Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC131180.3 Gene 0 0.00 0.00 120.34 0.32 0.42 0.00 29.10 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 21.88 6.77 0.33 0.00 0.16 0.00 2 425399 Transcript 0 0.00 0.00 35.09 0.36 0.00 0.00 6.85 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.92 2.34 0.09 0.00 0.09 0.00 3 454095 Transcript 0 0.00 0.00 46.19 0.00 2.99 0.00 10.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 4.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 67.63 0.00 0.00 0.00 27.40 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.70 8.42 0.63 0.00 0.62 0.00 5 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 35.30 2.06 0.00 0.00 15.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20.40 7.53 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 34.86 0.00 0.00 0.00 6.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 3.58 0.00 0.00 0.00 0.00 7 Ix Intron 0 0.41 0.20 27.49 0.00 2.57 1.15 28.48 1.12 0.18 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 6.72 1.23 5.22 0.00 0.00 0.00 8 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.53 0.25 27.72 0.00 3.33 1.48 33.68 1.44 0.23 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 6.44 0.99 6.75 0.00 0.00 0.00 9 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 48.65 0.00 0.00 0.00 9.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.88 2.10 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 14.08 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 Ix Intron 0 1.23 0.00 53.78 0.00 14.30 1.38 61.91 1.65 0.11 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.08 0.93 5.19 0.00 0.00 0.00 13 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 3.47 0.00 68.23 0.00 43.50 2.15 155.06 1.81 0.43 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.75 9.46 0.00 0.00 0.00 14 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 30.36 0.00 0.00 0.00 12.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.90 0.00 5.20 0.00 0.00 0.00 15 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 38.77 0.00 0.00 0.00 20.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.70 0.00 4.64 0.00 0.00 0.00 16 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 1.16 0.00 64.35 0.00 9.93 3.04 76.53 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.32 2.14 4.00 0.00 0.00 0.00 17 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.11 1.13 35.98 0.00 6.36 1.45 53.62 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.33 3.53 2.02 0.00 0.00 0.00 18 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 34.10 0.00 0.00 0.00 5.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.58 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 59.28 0.00 0.00 0.00 54.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23.92 3.86 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 54.98 0.49 0.00 0.00 10.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.03 3.90 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 67.35 2.06 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E4_Aa NovelBoundary 0 10.22 14.87 382.54 0.00 20.12 12.27 225.67 6.04 8.04 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30.05 75.30 24.80 0.00 0.00 0.00 23 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 27.13 0.00 1.65 0.00 7.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.60 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E4_Da NovelBoundary 0 3.04 5.39 109.66 0.00 3.40 0.00 58.78 9.08 6.86 1.61 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 20.52 0.00 2.62 2.53 2.51 0.00 25 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 65.25 0.00 4.33 0.00 14.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 48.82 0.00 0.00 0.00 45.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 179.84 0.62 2.44 0.00 58.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29.07 3.75 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 193.10 0.00 0.00 0.00 27.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38.68 4.42 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 260.24 0.60 0.00 0.00 48.73 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45.40 12.65 0.63 0.00 0.00 0.00 30 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 6.74 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00