Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 CTA-299D3.1 Gene 0 1.01 0.57 9.42 3.80 0.08 0.57 7.48 0.51 0.88 0.77 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.17 0.05 3.59 1.07 4.72 0.00 0.06 0.08 2 407505 Transcript 0 0.11 0.00 0.18 0.10 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.53 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 3 463107 Transcript 0 0.51 0.44 6.80 1.78 0.00 0.43 5.83 0.46 0.57 0.26 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.04 0.02 2.51 0.91 2.65 0.00 0.05 0.02 4 467207 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER1a ExonRegion 0 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.56 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 6 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 4.52 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1_Ac KnownBoundary 0 3.63 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 4.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.32 3.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.70 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 9 ER1c ExonRegion 0 1.44 0.87 1.61 0.03 0.00 0.00 6.76 1.37 0.03 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 7.19 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1b_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 0.84 0.00 6.97 5.42 0.00 0.88 10.58 0.06 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.05 1.54 3.64 0.00 0.00 0.00 15 E2_Da KnownBoundary 0 3.78 0.00 19.34 3.56 0.00 0.00 23.45 1.73 3.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.55 0.00 6.46 0.00 0.00 0.00 16 E2a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER2b ExonRegion 0 0.61 1.15 14.16 1.62 0.00 1.41 17.21 1.25 0.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.50 1.73 2.29 0.00 0.00 0.00 18 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 15.26 3.33 0.00 5.79 9.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 3.07 0.00 0.00 0.00 19 ER2c ExonRegion 0 1.20 0.00 11.75 4.45 0.00 2.75 5.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.19 0.00 1.58 0.00 0.00 0.00 20 E2_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 17.47 4.99 0.00 0.00 10.20 0.00 3.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 3.00 0.00 0.00 0.00 21 E2b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E2b_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER3a ExonRegion 0 1.38 0.50 8.12 3.97 0.00 0.24 7.28 0.00 1.19 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 1.87 6.28 0.00 0.27 0.09 24 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 2.89 4.76 0.00 0.00 0.00 4.11 0.00 1.39 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 0.00 2.68 0.00 0.00 4.35 25 ER3b ExonRegion 0 0.85 0.10 9.43 5.23 0.00 0.37 7.59 0.00 0.39 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.02 0.64 4.55 0.00 0.00 0.89 26 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 10.76 11.82 0.00 0.00 8.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 8.95 0.00 0.00 0.00 27 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER3c ExonRegion 0 0.56 0.54 11.74 3.31 0.00 0.48 4.66 1.07 0.69 1.16 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.22 0.12 5.38 0.96 4.67 0.00 0.00 0.00 29 E3_Db NovelBoundary 0 3.78 3.29 11.97 12.12 0.00 8.35 46.46 2.55 2.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E4_Aa NovelBoundary 0 3.78 3.35 8.13 11.29 0.00 10.90 21.82 0.00 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER4a ExonRegion 0 1.78 1.33 8.84 4.72 0.50 0.85 12.71 0.00 0.85 1.27 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.55 0.00 3.77 0.59 4.36 0.00 0.00 0.00 32 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00