Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC073218.1 Gene 0 0.10 0.24 0.00 0.24 0.13 0.13 0.29 0.06 0.00 0.00 0.74 1.54 9.37 57.73 43.63 0.64 52.64 0.15 0.15 0.25 0.05 0.10 0.14 2 423663 Transcript 0 0.08 0.18 0.00 0.30 0.10 0.00 0.23 0.08 0.00 0.00 0.56 2.29 17.75 87.40 55.71 1.07 84.09 0.15 0.15 0.22 0.06 0.08 0.11 3 453774 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 1.24 1.85 9.25 7.81 0.47 8.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 0.19 0.38 0.00 0.00 2.26 1.04 6.53 47.15 29.62 1.30 57.81 0.40 0.47 0.31 0.32 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26.46 47.97 42.28 0.00 98.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 I1_SR1 SilentIntronRegion 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.80 9.74 3.78 15.62 0.16 7.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 I1_SR2 SilentIntronRegion 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 2.05 12.30 0.00 6.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 I1_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 10.49 6.79 10.33 0.00 8.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E2_Ab NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40.50 25.59 0.00 26.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21.11 71.87 44.49 0.00 82.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.26 18.94 116.33 71.45 0.18 105.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.30 19.32 156.10 82.33 3.59 97.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 I2 Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 8.66 2.71 2.83 0.00 15.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 8.66 2.71 2.84 0.00 15.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.82 7.06 4.82 0.00 27.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 0.38 0.92 0.00 0.00 0.48 0.00 0.96 0.00 0.00 0.00 0.52 4.10 15.33 113.91 79.82 0.48 84.13 0.33 0.29 0.77 0.00 0.38 0.53 18 E3_Da NovelBoundary 1 0.00 0.00 5.41 3.53 0.00 10.90 0.00 2.30 6.83 1.48 4.11 0.00 0.00 77.11 25.59 0.00 70.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 I3 Intron 0 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.48 13.35 30.87 28.35 0.35 25.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 1.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.79 29.42 84.29 70.82 0.66 59.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 I3_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 21.86 89.49 68.67 0.73 59.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 I3_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.52 15.33 29.48 30.67 0.43 26.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E4_Aa NovelBoundary 0 21.04 6.18 86.54 49.98 0.00 12.27 23.01 51.79 64.64 53.75 20.22 19.06 14.61 29.55 10.26 63.83 67.51 71.92 22.40 39.37 11.92 8.82 3.84 24 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.96 1.79 14.31 5.70 1.38 10.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 I4 Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 6.48 13.15 5.32 0.11 14.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 I4_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 6.48 13.15 5.32 0.11 14.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 Ix Intron 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 12.32 17.10 13.47 0.11 19.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 8.81 12.64 9.84 0.18 17.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.35 24.18 16.52 0.00 23.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23.74 24.65 23.85 0.00 18.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.82 16.95 19.66 0.00 20.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 5.61 20.23 25.53 0.50 25.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00