Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 PLGLB2 Gene 0 1.48 1.47 2.48 2.24 1.48 2.22 0.93 0.71 2.07 1.60 0.74 1.00 0.90 0.78 0.25 0.44 0.98 1.52 1.15 3.75 2.29 0.88 1.62 2 427160 Transcript 0 10.09 12.25 3.42 2.50 9.37 11.47 9.64 4.00 1.68 0.50 5.52 5.52 3.69 7.86 3.81 3.79 8.31 4.08 1.97 18.92 8.43 2.66 7.49 3 359481 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 410086 Transcript 0 0.42 0.00 0.30 0.83 1.10 0.64 0.33 0.36 0.37 0.34 0.17 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.00 0.50 1.60 1.10 0.20 0.73 5 465361 Transcript 0 1.38 1.12 3.20 3.35 0.54 2.39 0.53 0.01 3.59 2.22 0.39 0.97 1.54 0.55 0.00 0.45 0.67 2.39 1.12 3.94 2.97 1.04 2.05 6 ER1a ExonRegion 0 20.19 24.50 5.58 5.01 18.73 22.95 15.47 7.99 3.35 1.00 11.04 11.04 7.39 15.71 7.62 7.58 16.63 8.15 3.94 37.85 16.86 5.31 14.98 7 E1a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 3.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 I1 Intron 0 9.48 12.36 9.70 28.40 8.39 18.01 10.59 8.16 11.31 7.87 4.14 9.48 13.05 10.16 2.65 7.13 7.82 12.05 17.22 29.61 11.98 5.14 6.39 9 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 7.25 10.34 7.41 26.44 5.11 13.51 8.65 7.57 10.44 6.86 3.27 8.79 14.36 7.80 1.71 5.97 5.57 9.33 13.39 25.05 7.93 4.53 5.32 10 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 21.06 25.57 25.76 46.47 17.86 40.89 14.36 8.82 19.73 11.53 10.10 19.81 17.47 16.36 8.92 7.50 17.16 25.50 36.39 46.97 13.06 11.04 7.12 11 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 13.80 16.08 13.76 31.61 15.38 26.78 14.91 9.55 12.71 10.02 5.72 10.28 9.66 15.27 4.36 9.89 12.38 17.40 24.73 39.09 21.55 6.09 8.91 12 E2_Aa NovelBoundary 0 17.19 6.12 9.99 20.11 0.00 8.01 8.35 6.98 9.49 3.98 0.00 6.30 13.64 4.77 0.00 0.00 8.60 2.49 4.80 22.56 5.13 5.63 4.35 13 E2_Ab NovelBoundary 0 0.00 3.35 3.67 10.09 0.00 16.64 4.50 0.00 3.47 6.58 0.00 0.00 6.82 2.30 0.00 0.00 14.21 2.57 9.51 0.00 6.30 0.00 8.37 14 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 1.38 1.12 3.20 3.35 0.54 2.39 0.53 0.01 3.59 2.22 0.39 0.97 1.54 0.55 0.00 0.45 0.67 2.39 1.12 3.94 2.97 1.04 2.05 18 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER3b ExonRegion 0 1.61 1.72 1.33 0.58 5.05 4.93 2.31 0.18 0.77 0.82 0.01 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 1.30 0.18 0.05 2.46 1.67 0.00 1.11 20 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER4a ExonRegion 0 1.01 0.80 7.89 4.67 2.48 2.78 0.58 3.75 3.05 3.88 2.06 3.08 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 2.40 4.55 8.95 3.50 2.04 2.72 22 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E4_Db NovelBoundary 0 3.19 9.01 1.36 6.73 8.32 23.96 0.00 2.26 7.55 3.01 9.42 18.46 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 4.48 4.05 30.87 2.97 8.27 3.84 24 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 2.68 1.83 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 3.30 0.00 0.00 6.38 4.41 0.00 2.94 26 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 7.82 4.69 1.95 0.05 0.62 3.64 3.03 5.12 1.61 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 1.99 4.82 4.29 2.99 1.94 0.26 27 E5_Da KnownBoundary 0 20.82 0.00 10.29 131.65 7.47 90.52 0.00 3.90 1.36 6.77 0.00 18.46 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 4.80 23.59 5.93 6.00 11.87 28 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.15 0.24 0.27 0.15 0.00 0.00 0.05 0.11 0.28 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.24 0.25 0.13 0.18 30 ER6a ExonRegion 0 1.66 0.00 1.22 1.94 1.73 0.72 0.00 1.44 1.46 1.34 0.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.98 0.00 0.00 0.82 0.00