Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC122136.1 Gene 0 2.19 1.16 1.09 1.16 1.19 1.53 1.28 1.56 1.15 1.08 4.45 2.83 20.94 1.10 3.26 1.13 2.75 0.94 0.87 0.96 9.90 1.02 2.66 2 417922 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 1.14 0.00 0.76 3 445174 Transcript 0 0.38 0.15 0.22 0.27 0.17 0.37 0.27 0.56 0.10 0.26 1.15 0.91 5.29 0.66 0.76 0.38 0.86 0.07 0.16 0.17 3.36 0.18 1.22 4 451392 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.17 0.56 14.57 0.63 2.20 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.69 0.00 0.00 5 413563 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 2.06 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 6 423530 Transcript 0 2.82 2.70 1.89 2.46 2.13 1.67 2.60 2.06 2.53 2.15 2.39 4.16 23.05 1.53 6.76 2.75 2.59 2.83 2.70 3.33 6.22 1.29 3.35 7 419922 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.43 1.24 0.00 0.48 3.25 2.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 2.27 0.00 1.51 9 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.09 0.00 0.00 0.00 1.36 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 11 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 4.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.29 0.00 0.00 0.00 0.03 0.51 0.00 0.00 0.00 10.43 1.10 4.63 13 E2a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.34 1.12 8.69 1.26 4.41 0.00 3.12 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 15 E3a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 17 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 3.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 18 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.37 0.00 0.00 19 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 5.85 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 6.61 0.00 0.00 2.68 0.00 26.46 0.00 5.19 0.00 0.00 1.66 0.00 8.05 0.00 0.00 0.00 20 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E4a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E5_Aa NovelBoundary 0 124.61 65.58 5.53 13.22 61.29 27.14 52.73 7.80 14.32 11.77 18.11 0.00 5.68 15.19 47.22 71.95 49.74 20.52 82.07 113.45 13.28 47.64 36.71 23 ER5a ExonRegion 0 18.18 15.63 12.85 17.00 14.11 11.66 16.00 14.16 16.19 14.33 5.96 14.01 17.14 9.96 25.31 18.96 11.62 19.41 13.29 20.11 5.34 7.33 14.84 24 E5_Da NovelBoundary 0 18.30 27.76 64.40 35.49 35.48 40.66 46.94 33.23 51.27 9.48 20.53 80.58 122.23 16.25 31.77 25.98 39.27 36.40 36.24 54.84 17.54 12.31 19.04 25 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.59 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.50 7.06 0.00 12.03 0.00 1.66 0.00 2.92 0.80 0.00 0.00 6.17 0.00 2.06 27 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 2.53 0.00 7.79 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 4.10 28 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.65 0.00 0.24 0.03 0.06 0.04 0.00 0.29 0.83 12.23 0.10 20.05 0.07 3.54 0.07 2.72 0.00 0.04 0.00 19.49 0.96 2.07 29 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 3.35 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 13.64 0.00 4.33 0.00 4.77 0.00 0.00 0.00 25.70 2.45 4.10 30 ER8a ExonRegion 0 1.14 0.51 0.00 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 2.96 0.00 7.39 0.00 35.40 0.00 7.54 0.00 0.87 0.00 0.00 0.00 20.65 0.20 2.78 31 E8b_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 32 E8b_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.27 0.00 13.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.36 0.00 4.27 33 E8b_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.17 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 0.00 34 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.70 0.00 26.58 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19.47 0.00 2.94 35 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 1.25 4.08 0.47 0.00 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 1.03 36 E9_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E9a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 I9_AR2 ActiveIntronRegion 0 2.49 1.31 5.14 0.66 3.82 1.58 2.34 3.74 0.38 3.69 0.21 0.00 7.96 0.00 1.29 0.00 1.78 0.59 0.00 0.00 1.99 9.27 0.95 39 I9_SR3 SilentIntronRegion 0 2.02 1.15 5.34 0.38 0.46 1.04 2.53 4.74 0.35 3.87 1.83 0.00 11.31 0.00 0.93 0.00 1.25 0.00 0.00 0.00 2.08 8.43 1.11 40 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 1.05 0.00 0.00 1.38 0.00 0.68 0.89 0.00 1.47 0.00 0.00 15.12 0.00 0.35 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 0.00 0.51 41 E10_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 42 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 0.00 5.72 0.00 24.35 0.37 1.56 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 17.46 0.00 1.30 43 E10_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 2.47 0.00 45.78 2.41 4.45 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 16.93 0.00 0.00 44 ER10b ExonRegion 0 0.20 0.07 0.00 0.19 0.25 0.00 0.00 0.24 0.93 0.32 5.24 1.96 46.92 0.60 1.66 0.28 4.39 0.39 0.15 0.06 11.48 0.61 1.91 45 E10b_E11a KnownJunction 0 0.00 3.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.25 53.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 2.94 16.37 0.00 3.24 46 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 1.63 0.00 9.70 5.63 47.85 0.60 2.88 0.00 8.94 0.00 0.73 0.68 18.12 2.75 0.18 47 E11_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.34 2.05 5.40 19.64 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.16 0.00 0.00 48 E11_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.96 8.66 0.00 0.00 2.14 1.33 0.00 2.32 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.08 0.00 0.00 49 E11b_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.21 12.60 12.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 0.00 0.00 50 ER11b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 5.62 8.66 17.05 0.00 5.28 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 9.22 0.19 0.00 51 Ix Intron 0 0.13 0.39 0.35 0.39 0.00 0.00 0.67 0.16 0.35 0.11 3.06 1.36 22.63 0.17 0.96 0.00 1.88 0.00 0.00 0.00 3.91 0.40 0.74 52 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.13 0.39 0.35 0.39 0.00 0.00 0.67 0.16 0.35 0.11 3.07 1.36 22.69 0.17 0.96 0.00 1.89 0.00 0.00 0.00 3.92 0.40 0.75 53 E12_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.63 0.00 28.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 4.35 54 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.05 1.22 0.00 6.51 4.90 27.46 0.00 1.68 1.84 2.26 0.00 0.00 0.00 4.55 0.00 0.00 55 E12a_E13b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 13.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 56 E12a_E13c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 20.29 0.00 13.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 57 Ix Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.16 0.15 2.00 0.79 20.96 0.12 1.14 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 3.62 0.00 0.00 58 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.16 0.15 2.01 0.80 21.03 0.12 1.14 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 3.63 0.00 0.00 59 Ix Intron 0 0.67 0.22 0.19 0.22 0.00 0.97 1.41 0.82 0.78 0.00 3.08 3.79 22.89 0.00 1.18 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 3.98 1.11 0.31 60 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.68 0.22 0.19 0.22 0.00 0.98 1.41 0.82 0.78 0.00 3.09 3.80 22.94 0.00 1.18 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 3.99 1.11 0.31 61 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.43 1.24 0.00 0.48 3.25 2.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 62 ER13b ExonRegion 0 0.00 0.66 1.08 1.38 0.87 0.86 0.00 1.02 1.76 0.00 7.90 5.71 23.12 0.00 0.72 0.00 1.24 0.00 2.07 0.00 4.53 0.68 3.14 63 E13_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.33 2.70 0.00 2.90 0.00 2.05 0.00 0.00 7.42 0.00 26.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.83 0.00 3.84 64 ER13c ExonRegion 0 0.00 0.00 2.39 3.63 0.00 4.99 6.94 1.29 0.44 0.00 7.53 2.25 27.20 0.00 4.37 0.00 4.84 0.00 2.17 0.00 5.20 0.00 5.40 65 E13_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 2.63 6.30 19.64 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.14 0.00 3.33 66 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.39 1.27 0.00 2.90 0.00 0.00 1.50 0.00 12.16 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 4.39 0.00 0.00 0.00 2.72 0.00 0.00 67 E13a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68 Ix Intron 0 0.37 0.00 1.44 0.00 0.00 0.48 0.00 0.45 0.32 0.15 4.57 0.53 12.96 0.14 1.76 0.00 2.31 0.00 2.23 0.37 9.25 0.18 1.03 69 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.45 0.00 1.53 0.00 0.00 0.39 0.00 0.28 0.24 0.18 4.45 0.65 13.80 0.17 1.72 0.00 2.82 0.00 1.90 0.25 9.42 0.09 1.26 70 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.89 0.00 1.25 0.68 0.00 5.12 0.00 9.25 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 3.76 0.91 8.58 0.62 0.00 71 ER14a ExonRegion 0 3.35 0.00 1.03 0.39 0.47 1.47 0.50 0.00 0.56 0.60 4.87 3.31 15.98 1.34 2.19 0.00 2.22 0.48 0.56 0.00 11.16 0.37 0.57 72 E14_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 4.53 0.00 12.66 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 73 ER14b ExonRegion 0 1.37 0.00 0.39 0.00 0.58 0.00 0.59 0.00 0.60 0.37 2.82 1.92 23.61 0.14 2.31 0.00 2.09 0.00 0.69 0.23 7.23 1.12 3.45 74 E14_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.48 0.00 0.00 2.34 1.33 0.00 4.74 0.00 26.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.71 3.26 5.31 0.00 0.00 75 Ix Intron 0 0.28 0.14 0.00 0.27 0.24 0.29 0.30 0.17 0.33 0.15 1.12 2.84 19.40 0.30 1.00 0.00 1.03 0.12 0.07 0.10 2.76 0.33 0.39 76 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.38 0.06 0.00 0.25 0.32 0.22 0.22 0.23 0.28 0.21 1.36 2.88 16.66 0.24 1.12 0.00 1.40 0.17 0.10 0.13 3.47 0.38 0.30 77 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.47 0.00 0.47 0.00 0.43 0.71 0.00 0.64 0.00 0.63 3.33 31.19 0.51 0.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.56 78 E15_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 7.95 0.00 0.00 0.00 15.14 0.00 3.76 79 ER15a ExonRegion 0 0.60 0.29 1.05 0.29 0.38 1.31 1.51 0.37 0.77 1.70 2.45 2.03 8.90 5.04 4.42 1.69 2.35 0.66 1.35 1.52 11.95 0.59 1.85 80 E15_Da NovelBoundary 0 0.00 3.22 26.88 18.61 0.00 5.34 0.00 25.47 36.17 46.04 0.00 0.00 0.00 0.00 5.56 0.00 4.21 72.17 0.00 3.13 5.56 0.00 3.84 81 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 82 ER16a ExonRegion 0 2.78 1.10 0.90 0.71 1.19 2.06 0.93 2.23 0.17 0.68 3.86 2.80 20.96 0.42 2.38 0.35 2.01 0.00 0.07 0.00 12.03 1.02 2.45