Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 LBX2 Gene 0 0.36 0.09 1.22 2.32 0.61 1.39 0.60 1.32 1.76 1.83 0.33 0.59 0.78 0.75 1.76 0.85 0.52 1.55 1.00 1.15 2.61 0.77 1.01 2 460508 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.04 0.00 0.02 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 341396 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 4.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 377566 Transcript 0 0.46 0.00 1.01 2.45 0.72 1.65 0.29 1.22 1.69 2.43 0.14 1.30 2.03 1.01 0.62 0.65 0.24 2.31 0.59 1.17 5.03 1.42 1.16 5 479098 Transcript 0 0.43 0.14 0.74 1.92 0.54 3.34 0.90 3.13 2.74 4.02 0.39 0.48 1.04 1.70 3.43 1.41 0.67 1.93 1.94 1.15 0.15 0.14 5.25 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.07 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.07 5.68 0.00 0.00 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 2.12 5.32 0.00 8.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 5.26 3.90 2.78 0.00 2.38 0.00 1.67 0.00 5.25 6.82 2.41 13.35 7.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 4.35 10 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 0.00 4.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1_Db NovelBoundary 0 3.78 3.35 1.83 23.31 3.40 10.51 4.06 6.65 3.18 8.84 0.00 6.30 13.64 2.35 14.46 11.02 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 5.39 0.00 13 E1b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 I1_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.47 0.03 4.84 11.42 8.89 8.90 0.55 4.35 5.66 8.15 0.34 3.01 4.33 4.25 11.16 6.07 0.20 4.56 0.00 3.05 4.24 2.49 2.36 15 I1_SR3 SilentIntronRegion 0 4.39 0.00 5.80 18.25 5.68 9.49 6.11 10.50 8.80 10.37 2.55 1.52 2.56 6.14 6.01 3.80 1.74 1.37 0.00 5.83 1.16 3.20 3.54 16 ER2a ExonRegion 0 0.93 0.00 2.03 4.91 1.44 3.29 0.58 2.44 2.23 4.85 0.28 2.60 4.06 2.02 1.24 1.30 0.48 4.62 1.18 2.34 4.20 2.84 2.32 17 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.80 18.25 3.48 12.49 0.00 2.55 2.89 3.33 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 4.27 4.80 3.26 0.00 7.90 4.27 18 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.15 7.38 1.26 4.75 0.00 1.88 1.78 1.82 0.00 0.00 0.14 1.19 4.86 0.00 0.00 0.65 2.15 1.44 3.82 2.02 3.89 19 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.66 20 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.87 0.00 0.00 21 ER3a ExonRegion 0 0.86 0.28 1.48 3.84 1.09 6.68 1.79 6.27 5.48 8.03 0.78 0.96 2.08 3.39 2.40 2.81 1.34 3.85 3.88 2.30 0.30 0.28 3.85 22 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 2.81 8.46 7.64 10.33 8.70 6.49 3.59 10.80 2.68 0.00 0.00 2.35 4.45 0.00 0.00 17.08 0.00 8.88 0.00 3.00 0.00 23 ER4a ExonRegion 0 0.84 0.14 4.12 6.07 1.30 1.53 1.36 1.89 4.23 2.37 0.88 0.99 0.50 0.87 6.18 2.06 0.93 3.30 2.07 3.07 10.26 2.08 1.61 24 E4_Da KnownBoundary 0 3.26 0.00 1.69 11.09 0.00 0.00 0.00 2.22 7.35 0.00 2.68 7.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.66 4.42 9.52 3.15 3.12 0.00 25 ER4b ExonRegion 0 0.42 1.60 0.49 6.16 4.20 0.00 4.36 0.90 3.93 0.00 0.65 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.57 1.90 0.78 0.93 0.14 26 IG11_SR3 SilentIntergenicRegion 0 5.24 8.43 8.82 22.38 7.37 5.64 6.64 8.21 7.52 7.83 2.96 4.65 1.21 1.27 0.52 4.10 5.65 16.48 9.58 7.92 4.67 3.20 4.99 27 IG11_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 5.34 8.35 6.26 19.98 7.25 7.60 6.67 8.87 6.33 10.96 3.61 4.85 1.40 1.55 2.63 3.43 6.21 14.32 5.41 7.41 1.52 2.26 8.95 28 IG11_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 4.17 3.98 20.31 12.71 1.19 11.85 6.91 6.85 6.42 2.51 2.81 4.69 1.46 0.58 2.97 1.16 9.24 6.37 4.68 2.20 0.00 17.47 29 IG11_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 2.03 2.45 10.22 5.95 0.00 12.06 4.80 3.71 3.89 3.44 5.29 2.08 0.00 0.00 2.31 3.30 6.36 6.37 5.32 1.35 0.00 14.52