Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C2orf72 Gene 0 3.66 29.09 27.90 6.25 2.35 64.10 0.07 6.29 46.38 6.62 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 17.58 1.29 17.06 0.00 0.31 0.20 2 477463 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 373640 Transcript 0 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 1.77 0.15 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.42 0.00 0.00 0.00 4 431750 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 463834 Transcript 0 1.14 9.64 2.04 0.31 0.00 16.14 0.00 1.38 11.45 2.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.10 2.42 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 1.77 0.15 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.42 0.00 0.00 0.00 11 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.93 0.00 5.82 0.00 0.00 0.00 12 ER1d ExonRegion 0 0.00 3.99 4.15 0.00 0.00 12.17 0.00 0.00 4.33 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.48 0.00 4.54 0.00 0.00 0.00 13 E1b_E2b KnownJunction 0 0.00 10.20 4.82 0.00 0.00 29.70 0.00 0.00 14.99 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.99 0.00 2.43 0.00 0.00 0.00 14 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 14.54 2.18 2.42 1.91 18.78 0.00 5.52 14.02 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 1.01 0.00 0.00 0.00 15 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 22.56 1.45 7.39 7.81 40.09 0.00 7.72 41.46 6.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 8.69 0.00 0.00 0.00 16 ER2a ExonRegion 0 2.27 19.29 3.60 0.62 0.00 30.45 0.00 2.77 20.92 4.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.07 0.20 4.84 0.00 0.00 0.00 17 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 24.47 1.54 1.33 0.00 73.88 0.00 0.00 20.11 5.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.48 3.95 3.26 0.00 0.00 0.00 18 ER2b ExonRegion 0 0.00 24.98 11.17 0.88 3.62 82.07 0.00 7.16 36.38 6.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 19.88 2.09 14.63 0.00 0.00 0.00 19 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 31.57 32.67 1.27 0.00 57.35 0.00 10.15 59.75 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 33.78 4.42 5.75 0.00 0.00 0.00 20 ER3a ExonRegion 0 3.25 21.12 34.84 8.49 2.39 71.88 0.18 9.80 60.19 10.62 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.11 34.77 3.36 24.11 0.00 0.58 1.23 21 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 48.41 25.84 5.26 4.33 80.01 0.00 4.44 57.61 11.01 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26.53 0.00 27.55 0.00 0.00 0.00 22 ER3b ExonRegion 0 4.96 38.74 36.68 8.25 3.08 80.85 0.05 7.66 58.77 7.90 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 20.23 1.37 21.33 0.00 0.39 0.12 23 ER3c ExonRegion 0 0.00 3.73 2.45 0.00 0.00 8.25 0.00 0.00 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 24 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 1.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 IG8 Intergenic 0 0.19 5.84 5.85 1.78 2.34 23.88 0.12 3.11 24.41 2.12 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.83 0.38 2.64 0.00 0.00 0.00 26 IG8_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.25 5.49 5.92 1.91 1.87 22.99 0.16 2.96 23.99 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.63 0.50 2.67 0.00 0.00 0.00 27 IG8_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 7.55 6.05 1.44 4.25 29.02 0.00 3.91 27.89 4.60 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.77 0.00 2.71 0.00 0.00 0.00