 23.50 16.03 10.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 3.96 2.21 0.00 0.43 0.00 15 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 1.45 19.73 37.04 34.92 30.17 17.75 12.79 8.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.71 2.99 0.00 0.00 0.00 16 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 5.45 0.00 1.63 29.68 56.00 27.27 46.53 32.40 21.07 12.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.37 4.41 1.10 0.00 1.07 0.00 17 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 2.76 0.00 3.40 20.63 0.00 32.02 12.61 7.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.87 0.00 0.00 0.00 18 ER4a ExonRegion 0 1.21 0.00 2.54 3.63 5.31 0.00 10.23 5.62 6.56 3.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 3.16 4.67 0.00 0.00 0.00 19 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 2.76 5.50 0.00 10.78 0.00 19.12 7.35 1.27 6.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.72 0.00 0.00 2.94 0.00 20 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.34 0.75 0.98 0.00 5.32 7.51 2.67 3.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 1.52 0.00 0.00 0.00 22 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.20 0.17 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER7a ExonRegion 0 0.29 0.38 1.68 3.00 2.71 1.52 7.14 8.79 3.39 2.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 5.29 3.92 0.00 0.19 0.27