Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC096559.2 Gene 0 0.17 0.19 0.41 2.27 0.14 0.00 0.02 0.00 0.22 0.00 12.49 0.87 3.18 10.99 3.50 4.85 0.52 1.55 0.08 0.00 0.09 0.74 0.19 2 429878 Transcript 0 0.15 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.17 0.00 0.00 3.22 0.54 2.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 6.64 0.61 3 438292 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.47 0.00 1.97 3.44 0.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 451644 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.88 2.30 0.93 7.10 0.08 1.69 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 412294 Transcript 0 0.05 0.05 0.12 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 2.12 0.25 0.52 1.96 0.11 1.65 0.00 0.69 0.07 0.00 0.00 0.02 0.03 6 450916 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.19 0.53 1.74 4.61 0.97 4.04 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 7 449986 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 0.00 2.16 4.37 0.52 3.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 412606 Transcript 0 0.63 0.00 0.68 3.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 16.12 1.20 1.95 6.40 3.00 1.34 0.17 1.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 9 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 2.44 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.51 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 7.62 0.00 3.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.68 0.00 12 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.13 0.00 11.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.94 0.00 13 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 2.12 4.45 12.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 14 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.31 7.96 1.06 10.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.45 0.00 15 ER2c ExonRegion 0 0.59 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 5.25 2.18 4.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 3.70 0.00 16 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E3_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.16 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E4_Aa NovelBoundary 0 14.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.58 0.00 0.00 2.35 0.00 3.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 86.08 2.45 6.48 70.93 19.32 22.00 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 1.57 0.00 23 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.58 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E4a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43.54 6.90 0.00 9.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E4a_E8a NovelJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 87.29 0.00 0.00 23.72 0.00 0.00 4.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E4a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58.75 0.00 0.00 34.08 8.90 3.25 4.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E4a_E10a NovelJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.37 0.00 0.00 2.30 4.45 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.63 0.00 0.00 10.42 0.00 0.00 4.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.80 1.07 3.48 6.74 1.95 8.08 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 30 E5_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.50 10.42 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 0.00 31 E6_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.37 0.00 0.00 18.48 9.64 23.50 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 2.82 0.00 32 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.90 0.00 4.32 6.27 1.03 3.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E6_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.21 0.00 0.00 17.36 0.00 4.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.00 0.00 0.00 2.47 0.00 4.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 I6 Intron 0 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.22 0.00 15.45 4.29 1.57 10.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 I6_SR1 SilentIntronRegion 0 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.26 0.00 15.61 4.35 1.59 10.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 32.83 5.23 4.41 29.69 10.67 27.37 2.24 0.00 0.00 0.00 0.84 0.84 0.00 38 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.64 0.00 0.00 9.89 0.00 4.36 3.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 E8_Aa NovelBoundary 0 3.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.79 5.85 6.82 12.83 0.00 16.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 ER8a ExonRegion 0 0.44 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 28.95 0.75 10.69 34.98 15.00 12.62 2.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 41 E8_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.27 0.00 6.82 19.13 0.00 15.38 8.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 2.79 11.76 0.24 5.06 4.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35.73 1.32 13.67 51.35 19.05 14.00 0.90 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 E9_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.32 0.00 8.28 4.94 0.00 7.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.90 0.00 0.00 4.94 4.45 0.00 3.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33.74 0.00 6.14 20.53 4.07 8.40 3.16 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 E10a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 0.00 0.00 4.77 0.00 4.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 E11_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.37 0.00 25.00 5.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 50 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.88 0.00 3.93 4.82 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E11_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.27 0.00 0.00 8.89 0.00 4.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.75 6.13 4.43 3.83 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 E12_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.53 0.00 0.00 4.94 0.00 8.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.52 0.00 0.00 2.61 1.24 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 I13 Intron 0 0.08 0.02 0.12 24.50 0.05 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.97 0.56 1.60 0.92 0.44 0.98 0.14 0.27 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 58 I13_SR1 SilentIntronRegion 0 0.10 0.02 0.18 25.44 0.08 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 1.14 0.65 2.04 1.24 0.64 1.40 0.21 0.22 0.01 0.04 0.01 0.00 0.00 59 I13_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 83.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 1.27 0.80 0.61 0.60 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 I13_SR2 SilentIntronRegion 0 0.07 0.00 0.19 129.06 0.00 0.00 0.02 0.04 0.03 0.00 0.27 0.56 1.62 0.54 0.73 0.64 0.06 0.21 0.06 0.04 0.00 0.00 0.00 61 I13_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 115.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 I13_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 145.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63 I13_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.28 0.00 0.00 98.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.58 1.03 0.00 0.00 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 64 I13_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 36.22 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 I13_SR3 SilentIntronRegion 0 0.11 0.00 0.00 29.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.39 0.27 1.29 0.30 0.21 0.68 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 66 I13_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.22 0.00 21.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 1.17 2.19 0.15 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 ER14a ExonRegion 0 0.30 2.17 2.21 5.72 0.12 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 27.00 0.00 3.18 20.33 3.28 5.45 0.00 6.46 0.00 0.00 0.00 0.44 1.17 68 E14a_E15a KnownJunction 0 3.56 0.00 1.66 8.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49.22 0.00 0.00 14.54 9.64 0.00 0.00 6.43 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 69 E14a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 70 E15_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 24.10 44.65 0.00 0.00 8.83 50.93 55.99 33.31 0.00 0.00 20.78 0.00 4.45 0.00 0.00 5.80 0.00 6.39 0.00 0.00 0.00 71 ER15a ExonRegion 0 0.22 0.00 2.43 9.88 0.64 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 33.79 1.10 7.29 17.41 7.13 4.57 1.01 4.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 72 ER16a ExonRegion 0 0.14 0.14 0.36 3.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 4.05 0.76 1.57 1.11 0.33 0.59 0.00 2.08 0.21 0.00 0.00 0.07 0.10