Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 LYPD1 Gene 0 2.64 1.25 15.91 0.26 1.75 4.46 4.40 9.31 3.39 4.95 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 4.61 12.06 5.99 7.06 0.18 13.17 11.98 2 345008 Transcript 0 0.00 1.61 2.26 0.00 0.00 1.21 1.23 3.37 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.48 0.41 5.31 0.00 14.52 17.30 3 397463 Transcript 0 2.04 0.61 11.17 0.11 0.95 3.35 2.53 6.47 2.06 2.43 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 1.53 3.76 3.74 3.25 0.00 6.26 6.65 4 449209 Transcript 0 0.31 0.00 1.33 0.00 0.20 0.00 1.73 1.01 0.72 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 4.97 2.88 2.41 0.00 2.93 0.44 5 409034 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.19 1.12 0.00 0.00 0.20 0.38 1.64 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.81 2.43 0.00 6.74 6.94 7 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 3.03 3.40 0.00 0.00 2.21 2.08 5.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.39 0.00 8.18 0.00 22.29 27.66 8 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2b ExonRegion 0 2.32 1.12 3.58 0.00 0.00 3.02 1.45 1.41 0.00 3.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.79 2.54 2.71 1.17 0.00 2.08 1.20 10 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.39 0.00 4.80 0.00 0.00 2.51 3.59 11 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.41 7.23 0.00 0.00 1.14 0.00 0.00 0.40 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.71 3.62 1.47 1.49 0.00 0.46 3.29 12 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 2.70 8.04 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 1.36 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 6.96 0.00 2.49 0.00 0.00 8.71 13 E2a_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2d ExonRegion 0 0.91 0.78 11.29 0.00 0.43 0.72 0.87 4.99 2.14 3.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.37 11.97 3.84 8.69 0.00 7.89 6.09 15 E2_Ad KnownBoundary 0 2.74 0.00 28.27 0.00 0.00 4.66 1.90 10.06 1.62 6.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.07 41.33 8.19 11.57 0.00 17.21 27.83 16 ER2e ExonRegion 0 3.93 0.00 31.18 1.20 8.42 7.10 6.39 14.18 7.07 12.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.31 46.27 13.85 17.30 0.00 27.36 30.26 17 E2_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.60 0.00 3.26 0.00 3.12 0.00 18 E2b_E3a KnownJunction 0 6.00 0.00 45.86 1.53 7.64 7.55 11.97 29.29 15.80 20.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.74 28.64 13.93 20.39 0.00 29.09 34.66 19 ER2f ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.00 0.79 0.00 0.43 1.73 0.11 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 5.92 0.00 1.94 0.00 1.78 0.00 20 E2c_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 4.08 0.00 0.00 0.00 1.77 2.30 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER3a ExonRegion 0 5.32 5.89 48.73 1.12 9.11 13.86 18.93 33.25 14.23 22.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27.46 62.05 20.96 32.21 0.81 45.35 41.13 22 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 6.55 3.67 3.26 0.00 5.94 0.00 23 E3a_E5a KnownJunction 0 6.89 3.35 73.42 1.76 0.00 19.08 15.15 41.32 8.42 25.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32.54 68.61 20.61 30.87 0.00 103.36 56.34 24 ER4a ExonRegion 0 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.71 0.00 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.03 2.56 7.85 4.45 0.00 4.02 1.74 25 E5_Aa NovelBoundary 0 3.33 0.00 6.45 3.00 0.00 22.88 0.00 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 12.71 0.00 11.92 8.88 10.07 26 ER5a ExonRegion 0 2.30 1.61 13.08 0.37 1.14 3.34 4.24 7.19 2.95 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.54 16.70 3.96 5.84 0.70 16.28 10.17 27 E5_Da KnownBoundary 0 3.78 0.00 2.90 0.00 3.90 0.00 0.00 2.34 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.73 0.00 0.00 2.35 0.00 8.02 28 E5_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.07 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER5b ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER5c ExonRegion 0 4.08 1.22 22.33 0.22 1.90 6.71 5.06 12.94 4.12 4.85 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 3.06 7.52 7.48 6.51 0.00 12.51 13.31