Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC079776.3 Gene 0 1.01 0.74 6.01 1.00 0.79 4.50 3.23 1.76 2.52 2.80 0.02 0.09 0.25 0.07 0.09 0.08 0.09 3.75 0.37 1.32 0.00 0.67 0.46 2 412425 Transcript 0 0.23 0.10 2.63 0.31 0.29 1.80 0.85 0.36 1.17 1.54 0.00 0.00 0.07 0.20 0.02 0.22 0.02 1.82 0.08 0.29 0.00 0.33 0.58 3 448102 Transcript 0 1.29 0.51 4.70 0.45 0.66 3.54 1.41 1.37 1.47 1.14 0.08 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.12 0.23 0.00 0.61 0.17 4 433431 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.78 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E1_Ab KnownBoundary 0 92.83 220.03 124.86 201.37 105.09 671.03 340.27 163.43 290.42 147.42 301.02 303.10 136.84 193.71 121.27 141.84 174.01 274.46 136.10 423.00 343.05 399.67 265.91 7 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1_Da KnownBoundary 0 54.75 171.15 98.46 175.27 124.11 404.26 271.73 106.30 242.42 100.28 230.64 116.44 106.81 144.62 56.99 153.98 194.86 388.83 114.54 310.00 322.42 358.09 233.55 9 E1a_E1c KnownJunction 0 0.00 0.00 8.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1_Ac KnownBoundary 0 69.64 278.04 87.34 130.59 97.11 425.72 270.14 158.79 227.86 118.49 235.11 74.57 41.23 197.83 66.88 131.85 217.02 532.39 136.95 428.25 348.86 325.82 276.32 12 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 1.44 0.02 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1_Db KnownBoundary 0 3.70 47.49 13.63 7.52 18.93 145.31 92.08 16.27 22.14 13.86 34.59 5.85 0.00 34.08 21.14 64.09 21.22 108.86 36.80 88.53 83.15 166.68 42.94 14 E1b_E1d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER1e ExonRegion 0 1.37 0.76 5.04 0.01 0.41 4.15 1.96 1.09 1.75 1.17 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 0.69 0.00 1.24 0.16 16 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 18.10 0.00 8.66 0.00 2.25 2.38 4.40 10.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER1f ExonRegion 0 2.26 2.03 30.51 4.57 2.04 6.32 6.61 3.83 8.38 4.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.40 1.14 1.53 0.00 2.68 1.05 18 E1_Dc KnownBoundary 0 0.00 2.96 24.10 6.19 0.00 0.00 3.89 7.27 10.30 2.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.95 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 19 E1c_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 5.14 0.00 0.00 2.50 0.00 0.00 1.65 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER1g ExonRegion 0 2.49 0.78 9.00 1.34 1.57 6.46 2.27 3.03 2.64 2.25 0.23 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.98 0.37 0.00 0.00 0.59 0.35 21 ER2a ExonRegion 0 1.39 0.00 3.00 1.34 1.76 0.77 2.61 0.85 1.42 1.88 0.00 0.00 0.00 1.76 0.00 1.96 0.00 2.21 0.00 0.00 0.00 2.74 4.83 22 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.19 0.00 0.00 1.50 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E3a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.98 5.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 6.94 1.47 0.00 5.67 4.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 7.86 0.00 3.99 5.39 2.12 0.00 10.97 7.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER4c ExonRegion 0 0.65 0.93 5.86 1.49 0.88 5.23 5.04 2.36 2.98 4.50 0.00 0.00 0.59 0.00 0.22 0.00 0.20 6.13 0.68 2.60 0.00 0.26 0.36