Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC073043.3 Gene 0 0.95 0.41 5.94 0.41 1.74 2.31 6.13 3.35 3.73 0.56 0.55 0.00 0.47 1.77 0.96 0.97 1.07 3.25 1.68 0.78 0.54 0.51 0.24 2 457577 Transcript 0 0.28 0.00 0.72 0.00 0.95 0.18 3.01 1.18 0.36 0.00 0.00 0.00 0.37 0.62 0.00 0.39 0.82 1.05 0.83 0.58 0.29 0.00 0.24 3 417006 Transcript 0 0.62 0.75 5.49 0.74 1.76 1.07 4.37 2.26 4.32 0.88 0.42 0.00 0.00 0.95 1.01 0.65 0.48 3.43 1.17 0.16 0.48 0.87 0.22 4 454153 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 413557 Transcript 0 1.29 0.00 1.61 0.00 0.00 3.32 1.45 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 1.17 0.41 0.83 0.90 0.00 0.54 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.84 0.00 1.51 0.00 2.86 0.53 9.02 3.54 0.90 0.00 0.00 0.00 1.10 1.85 0.00 1.18 2.45 3.15 2.49 1.75 0.88 0.00 0.73 7 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 7.39 0.00 4.07 2.38 3.80 9.90 4.14 0.00 0.00 0.00 6.82 4.71 0.00 0.00 3.65 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 8 ER1b ExonRegion 0 1.41 0.00 6.04 0.00 2.06 5.06 3.93 7.34 4.16 0.57 0.00 0.00 1.66 2.46 0.00 0.00 3.45 5.57 2.17 2.80 0.00 0.00 0.36 9 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 3.03 7.72 0.00 0.00 0.00 17.36 3.37 4.31 0.00 2.68 0.00 6.49 4.94 0.00 0.00 7.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 3.35 0.00 0.00 1.71 1.24 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.62 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 3.68 0.00 0.00 1.23 1.01 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 2.21 0.00 0.00 3.06 0.00 5.56 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 4.79 0.00 0.00 0.00 19.39 1.85 3.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 0.07 3.33 1.37 0.87 0.00 0.98 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 18 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER4a ExonRegion 0 1.33 0.00 0.41 0.00 3.37 1.06 7.39 2.58 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.33 0.00 0.62 0.00 0.05 1.25 0.36 0.00 20 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 4.50 2.55 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.42 0.00 2.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER4b ExonRegion 0 0.45 0.00 7.69 0.00 0.00 2.37 6.91 2.94 2.68 0.00 1.24 0.00 0.00 1.94 1.53 1.79 0.00 1.18 1.25 0.89 0.00 0.00 0.00 23 E4_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 10.32 0.00 0.00 5.68 2.25 0.00 3.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.07 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER4c ExonRegion 0 2.57 0.00 3.22 0.00 0.00 6.64 2.90 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 2.35 0.81 1.66 1.80 0.00 1.08 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 3.35 30.51 1.56 19.69 2.61 4.06 13.88 8.54 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 4.21 4.35 12.52 9.46 0.00 4.65 3.76 26 ER5a ExonRegion 0 1.24 1.49 10.97 1.49 3.53 2.15 8.73 4.53 8.63 1.75 0.85 0.00 0.00 1.90 2.03 1.31 0.97 6.87 2.33 0.31 0.97 1.75 0.43 27 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00