Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC017104.5 Gene 0 12.84 1.43 6.12 4.73 6.84 4.16 2.24 4.11 6.88 4.20 4.88 7.25 3.95 15.51 6.77 8.92 8.33 1.32 3.26 0.48 6.54 4.99 6.00 2 415129 Transcript 0 0.00 0.54 1.48 1.29 0.75 1.15 1.10 1.47 1.76 1.36 2.93 5.71 3.28 2.95 0.56 0.38 0.13 0.25 0.88 0.00 2.42 3.11 2.19 3 418050 Transcript 0 14.80 1.33 5.85 4.96 8.06 6.18 2.42 4.71 7.46 4.60 1.88 6.41 2.12 14.51 4.24 5.55 5.43 1.17 3.68 0.44 7.69 4.28 6.49 4 454416 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 8.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31.06 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 IG11 Intergenic 0 1.96 3.15 3.59 2.86 5.11 4.79 3.85 4.15 5.89 5.54 1.63 2.05 2.89 3.10 1.24 2.36 1.46 2.75 6.95 3.14 8.45 4.60 13.78 6 IG11_SR1 SilentIntergenicRegion 0 5.02 24.12 13.74 14.46 9.52 8.70 8.90 7.13 16.74 12.16 6.11 4.23 7.96 9.74 0.81 8.23 2.61 0.00 10.07 13.46 35.72 17.30 31.35 7 IG11_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 14.99 29.92 30.64 18.59 44.04 46.76 25.54 26.11 28.88 35.39 9.69 7.78 9.53 14.46 10.19 10.04 5.04 20.03 30.20 23.88 48.74 34.74 60.18 8 IG11_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.39 0.59 1.83 1.79 2.39 1.35 2.06 2.97 2.85 2.64 0.37 0.19 0.55 0.50 0.49 1.88 0.87 1.64 3.97 1.79 4.88 2.14 10.38 9 IG11_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 2.26 0.81 0.42 1.79 2.66 0.21 2.31 2.01 8.08 3.48 0.89 0.42 0.79 1.24 0.00 1.09 1.14 2.88 4.67 1.50 4.23 1.83 12.08 10 IG11_SR3 SilentIntergenicRegion 0 5.60 2.74 0.86 3.82 6.49 2.90 3.07 2.60 8.71 10.14 2.36 2.36 3.79 0.60 0.97 1.33 0.00 1.45 12.52 4.33 12.93 5.71 17.56 11 IG11_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 1.20 2.01 1.56 4.07 3.41 3.14 5.21 3.86 8.18 2.71 1.55 0.61 1.64 0.58 0.00 0.80 0.00 1.87 9.05 1.20 8.08 2.97 12.45 12 ER1a ExonRegion 0 0.00 1.21 0.06 0.00 0.00 1.09 1.57 0.08 0.00 0.08 0.00 6.34 9.16 4.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.99 1.71 13 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.31 0.00 4.50 2.55 1.39 1.34 2.32 18.91 47.40 28.96 0.00 0.00 12.53 0.00 4.71 0.00 8.71 2.63 11.10 14 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 3.22 11.59 6.76 14.69 0.00 3.71 3.90 6.51 10.88 0.00 12.30 0.00 7.42 0.00 4.36 0.00 1.62 4.14 0.00 8.28 0.00 7.94 16 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.94 5.87 5.14 3.01 3.49 2.83 5.80 7.03 5.36 4.13 4.50 3.96 5.30 2.26 1.52 0.51 0.99 3.52 0.00 9.69 7.47 7.05 17 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 6.31 15.05 7.42 4.24 4.66 8.52 4.56 8.19 3.79 7.37 12.60 0.00 10.42 8.90 4.36 4.77 2.53 4.33 0.00 2.35 5.94 11.87 18 ER2b ExonRegion 0 3.47 1.20 9.62 5.17 5.72 3.83 1.52 3.96 13.03 3.35 4.90 5.93 2.46 4.45 1.49 1.47 1.15 1.90 1.08 1.05 11.06 6.90 5.90 19 E2_Ac KnownBoundary 0 2.96 0.00 5.62 6.93 8.15 7.84 2.16 6.74 17.25 2.77 4.11 0.00 6.82 6.89 4.45 0.00 4.30 1.95 0.00 0.00 5.81 16.66 12.29 20 ER2c ExonRegion 0 31.05 1.62 8.78 1.60 13.48 2.09 3.33 1.99 7.25 4.54 15.33 12.95 5.72 33.40 27.13 30.84 22.05 2.05 5.03 1.70 4.91 8.55 5.92 21 E2_Da KnownBoundary 0 7.26 0.00 3.96 0.00 0.00 7.72 0.00 1.64 6.39 3.33 0.00 5.55 31.17 7.24 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.91 0.00 4.35 22 E2a_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 8.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31.06 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E2a_E2e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.58 12.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER2d ExonRegion 0 14.80 1.33 5.85 4.96 8.06 6.18 2.42 4.71 7.46 4.60 1.88 6.41 2.12 14.51 4.24 5.55 5.43 1.17 3.68 0.44 7.69 4.28 6.49 25 E2_Ad KnownBoundary 0 3.33 5.79 5.03 16.68 11.97 15.33 2.21 7.64 9.75 6.50 2.16 0.00 0.00 19.42 4.45 3.67 0.00 1.78 12.80 0.00 5.68 0.00 7.60 26 ER2e ExonRegion 0 8.33 3.08 7.83 9.77 5.10 3.17 1.46 4.92 7.78 7.14 10.12 10.03 4.69 30.92 14.28 10.90 18.81 2.55 5.18 0.86 5.68 3.36 5.66 27 E2_Ae KnownBoundary 0 31.71 2.96 10.26 15.15 0.00 0.00 2.03 8.38 4.92 6.93 6.69 12.45 0.00 33.14 18.54 16.15 21.97 4.56 9.13 0.00 5.44 6.12 7.26 28 ER2f ExonRegion 0 20.06 1.38 5.66 4.32 6.66 0.92 1.53 3.07 3.81 1.90 8.97 8.96 7.79 19.27 8.70 21.38 18.88 1.30 1.73 0.00 1.52 3.15 5.47 29 ER2g ExonRegion 0 3.93 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 2.32 0.83 0.00 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68