Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC016722.2 Gene 0 2.40 0.48 1.65 2.38 0.92 2.64 0.60 1.25 1.09 0.71 1.43 0.26 0.42 0.38 0.33 0.75 0.95 0.33 0.86 0.15 7.39 2.78 2.80 2 422294 Transcript 0 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 490950 Transcript 0 0.00 0.00 0.14 0.00 0.21 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.27 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 0.98 0.00 0.85 0.16 0.90 4 468141 Transcript 0 2.45 0.00 0.12 1.12 0.12 0.28 0.09 0.17 0.04 0.11 0.21 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 2.15 0.05 1.03 5 495449 Transcript 0 1.51 1.33 0.00 0.01 0.00 0.79 0.29 0.56 0.57 0.74 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 1.06 0.00 0.01 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 Ix Intron 0 0.00 0.00 1.11 0.62 0.81 1.12 0.40 0.39 0.28 0.00 0.59 0.00 1.18 0.61 0.00 0.45 0.00 0.42 0.48 1.30 7.38 0.32 0.89 9 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 1.12 0.62 0.82 1.12 0.41 0.39 0.28 0.00 0.59 0.00 1.18 0.61 0.00 0.46 0.00 0.42 0.49 1.30 7.43 0.32 0.90 10 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.55 0.00 0.00 0.00 0.00 2.14 0.00 0.00 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 0.00 8.28 2.88 8.71 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.42 0.00 0.62 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.82 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 2.94 0.00 2.54 0.48 2.71 12 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 14.76 0.00 3.76 13 E2a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 1.27 0.00 0.24 0.60 0.23 0.56 0.17 0.34 0.08 0.23 0.42 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 0.00 2.02 0.09 2.06 15 E3a_E4b KnownJunction 0 3.63 0.00 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 1.51 1.33 0.00 0.01 0.00 0.79 0.29 0.56 0.57 0.74 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 1.06 0.00 0.01 17 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER4b ExonRegion 0 2.12 1.43 0.00 3.89 0.00 2.57 0.00 0.10 2.08 0.00 0.09 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.34 3.14 0.04 19 E4a_E5a KnownJunction 0 3.26 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.50 5.88 0.00 20 E4a_E5b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER5a ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 2.14 0.00 0.52 0.00 1.98 2.65 0.00 1.93 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.76 5.36 0.00 22 ER5b ExonRegion 0 2.08 1.67 2.53 4.03 2.29 4.16 1.09 3.86 4.88 0.00 3.26 0.00 0.00 0.55 0.84 0.86 1.70 0.00 0.00 0.00 14.88 7.78 1.94 23 E5_Da KnownBoundary 0 3.11 0.00 5.06 6.73 0.00 2.90 0.00 4.72 4.28 0.00 2.58 0.00 0.00 0.00 0.00 3.93 8.60 0.00 0.00 0.00 25.88 3.12 4.35 24 ER5c ExonRegion 0 7.01 1.12 3.95 10.21 2.93 7.02 1.74 2.92 3.74 2.86 5.53 1.48 1.07 1.29 0.76 3.00 5.36 0.04 2.07 0.59 21.58 10.20 9.95 25 E5_Db KnownBoundary 0 3.26 0.00 10.91 6.59 0.00 7.10 2.16 0.00 1.45 1.02 2.16 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 1.62 4.33 0.00 19.09 8.14 0.00 26 ER5d ExonRegion 0 4.61 0.73 5.89 3.49 1.92 7.87 1.50 3.08 1.70 1.21 2.54 0.00 1.38 0.32 1.26 2.13 0.39 1.28 2.39 0.51 17.75 6.27 2.41 27 ER5e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00