Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 TMPRSS6 Gene 0 1.45 0.23 7.40 0.63 1.53 0.41 1.35 6.18 4.76 4.01 2.62 10.84 0.05 0.60 0.26 0.00 0.16 1.85 3.21 1.48 0.96 0.47 0.91 2 406856 Transcript 0 0.00 0.00 2.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 406725 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 405718 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 442782 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 346753 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 381792 Transcript 0 1.41 0.00 0.00 0.00 1.78 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 423761 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 251971 Transcript 0 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 0.64 0.00 0.00 0.81 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 429068 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.55 0.20 0.18 0.83 16.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E3e KnownJunction 0 0.00 0.00 4.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E3e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E3a_E3e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E3_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E3_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER3e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER3f ExonRegion 0 0.00 0.00 1.97 0.00 0.00 0.93 0.33 2.88 2.67 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.64 0.00 0.00 0.00 0.00 4.31 2.72 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 6.91 0.00 0.00 0.00 0.00 4.71 7.57 1.65 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.55 0.00 0.00 0.00 0.00 2.14 6.57 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER5a ExonRegion 0 0.16 0.00 4.65 0.00 0.00 0.00 0.00 4.55 4.61 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 6.24 0.00 0.00 0.00 0.00 6.33 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER6a ExonRegion 0 2.12 0.00 4.61 0.00 0.00 0.00 0.00 6.01 3.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER6b ExonRegion 0 0.32 0.00 4.58 0.00 0.00 0.00 0.00 4.16 4.48 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E6b_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 3.27 0.00 2.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 3.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 1.82 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER8a ExonRegion 0 0.53 0.00 2.81 0.00 0.78 0.00 0.00 1.35 0.46 1.14 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 35 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.28 0.00 3.40 0.00 0.00 5.42 5.61 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.71 0.00 0.00 0.00 0.00 36 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.14 0.00 0.82 0.00 0.00 3.17 3.62 0.92 5.59 15.07 0.00 0.50 1.08 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.82 5.58 2.53 4.21 19.66 0.00 2.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 5.30 6.75 1.99 6.19 13.57 0.00 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER10b ExonRegion 0 0.80 0.00 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 6.65 5.26 0.47 4.85 12.94 0.00 2.14 1.07 0.00 0.00 0.00 1.33 1.11 0.00 0.00 0.00 40 E10a_E11a KnownJunction 0 3.33 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 6.28 7.47 0.00 4.69 23.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER11a ExonRegion 0 0.27 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 9.24 4.92 0.00 1.67 36.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E11_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.01 3.39 0.00 4.26 18.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 E11a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 4.11 1.50 0.00 0.00 12.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER11b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.63 2.69 0.00 1.56 9.16 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 1.38 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER11c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 1.11 0.40 0.37 1.66 25.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 E12_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.46 0.00 0.00 32.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 ER13a ExonRegion 0 1.48 0.00 5.56 0.00 0.93 0.00 0.00 7.07 4.04 0.00 2.20 15.21 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 50 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 4.44 0.00 0.00 0.00 0.00 4.56 0.00 0.00 2.32 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 51 I13 Intron 0 0.29 0.00 3.21 0.27 0.00 0.00 0.54 3.48 2.24 1.16 0.78 13.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.43 0.58 0.60 0.56 0.00 52 I13_SR1 SilentIntronRegion 0 0.29 0.00 3.23 0.28 0.00 0.00 0.54 3.50 2.25 1.16 0.79 13.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.43 0.58 0.60 0.57 0.00 53 ER14a ExonRegion 0 1.05 0.00 3.55 0.03 0.59 0.00 0.00 8.90 4.58 0.51 6.17 36.82 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.04 0.00 54 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 4.46 0.00 4.33 0.00 0.00 7.64 4.48 1.67 9.79 30.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 E15_Aa NovelBoundary 0 10.59 0.00 11.00 0.00 0.00 0.00 1.94 2.09 3.01 2.34 2.00 36.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 0.00 0.00 8.28 56 ER15a ExonRegion 0 0.98 0.00 10.20 0.88 0.68 0.82 0.00 3.15 9.37 1.09 3.93 64.64 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 2.74 0.95 0.00 0.90 0.00 57 E15_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 7.42 0.00 4.33 0.00 0.00 1.89 9.81 0.00 0.00 56.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 3.20 0.00 3.12 0.00 58 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 5.06 0.00 0.00 0.00 0.00 4.56 4.20 0.00 5.16 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 I15 Intron 0 1.10 0.00 4.00 0.42 1.12 0.57 1.11 2.42 2.69 0.45 2.22 19.78 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.29 0.50 0.00 0.12 0.22 0.92 60 I15_SR1 SilentIntronRegion 0 1.11 0.00 4.01 0.42 1.12 0.58 1.11 2.43 2.70 0.45 2.22 19.82 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.29 0.50 0.00 0.12 0.22 0.92 61 ER16a ExonRegion 0 0.00 0.00 4.75 0.00 1.17 0.00 0.00 2.56 6.26 0.00 4.46 14.84 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 0.81 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 62 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.78 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 7.58 0.00 2.42 5.85 0.00 4.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63 ER17a ExonRegion 0 0.64 0.00 6.53 0.00 2.42 0.00 0.40 3.50 6.45 0.00 2.74 6.89 0.00 2.09 0.00 0.00 0.00 0.56 0.79 0.00 0.67 0.00 0.89 64 E17a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 4.97 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 5.73 0.00 0.00 6.30 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 65 ER18a ExonRegion 0 1.12 0.00 5.55 0.38 0.00 0.29 0.01 3.99 3.98 0.88 0.00 7.69 0.00 0.08 0.38 0.00 0.00 0.52 0.70 0.05 0.00 0.00 1.10 66 E18a_E19a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 E18a_E20a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.84 0.00 0.00 0.00 0.00 6.65 3.56 0.00 0.00 12.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68 ER18b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 0.64 0.00 0.00 0.81 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 69 ER19a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 70 E19_Da NovelBoundary 0 3.78 2.43 7.69 0.00 4.33 0.00 2.25 8.83 4.75 6.37 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 19.89 71 E19a_E20a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72 I19_AR1 ActiveIntronRegion 0 6.21 3.21 15.25 1.37 7.85 0.41 5.38 9.93 4.15 15.82 2.18 6.32 0.00 0.91 0.46 0.67 1.49 5.60 5.75 6.24 3.98 2.34 3.98 73 E20_Aa NovelBoundary 0 10.67 0.00 22.77 1.86 3.40 0.00 9.72 21.56 6.54 23.85 9.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.60 11.44 4.24 0.00 0.00 3.06 8.11 74 ER20a ExonRegion 0 1.39 0.76 26.22 2.27 3.91 2.73 2.94 18.61 6.70 15.91 3.85 11.28 0.00 1.00 1.52 0.00 0.00 7.19 10.67 9.52 4.97 1.55 5.47 75 E20_Da NovelBoundary 0 6.08 0.00 17.24 1.70 11.63 0.00 6.62 18.85 9.98 16.25 2.68 0.00 0.00 0.00 0.00 3.93 0.00 8.62 9.32 5.94 6.18 5.08 4.18 76 E20a_E21a KnownJunction 0 3.78 0.00 13.33 0.00 0.00 0.00 0.00 10.51 2.81 0.00 2.53 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 77 I20 Intron 0 3.33 2.40 13.89 3.46 4.21 1.20 4.34 5.74 5.07 8.29 3.04 0.93 0.51 0.68 0.27 0.78 1.73 7.96 7.52 5.02 3.47 4.92 3.85 78 I20_AR1 ActiveIntronRegion 0 3.35 2.41 13.96 3.48 4.23 1.21 4.36 5.77 5.09 8.33 3.06 0.94 0.51 0.68 0.27 0.78 1.74 7.99 7.56 5.05 3.48 4.95 3.87 79 E21_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 12.74 9.22 3.82 0.00 12.54 14.99 7.64 20.68 0.00 0.00 0.00 4.65 0.00 4.36 3.83 6.34 8.85 14.83 0.00 4.96 4.10 80 ER21a ExonRegion 0 5.72 1.04 21.43 2.59 5.81 1.17 6.16 16.39 9.96 16.23 6.24 9.91 0.25 1.08 0.63 0.00 0.84 7.85 12.18 5.68 3.93 1.99 3.18 81 ER21b ExonRegion 0 1.41 0.00 0.00 0.00 1.78 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00