Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC010127.1 Gene 0 1.10 1.62 0.80 1.38 2.29 1.17 4.51 0.77 0.59 0.71 0.27 1.08 0.34 0.55 0.94 0.59 0.72 0.26 1.14 0.93 0.09 0.21 0.41 2 440322 Transcript 0 1.98 2.88 0.35 1.33 1.29 1.11 4.05 0.99 0.24 0.32 0.97 2.47 0.19 0.63 0.48 0.64 1.13 0.26 2.61 0.56 0.00 0.00 0.54 3 446624 Transcript 0 0.45 0.00 0.27 0.43 0.56 0.39 5.48 0.00 0.28 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.54 0.00 0.70 0.00 0.67 0.90 0.00 0.00 0.00 4 443032 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.02 0.80 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 2.98 3.94 0.00 1.32 0.00 0.97 3.81 1.30 0.00 0.00 1.93 4.19 0.00 0.81 0.45 0.93 2.06 0.52 4.28 0.27 0.00 0.00 0.73 6 E1_Ac KnownBoundary 0 16.00 6.45 1.12 3.23 0.00 2.84 10.95 4.72 1.13 1.24 2.53 6.00 0.00 4.83 4.45 3.67 8.51 3.61 8.66 2.62 5.00 0.00 7.51 7 ER1b ExonRegion 0 8.47 4.07 0.00 2.73 0.00 1.83 6.18 3.46 0.00 0.00 1.93 4.33 0.00 3.25 2.90 2.97 6.60 3.70 6.37 2.13 0.00 0.00 2.94 8 ER1c ExonRegion 0 3.43 4.30 3.52 4.18 5.18 3.34 10.90 3.98 3.04 3.30 3.36 3.14 1.06 3.15 5.28 4.71 5.91 2.64 3.55 2.29 1.22 2.87 1.44 9 E1_Da NovelBoundary 0 10.74 6.38 8.52 2.83 16.21 11.13 19.92 2.14 6.28 2.87 7.74 5.85 0.00 5.36 0.00 11.79 4.77 0.00 3.48 2.94 0.00 0.00 3.76 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2_Aa NovelBoundary 0 14.00 3.03 0.00 2.00 4.33 0.00 7.55 4.31 0.00 8.73 2.53 5.85 0.00 4.53 6.18 4.19 8.32 0.00 0.00 2.81 0.00 3.00 6.49 13 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.07 2.39 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 0.00 0.00 0.00 0.00 3.01 0.00 0.00 1.82 0.00 0.00 0.00 14 E2_Da NovelBoundary 0 15.48 16.51 0.00 6.79 24.28 0.00 57.32 4.19 4.17 3.76 2.68 12.00 6.82 7.71 4.45 11.02 0.00 0.00 4.80 8.31 0.00 3.12 0.00 15 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.64 1.36 5.21 0.68 1.79 1.61 11.94 2.88 0.67 1.91 4.46 14.10 7.87 2.14 0.78 1.99 5.52 1.01 4.79 4.86 1.11 1.83 2.26 17 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.83 0.00 0.94 0.00 1.10 0.00 0.19 0.00 0.00 1.25 0.00 0.00 2.58 0.00 0.00 0.97 2.24 0.75 0.00 0.00 1.03 18 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 2.25 0.00 1.53 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER3b ExonRegion 0 0.45 0.00 0.27 0.43 0.56 0.39 5.48 0.00 0.28 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.54 0.00 0.70 0.00 0.67 0.90 0.00 0.00 0.00 21 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER5a ExonRegion 0 1.92 0.32 0.00 2.14 0.00 0.79 3.56 0.00 0.18 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 24 E5_Da KnownBoundary 0 7.04 3.29 0.00 2.06 0.00 0.00 8.48 0.00 1.36 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 25 ER5b ExonRegion 0 0.99 1.83 0.70 1.34 2.59 1.24 4.30 0.68 0.47 0.65 0.00 0.75 0.39 0.45 0.51 0.35 0.19 0.00 0.93 0.85 0.00 0.00 0.34