Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 APOBEC3A Gene 0 5.61 1.59 1.98 1.64 2.70 1.34 1.74 12.54 2.37 3.10 0.88 1.79 2.25 1.79 2.14 1.57 1.67 1.78 0.88 1.99 1.72 0.47 1.48 2 495988 Transcript 0 0.08 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.05 0.29 0.00 0.13 0.00 0.27 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 3 402255 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 488758 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 249116 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 396770 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.38 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 1.84 1.99 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.24 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.15 0.86 0.00 0.38 0.00 0.80 0.00 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 1.99 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E3_Ab KnownBoundary 0 6.82 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER3b ExonRegion 0 3.54 0.79 0.00 0.00 2.57 1.42 0.00 7.46 1.42 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E3a_E4a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 13.39 0.00 0.00 0.00 1.86 0.00 0.00 11.52 1.73 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E4a_E5a KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 8.23 0.00 0.00 13.31 1.65 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 5.21 1.05 0.95 1.44 2.86 0.32 0.23 13.53 1.35 2.32 0.00 0.75 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E5a_E6a KnownJunction 0 28.75 0.00 0.00 3.30 16.55 0.00 0.00 33.68 3.07 6.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 8.89 0.00 3.49 0.80 3.44 0.00 0.00 27.34 2.36 5.74 0.85 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER7a ExonRegion 0 8.88 4.06 4.82 3.91 4.93 3.53 4.81 21.98 5.33 6.27 2.43 4.14 6.31 4.66 6.28 4.62 4.89 5.24 2.59 5.84 4.89 1.39 4.35 23 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00