Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	MDH1B	Gene	0	1.46	0.47	3.17	1.43	2.59	6.25	1.43	1.86	3.95	1.93	2.22	4.31	0.60	2.92	3.20	2.24	0.60	0.78	5.90	1.54	1.70	0.89	1.01
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9	ER1a	ExonRegion	0	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00
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11	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1_Ae	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER1b	ExonRegion	0	0.00	2.14	0.13	0.00	0.00	1.35	1.53	0.00	0.39	0.00	1.53	0.00	0.00	5.47	3.66	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77
15	E1_Af	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	13.29	0.00	2.34	1.62	1.67	4.74	0.00	0.00	2.30	0.00	0.00	4.11	0.00	0.00	0.00	3.03	0.00	4.35
16	ER1c	ExonRegion	0	0.00	4.07	1.23	0.00	0.00	5.50	2.65	0.00	1.24	0.00	3.87	0.00	0.00	8.12	8.70	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	1.47	0.00	2.94
17	ER1d	ExonRegion	0	0.00	4.07	1.23	0.00	0.00	7.60	2.65	0.00	1.24	0.00	4.14	0.00	0.00	6.96	8.70	0.00	6.13	0.00	0.00	0.00	2.20	0.00	2.94
18	ER1e	ExonRegion	0	0.26	4.07	1.23	0.00	0.00	9.86	2.65	0.00	1.24	0.00	5.80	0.00	0.00	9.14	8.70	0.00	6.60	0.23	4.38	0.00	2.20	1.82	2.94
19	ER1f	ExonRegion	0	5.76	2.26	1.23	0.00	12.71	41.41	7.32	0.00	3.95	1.05	5.85	0.00	0.00	13.17	7.49	3.63	5.13	2.36	26.10	7.86	5.88	3.24	2.04
20	E1a_E2a	KnownJunction	0	7.33	0.00	1.42	0.00	4.33	49.18	2.25	0.00	3.07	1.67	4.63	0.00	0.00	4.83	18.91	8.63	0.00	4.27	30.49	12.27	0.00	0.00	0.00
21	E1a_E3a	KnownJunction	0	6.67	0.00	0.00	0.00	20.29	22.37	8.66	0.00	4.25	0.00	0.00	0.00	0.00	5.06	0.00	0.00	0.00	0.00	7.62	6.46	6.18	5.51	0.00
22	ER2a	ExonRegion	0	1.82	0.00	2.44	0.00	0.47	7.25	0.23	0.08	2.16	1.29	2.94	1.61	0.00	2.50	3.95	1.53	2.25	1.93	7.13	5.55	0.00	0.00	2.65
23	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.89	0.00	6.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.37	1.02	4.79	0.00	0.00	11.54	8.90	0.00	4.68	1.82	8.28	5.37	0.00	0.00	0.00
24	ER3a	ExonRegion	0	1.00	0.00	4.73	0.00	3.29	7.36	0.73	3.83	4.14	2.19	5.23	2.82	1.77	9.16	8.34	5.55	0.64	3.63	23.62	6.18	4.77	1.64	0.41
25	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	11.35	0.00	0.00	14.48	0.00	0.00	5.35	4.24	2.58	13.95	0.00	12.83	11.50	0.00	0.00	0.00	4.61	9.01	0.00	5.94	3.93
26	ER4a	ExonRegion	0	1.69	1.61	6.32	1.49	2.78	16.69	1.01	3.81	6.01	2.71	6.35	5.77	0.00	9.01	4.99	6.77	1.31	1.30	13.19	4.62	3.91	3.29	3.05
27	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.84	1.50	4.24	4.54	1.81	1.85	1.07	1.21	7.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.85	0.00	3.52	3.76	5.37	2.41	0.00	0.00
28	E4a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E4_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	9.30	0.00	0.00	0.00	0.00	4.61	2.68	0.00	0.00	0.00
30	E4b_E5a	KnownJunction	0	3.70	0.00	5.91	0.00	0.00	12.49	3.93	1.52	1.79	1.45	4.69	0.00	0.00	7.42	13.35	0.00	0.00	1.82	8.09	5.88	2.47	3.12	0.00
31	E4b_E7a	KnownJunction	0	3.41	0.00	3.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER4b	ExonRegion	0	4.23	0.00	7.26	2.73	2.68	8.65	3.40	1.73	2.47	1.15	8.56	0.31	0.34	13.22	7.46	2.97	0.00	3.30	9.56	8.05	3.15	2.08	0.00
33	ER4c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.65	0.05	0.34	0.24	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.53	1.09	0.60	0.34	4.45	0.69	0.81	0.38	0.00
34	ER5a	ExonRegion	0	1.66	1.04	4.18	1.71	0.56	7.76	1.55	1.61	4.33	1.21	6.84	2.51	0.87	6.92	9.52	4.30	0.37	1.84	8.35	2.32	5.00	1.80	2.71
35	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	6.03	1.73	0.00	8.23	0.00	0.00	7.61	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER6a	ExonRegion	0	0.76	0.47	3.56	0.58	1.77	7.08	2.16	2.78	5.61	3.31	0.69	0.61	4.16	0.00	0.00	2.03	1.09	0.00	2.20	0.00	0.03	0.00	0.00
37	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	3.22	3.67	0.00	4.33	8.69	2.25	0.00	6.63	0.00	0.00	6.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER7a	ExonRegion	0	0.55	0.22	6.58	1.95	4.13	7.44	1.76	1.96	5.42	4.04	0.00	5.91	1.20	1.88	0.64	3.72	1.03	0.00	2.97	1.98	2.03	0.00	0.00
39	E7a_E8a	KnownJunction	0	2.82	0.00	7.86	4.13	7.64	5.39	4.37	2.55	5.21	1.67	0.00	11.70	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER8a	ExonRegion	0	3.75	0.00	11.74	3.64	4.45	7.56	2.98	2.79	5.50	3.33	0.70	8.13	0.00	1.74	0.52	2.17	1.20	1.00	5.80	1.55	0.80	0.00	0.63
41	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	8.40	4.13	12.48	0.00	0.00	8.21	5.41	6.53	0.00	18.61	0.00	2.35	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35
42	ER9a	ExonRegion	0	1.67	0.00	7.71	2.02	4.32	3.88	0.00	5.25	4.06	3.42	0.00	2.75	0.00	0.31	0.61	0.00	0.00	0.14	0.00	0.08	0.00	1.04	1.19
43	E9a_E10a	KnownJunction	0	3.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E9a_E10b	KnownJunction	0	0.00	0.00	5.12	0.00	4.33	7.33	0.00	2.51	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	0.00
45	E10_Aa	NovelBoundary	0	121.65	241.47	619.08	858.93	242.02	175.41	456.60	618.49	723.37	567.86	88.71	61.67	57.79	16.72	42.40	172.09	238.62	709.93	207.72	437.83	183.60	84.62	155.28
46	ER10a	ExonRegion	0	1.84	0.00	0.27	0.00	1.55	2.17	0.41	1.25	1.41	0.95	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	2.18	2.99	2.56	0.00	0.00	0.00
47	E10_Da	KnownBoundary	0	7.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.26	1.93	1.30	1.02	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00
48	ER10b	ExonRegion	0	0.70	0.53	0.56	1.06	2.09	4.43	1.20	2.00	2.39	0.04	0.26	5.61	0.00	0.51	2.15	0.77	0.00	0.48	0.39	0.00	0.00	1.11	0.00
49	E10_Ab	KnownBoundary	0	3.78	0.00	1.54	0.00	0.00	2.16	0.00	2.22	3.12	0.00	0.00	17.71	0.00	7.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	ER10c	ExonRegion	0	9.36	0.00	4.36	2.75	19.64	4.51	1.06	3.73	4.67	1.95	5.33	8.83	3.66	4.03	4.12	11.77	0.00	0.00	0.00	0.77	1.23	3.08	0.00
51	E10b_E11a	KnownJunction	0	12.22	0.00	1.66	5.26	11.80	5.62	1.85	2.22	4.05	3.28	0.00	12.00	0.00	2.88	0.00	8.20	0.00	0.00	0.00	3.13	3.15	0.00	0.00
52	E10b_E11b	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER11a	ExonRegion	0	8.47	0.00	2.76	4.09	18.73	3.67	1.32	1.73	4.94	2.29	5.80	12.99	1.17	1.62	0.00	14.86	0.00	0.00	0.00	2.13	2.20	0.00	0.00
54	ER11b	ExonRegion	0	1.43	0.00	4.83	2.94	2.63	6.71	2.22	5.93	4.22	2.61	0.09	15.92	0.14	1.62	0.54	1.69	0.00	0.00	7.20	0.95	0.64	0.00	2.12
55	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	7.16	1.90	0.00	2.90	0.00	12.49	4.95	3.71	0.00	25.96	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	14.31	0.00	0.00	0.00	0.00
56	ER12a	ExonRegion	0	1.79	0.55	4.05	4.22	7.00	7.61	2.90	4.80	7.92	5.85	1.27	14.43	0.00	2.43	3.14	1.19	0.36	0.00	6.47	0.43	0.44	1.25	1.22
57	E12_Da	KnownBoundary	0	3.19	3.22	0.00	2.06	0.00	16.01	0.00	0.00	7.99	1.32	2.37	0.00	0.00	4.94	0.00	0.00	4.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
58	ER12b	ExonRegion	0	4.03	2.03	1.23	2.73	5.52	9.46	2.32	0.00	7.76	5.38	1.93	18.81	0.00	1.62	0.00	0.00	2.37	0.00	6.37	0.00	0.00	0.00	0.00
59	E12_Db	KnownBoundary	0	3.78	0.00	3.31	0.00	7.98	0.00	6.49	0.00	8.80	7.39	0.00	37.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.22	0.00	0.00	0.00	0.00
60	ER12c	ExonRegion	0	1.24	0.27	1.29	1.15	2.28	4.90	1.69	0.66	5.24	1.91	0.27	4.06	0.50	0.17	1.05	0.00	0.00	0.00	4.77	0.00	0.57	0.54	0.75
61	E12_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	4.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
62	ER12d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.19	0.00	0.00	0.00	0.05	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00