Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 CNTN6 Gene 0 0.21 8.48 0.48 0.59 0.00 0.07 0.02 0.00 0.05 0.17 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.23 1.75 0.00 0.13 0.05 2 446702 Transcript 0 0.09 1.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.65 0.00 0.17 0.00 3 397479 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 350110 Transcript 0 0.00 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 413210 Transcript 0 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.00 6 394261 Transcript 0 0.00 0.34 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 485257 Transcript 0 0.00 3.26 0.36 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 0.00 9 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 0.00 13 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER1d ExonRegion 0 0.00 3.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.54 2.87 0.00 0.00 0.00 15 E1_Ae KnownBoundary 0 0.00 9.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER1e ExonRegion 0 0.00 7.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.48 0.00 1.46 0.00 0.00 0.00 17 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 0.00 19 E1a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E1b_E3a KnownJunction 0 0.00 3.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER1f ExonRegion 0 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 0.00 0.00 23 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER3a ExonRegion 0 0.00 3.27 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.89 0.00 6.75 0.00 0.00 0.00 25 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 5.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 0.00 9.52 0.00 0.00 0.00 26 ER3b ExonRegion 0 0.00 7.65 0.91 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.96 0.00 3.41 0.00 0.00 0.00 27 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E3b_E5a KnownJunction 0 0.00 5.33 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER5a ExonRegion 0 0.85 7.27 0.73 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.70 0.00 2.63 0.00 0.00 0.58 32 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 17.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 6.52 0.00 0.00 4.35 33 ER6a ExonRegion 0 0.00 10.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.22 0.92 4.24 0.00 1.21 0.97 34 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 8.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.52 0.00 5.43 0.00 0.00 4.27 35 ER7a ExonRegion 0 0.00 2.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.27 0.00 4.99 0.00 0.00 0.58 36 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 6.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.10 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 37 ER8a ExonRegion 0 0.53 9.04 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.46 0.00 2.00 0.00 0.52 0.00 38 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 5.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER9a ExonRegion 0 0.00 7.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 40 E9_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 42 ER9b ExonRegion 0 0.00 1.37 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER10a ExonRegion 0 0.29 8.30 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.63 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 44 E10a_E11a KnownJunction 0 3.78 24.80 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.23 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 45 ER11a ExonRegion 0 0.40 17.98 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 1.26 0.00 0.00 0.00 46 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 2.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 0.00 0.00 0.00 47 ER12a ExonRegion 0 0.00 6.63 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 3.81 0.00 0.00 0.00 48 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 9.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.82 0.00 0.00 0.00 49 ER13a ExonRegion 0 0.71 14.06 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 1.08 3.54 0.00 0.00 0.00 50 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 12.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 0.00 5.88 0.00 0.00 0.00 51 ER14a ExonRegion 0 0.00 7.10 0.00 1.58 0.00 1.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.84 0.00 2.51 0.00 0.83 0.00 52 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 12.89 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.16 0.00 3.20 0.00 0.00 0.00 53 ER15a ExonRegion 0 0.28 5.94 0.53 1.70 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.18 0.00 3.08 0.00 0.60 0.00 54 E15a_E16a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 3.20 0.00 5.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.28 0.00 9.08 0.00 0.00 0.00 55 ER16a ExonRegion 0 1.42 14.25 0.79 1.02 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.57 0.00 2.27 0.00 0.00 0.00 56 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 15.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.33 0.00 0.00 0.00 57 ER17a ExonRegion 0 0.00 13.51 0.55 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 1.02 1.77 0.00 0.00 0.00 58 E17a_E18a KnownJunction 0 0.00 22.43 2.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 8.18 0.00 0.00 0.00 59 ER18a ExonRegion 0 0.73 12.34 1.53 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.60 0.81 3.74 0.00 0.00 0.00 60 E18a_E19a KnownJunction 0 0.00 0.00 5.32 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.68 4.14 2.43 0.00 0.00 0.00 61 ER19a ExonRegion 0 3.01 9.22 3.42 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.76 0.58 2.04 0.00 0.00 0.00 62 E19a_E20a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 0.00 5.88 0.00 0.00 0.00 63 ER20a ExonRegion 0 0.00 19.14 1.21 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 64 E20a_E21a KnownJunction 0 0.00 11.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 ER21a ExonRegion 0 0.68 9.03 1.55 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.43 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 66 E21a_E22a KnownJunction 0 3.33 5.99 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 ER22a ExonRegion 0 0.16 20.92 0.50 0.89 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.81 0.87 1.85 0.00 0.00 0.00 68 E22a_E23b KnownJunction 0 0.00 29.01 0.00 3.96 0.00 0.00 2.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.62 0.00 0.00 0.00 69 ER23a ExonRegion 0 0.00 5.43 0.72 1.41 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 70 E23_Ab KnownBoundary 0 0.00 8.16 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71 ER23b ExonRegion 0 0.00 24.19 2.51 4.54 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.10 1.45 2.34 0.00 0.00 0.00 72 E23a_E24a KnownJunction 0 0.00 27.82 4.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.14 0.00 0.00 0.00 73 ER24a ExonRegion 0 0.00 21.82 3.50 1.83 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.45 0.00 0.00 0.00 74 E24_Da KnownBoundary 0 0.00 2.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 75 E24a_E25a KnownJunction 0 0.00 50.19 1.83 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 76 ER24b ExonRegion 0 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.45 0.00 0.69 0.00 0.00 0.00 77 ER25a ExonRegion 0 0.00 21.43 1.17 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.26 0.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.87 0.00 0.00 0.00 78 E25_Da KnownBoundary 0 0.00 8.42 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 79 ER25b ExonRegion 0 0.00 9.86 0.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 80 E25_Db KnownBoundary 0 0.00 11.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 81 ER25c ExonRegion 0 0.17 2.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 0.00 0.00 0.33 0.00