Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC092162.3 Gene 0 0.90 0.43 0.19 0.88 0.85 1.26 1.49 0.67 1.76 0.18 0.06 2.01 0.15 0.03 0.00 0.26 0.13 0.00 2.39 1.01 0.23 0.18 0.00 2 451851 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 1.65 0.00 0.00 1.02 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.64 0.62 0.61 0.00 3 428283 Transcript 0 1.39 0.40 0.04 0.95 0.59 1.20 0.91 0.71 0.89 0.05 0.01 1.67 5.59 0.01 0.00 0.47 0.04 0.00 1.12 0.52 0.05 0.04 0.00 4 438143 Transcript 0 0.00 0.00 0.20 0.11 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 5 430460 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 1.41 1.43 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 2.03 1.44 0.00 9 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 7.58 3.32 1.67 13.42 4.39 17.14 5.73 9.96 9.27 4.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.69 8.74 3.57 0.00 1.89 0.00 10 I1_AR2 ActiveIntronRegion 0 8.55 1.95 3.36 13.47 8.72 20.81 8.56 7.09 5.69 5.99 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 0.00 0.00 1.96 27.85 3.62 0.00 1.10 0.00 11 I1_AR3 ActiveIntronRegion 0 13.87 3.77 7.35 12.47 12.19 24.31 8.88 5.19 6.18 5.78 0.00 3.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.70 16.87 5.91 0.00 0.00 0.00 12 ER2a ExonRegion 0 0.88 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.55 1.08 0.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 1.78 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 15 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E3a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.62 3.60 0.00 0.00 2.36 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 1.04 1.08 1.02 0.00 18 E4a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.00 0.00 0.00 22 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E7_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.61 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E7a_E7b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E7_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER7c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.50 0.00 1.39 0.00 0.93 0.60 1.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 1.76 1.11 1.08 0.00 0.00 29 E7_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 2.16 2.55 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E7b_E7c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER7d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.85 0.81 1.85 0.85 0.84 1.40 1.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 1.84 0.13 0.00 0.00 32 E7_Dc KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 2.06 3.90 2.90 0.00 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.75 0.00 0.00 0.00 33 ER7e ExonRegion 0 2.52 0.61 0.00 0.39 1.03 2.48 0.86 0.66 1.71 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 3.65 3.10 0.66 0.00 0.00 34 E7_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.96 1.77 1.30 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.02 0.00 0.00 3.67 2.75 0.00 0.00 0.00 35 ER7f ExonRegion 0 0.86 0.49 0.17 1.02 0.85 1.24 1.81 0.69 2.02 0.22 0.06 2.49 0.05 0.04 0.00 0.21 0.17 0.00 2.71 0.88 0.20 0.17 0.00 36 E7_Ac KnownBoundary 0 2.74 6.51 7.89 1.70 0.00 0.00 4.33 0.00 4.83 2.77 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 6.52 0.00 0.00 0.00 37 ER7g ExonRegion 0 0.25 1.14 0.00 0.23 2.22 0.00 3.05 0.00 1.07 0.00 1.11 1.91 4.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.75 1.62 0.00 0.00 0.00 38 E7e_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 E7e_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 E8_Aa NovelBoundary 0 0.00 2.70 0.00 7.26 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER8a ExonRegion 0 4.70 1.11 0.00 2.76 1.49 3.58 1.84 2.15 1.54 0.00 0.00 4.19 1.85 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 1.78 1.19 0.00 0.00 0.00 42 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.99 0.55 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00