Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC008278.1 Gene 0 3.69 0.00 0.46 20.00 0.33 0.23 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.00 0.35 0.51 1.48 0.00 2.63 6.75 57.04 0.00 0.00 0.00 2 438178 Transcript 0 2.49 0.00 0.60 12.90 0.68 0.53 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.25 0.26 0.84 0.00 1.27 5.72 41.53 0.00 0.00 0.00 3 IG38 Intergenic 0 1.75 0.19 0.25 26.34 0.25 0.42 0.12 0.00 0.08 0.16 0.09 0.00 0.00 0.26 0.11 0.00 0.15 1.31 7.32 42.66 0.30 0.00 0.14 4 IG38_SR1 SilentIntergenicRegion 0 1.76 0.19 0.25 26.38 0.25 0.42 0.12 0.00 0.08 0.16 0.09 0.00 0.00 0.26 0.11 0.00 0.15 1.31 7.33 42.74 0.30 0.00 0.14 5 ER1a ExonRegion 0 4.68 0.00 1.52 23.14 0.31 0.52 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 1.36 8.10 66.16 0.00 0.00 0.00 6 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 38.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 39.88 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 3.78 0.00 2.48 18.41 3.65 2.90 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 61.42 0.00 0.00 0.00 8 I1 Intron 0 2.11 0.37 0.17 27.36 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.16 8.64 25.97 0.00 0.00 0.00 9 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 2.11 0.37 0.17 27.41 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 8.66 26.02 0.00 0.00 0.00 10 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 42.85 0.00 0.00 0.00 2.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 18.60 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 5.13 0.00 0.20 35.73 0.78 0.29 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 2.24 0.00 5.21 8.37 77.31 0.00 0.00 0.00 12 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 3.35 0.00 28.53 0.00 0.00 0.00 1.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.93 38.35 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.60 15.15 0.00 0.00 0.00 14 I2 Intron 0 1.52 0.25 0.59 24.80 0.07 0.25 0.21 0.13 0.09 0.47 0.05 0.22 0.05 0.08 0.15 0.07 0.00 0.83 4.14 37.23 0.03 0.00 0.04 15 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 1.52 0.25 0.59 24.80 0.07 0.25 0.21 0.13 0.09 0.47 0.05 0.22 0.05 0.08 0.15 0.07 0.00 0.83 4.14 37.23 0.03 0.00 0.04 16 E3_Aa NovelBoundary 0 3.19 0.00 0.00 40.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.48 41.16 0.00 0.00 0.00 17 ER3a ExonRegion 0 1.66 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 1.95 0.00 0.00 6.64 34.80 0.00 0.00 0.00 18 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.08 42.55 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 80.09 0.00 0.00 0.00 19 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 20.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 3.67 52.60 0.00 0.00 0.00 21 ER4a ExonRegion 0 2.16 0.00 0.00 8.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 1.04 1.52 0.00 2.35 3.25 35.87 0.00 0.00 0.00 22 IG39 Intergenic 0 4.75 1.78 1.64 228.28 1.34 1.20 1.44 0.95 0.54 1.36 0.06 0.38 0.04 0.94 0.92 0.45 0.50 7.52 28.49 163.93 0.34 0.25 0.21 23 IG39_SR1 SilentIntergenicRegion 0 1.91 0.85 0.76 82.40 0.84 0.41 0.88 0.51 0.14 0.65 0.03 0.00 0.00 0.45 0.40 0.23 0.13 3.10 14.25 107.04 0.14 0.00 0.08 24 IG39_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 15.09 6.05 5.69 934.62 3.79 4.41 3.90 2.96 2.72 5.07 0.27 0.76 0.27 2.54 3.33 1.47 2.16 26.10 82.66 412.47 1.25 1.33 0.42 25 IG39_SR2 SilentIntergenicRegion 0 14.22 3.26 2.91 384.50 1.79 3.19 2.54 1.64 0.52 1.61 0.00 3.61 0.00 2.86 1.69 0.80 1.21 17.53 71.67 275.80 0.59 0.84 1.18