Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC067945.4 Gene 0 15.98 9.57 1.43 4.58 8.66 4.86 4.41 4.80 1.99 2.01 7.20 5.97 6.14 0.96 0.20 0.29 0.00 2.16 0.94 2.09 0.43 1.23 2.30 2 456176 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 429796 Transcript 0 16.87 14.46 2.76 5.16 15.66 8.83 5.89 5.13 1.76 3.63 12.59 2.02 7.26 1.36 0.00 1.12 0.00 3.61 0.83 2.63 0.42 1.33 4.22 4 IG5 Intergenic 0 0.00 0.24 0.00 0.24 0.31 0.43 0.15 1.81 1.51 0.40 5.43 19.75 0.00 0.63 0.76 0.70 0.00 0.65 1.49 0.75 0.00 0.24 0.34 5 IG5_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.24 0.00 0.24 0.31 0.43 0.16 1.81 1.51 0.40 5.44 19.80 0.00 0.63 0.76 0.70 0.00 0.65 1.49 0.75 0.00 0.24 0.34 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 Ix Intron 0 25.26 20.32 2.53 5.07 21.91 7.76 7.26 9.29 4.60 5.57 6.57 6.07 5.26 1.02 0.00 0.21 0.00 1.21 1.11 3.54 0.00 1.16 1.22 8 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 25.32 20.37 2.54 5.09 21.97 7.78 7.28 9.32 4.61 5.59 6.59 6.08 5.27 1.02 0.00 0.21 0.00 1.22 1.11 3.55 0.00 1.16 1.23 9 E2_Aa NovelBoundary 0 62.90 19.08 2.69 3.06 15.79 18.11 20.01 6.45 1.56 5.21 18.64 6.30 0.00 3.00 4.45 0.00 0.00 5.80 4.24 0.00 0.00 2.94 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 16.87 14.46 2.76 5.16 15.66 8.83 5.89 5.13 1.76 3.63 12.59 2.02 7.26 1.36 0.00 1.12 0.00 3.61 0.83 2.63 0.42 1.33 4.22 11 E2_Ab KnownBoundary 0 38.82 22.82 0.00 14.48 26.91 2.84 10.16 3.33 2.69 7.66 17.37 5.40 13.15 2.88 0.00 0.00 0.00 9.29 8.94 2.81 3.15 5.63 12.46 12 ER2b ExonRegion 0 20.27 6.45 1.32 6.98 8.05 5.85 5.48 6.03 2.87 2.62 7.33 9.66 6.50 0.88 0.49 0.00 0.00 3.00 1.77 1.40 0.79 1.66 2.26 13 E2_Da NovelBoundary 0 79.64 6.05 1.39 3.56 32.43 11.58 8.88 14.21 10.94 4.57 7.69 6.15 13.64 4.83 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 8.54 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 Ix Intron 0 24.53 7.54 3.39 3.77 33.50 7.65 3.68 4.78 5.12 2.37 1.79 8.03 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.86 1.48 0.99 0.00 2.90 2.72 16 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 22.05 8.35 3.34 3.52 24.86 0.31 1.08 3.53 6.00 2.75 1.21 6.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 1.95 0.00 1.39 0.49 17 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 41.21 11.18 4.90 5.45 62.04 15.01 7.49 6.91 7.02 3.44 3.50 14.75 1.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 2.59 0.47 0.00 5.79 5.87 18 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 20.90 5.34 4.90 4.94 30.77 16.50 6.12 6.27 3.24 2.29 1.93 6.49 4.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.00 3.91 5.87 19 E3_Aa NovelBoundary 0 6.67 6.51 1.12 0.00 0.00 2.50 1.99 0.00 4.92 4.27 7.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 20 ER3a ExonRegion 0 12.15 11.60 0.65 1.45 4.77 0.65 2.36 3.67 1.31 0.00 3.45 5.48 5.81 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.04 0.00 0.74 1.05