Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC010890.1 Gene 0 1.58 4.44 7.27 4.62 2.96 0.33 2.26 1.00 0.88 3.48 0.06 0.00 0.00 0.04 0.77 0.00 0.69 0.55 0.57 0.89 0.00 0.00 0.09 2 454699 Transcript 0 0.00 0.77 1.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.70 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 0.00 0.60 0.40 0.00 0.00 0.00 3 432414 Transcript 0 4.25 7.06 10.08 3.90 4.42 0.34 3.93 1.69 0.35 4.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 4 435102 Transcript 0 0.19 1.43 2.21 1.16 1.16 0.00 1.46 0.20 0.36 1.16 0.02 0.00 0.00 0.02 0.16 0.00 0.51 0.65 0.19 0.12 0.00 0.00 0.03 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 1.54 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 1.39 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 1.20 0.80 0.00 0.00 0.00 6 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.51 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.53 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.22 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.44 0.26 0.16 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.01 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 1.60 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER2c ExonRegion 0 0.00 1.12 2.49 1.42 0.78 0.00 2.03 0.84 1.28 2.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 3.35 5.38 0.00 3.14 0.00 4.37 0.00 0.00 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 2.84 4.48 14.72 8.63 5.99 0.86 4.86 1.69 1.84 10.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 0.00 2.22 2.64 0.08 1.11 0.00 0.00 0.00 15 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 20.92 29.72 20.88 23.94 2.90 8.26 0.00 0.00 14.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 7.44 12.48 27.75 17.53 10.12 3.88 5.74 2.92 0.94 10.80 0.00 0.00 0.00 0.00 2.40 0.00 0.00 1.21 1.72 2.86 0.00 0.00 0.00 17 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 17.04 33.03 19.38 8.32 0.00 14.57 4.35 2.66 18.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.07 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 3.63 21.51 33.65 19.25 10.42 0.00 8.57 4.06 0.59 15.22 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.93 0.23 4.73 0.00 0.00 0.00 19 E5_Da NovelBoundary 0 6.67 35.19 47.46 19.74 7.89 0.00 1.90 3.74 3.53 12.76 0.00 0.00 0.00 0.00 4.57 0.00 0.00 2.45 3.58 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E5b_E6a KnownJunction 0 13.85 21.05 28.36 11.29 3.31 0.00 8.44 3.49 1.22 11.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.14 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E5b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5b ExonRegion 0 6.35 23.48 33.36 10.73 2.93 0.00 3.67 2.01 1.24 10.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.00 1.73 3.19 0.07 0.00 0.00 0.00 23 ER6a ExonRegion 0 3.14 7.21 10.79 4.31 14.36 1.38 7.30 3.28 0.20 6.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E6_Da NovelBoundary 0 14.60 25.06 43.91 37.99 19.95 11.41 5.70 0.00 1.48 18.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.93 0.00 0.00 5.82 0.00 0.00 0.00 25 Ix Intron 0 4.17 10.59 22.73 17.40 11.31 0.74 6.13 1.64 1.92 8.71 0.45 0.00 0.22 0.42 0.51 0.00 0.57 0.21 3.87 0.86 0.26 0.00 0.34 26 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 2.77 16.99 30.59 23.72 11.01 0.00 6.33 4.12 2.63 12.77 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 1.98 0.44 2.82 1.25 0.08 0.00 0.68 27 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 5.49 10.37 23.53 18.21 12.89 1.18 6.70 1.03 1.84 8.46 0.71 0.00 0.36 0.67 0.38 0.00 0.16 0.17 4.50 0.89 0.37 0.00 0.28 28 ER7a ExonRegion 0 0.00 1.47 3.32 2.94 1.94 0.00 1.44 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.39 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E7_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 14.99 9.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER8a ExonRegion 0 1.15 2.62 2.10 2.61 1.09 0.00 0.90 0.35 0.87 0.58 0.13 0.00 0.00 0.09 0.94 0.00 0.67 0.00 0.00 0.72 0.00 0.00 0.20