Order	SeqName	SeqType	IsAE	NBL01_MYCN	NBL05_MYCN	NBL09_MYCN	NBL10_MYCN	NBL02	NBL03	NBL04	NBL06	NBL07	NBL08	NBL11_Rel2	NBL11_Rem1	NBL11_Rel1	NBL12_Rel_Left	NBL12_Rel_Right	NBL13_Rel_Left	NBL13_Rel_Right	NBL14_MYCN_Met	NBL14_MYCN_Pri	NBL15_MYCN_Rel1	SKP01	SKP02	SKP03
1	D87015.1	Gene	0	4.63	0.10	0.00	1.01	0.53	0.36	0.33	0.13	2.47	0.00	0.00	776.57	0.00	37.59	0.20	0.00	98.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
2	501268	Transcript	0	4.61	0.23	0.00	0.17	3.81	0.45	0.22	0.00	10.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	501308	Transcript	0	8.23	0.10	0.00	0.14	3.58	2.38	0.26	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	5.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	500223	Transcript	0	16.38	0.00	0.00	1.53	3.50	2.16	1.55	2.12	0.62	0.00	0.00	4890.13	0.00	0.00	2.90	0.00	6.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	499457	Transcript	0	21.16	0.00	0.00	4.41	1.95	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	500479	Transcript	0	8.50	0.00	0.00	0.11	1.13	0.00	0.11	0.14	1.37	0.00	0.00	838.83	0.00	0.00	0.48	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	6.26	0.45	0.00	0.33	0.65	0.90	0.44	0.00	3.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1_Da	NovelBoundary	0	16.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1a_E4b	KnownJunction	0	2.96	0.00	0.00	0.00	6.96	0.00	0.00	0.00	17.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	19.86	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	1.71	1.58	3.43	0.00	0.00	25.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.38	0.00	0.00	0.84	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20	0.00	0.00	114.88	2.90	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix	Intron	1	4.87	0.07	0.18	0.00	1.30	0.18	0.31	0.22	0.09	0.00	0.91	1.85	14.16	1.26	4.73	36.47	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix_SR5	SilentIntronRegion	0	5.07	0.04	0.21	0.00	1.37	0.21	0.33	0.24	0.11	0.00	0.74	1.15	14.66	1.35	3.43	37.31	3.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.33	9.38	0.00	12.57	29.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	4.64	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.89	4.75	10.16	0.40	13.98	31.77	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	1.90	0.77	0.00	0.00	2.60	0.00	0.98	0.00	0.00	0.00	2.77	7.78	12.64	2.05	22.16	34.98	8.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.12	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.99	21.11	0.00	18.86	40.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.12	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	24.17	17.59	0.00	6.77	33.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.38	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	14.17	10.45	0.00	5.67	21.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E2_Ab	NovelBoundary	0	217.30	0.00	1.60	1.76	0.00	8.12	1.81	3.74	1.48	0.00	79.34	68.72	0.00	106.30	144.76	34.18	384.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER2a	ExonRegion	0	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	54.95	0.00	17.62	0.00	0.00	13.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E2_Da	NovelBoundary	0	3838.75	2.50	1.09	20.58	328.61	446.90	68.01	93.32	128.01	19.93	1201.78	34844.35	0.00	1227.39	63633.15	8.20	19258.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E2a_E4a	KnownJunction	0	10.96	0.00	0.00	0.00	6.62	4.20	0.00	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER2b	ExonRegion	0	5.77	0.00	0.00	1.64	1.94	0.00	0.09	1.37	0.13	0.00	0.00	497.74	0.00	36.68	5.40	0.00	13.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E2b_E4b	NovelJunction	0	520.46	2.70	0.00	10.99	41.09	7.50	31.44	20.09	41.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E2b_E5a	KnownJunction	0	42.01	0.00	0.00	7.89	3.90	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E2c_E4b	NovelJunction	0	123.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E2c_E5a	NovelJunction	0	13.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	456.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E2c_E6a	NovelJunction	0	706.64	0.00	0.00	16.15	48.98	655.59	15.02	35.82	72.97	3.06	0.00	10989.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E2c_E6b	KnownJunction	0	24.30	0.00	0.00	1.70	4.33	4.32	1.77	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER2c	ExonRegion	0	7.62	0.00	0.00	4.36	2.68	0.00	1.32	1.73	1.24	0.00	0.00	3653.20	0.00	3.57	5.80	0.00	13.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER2d	ExonRegion	0	8.47	0.00	0.00	1.36	2.68	0.00	1.32	1.73	1.24	0.00	0.00	9780.26	0.00	0.00	5.80	0.00	13.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	Ix	Intron	0	7.26	0.00	0.13	0.00	2.42	0.10	0.76	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	19.25	0.60	0.00	32.21	7.29	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
34	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	7.62	0.00	0.08	0.00	2.41	0.04	0.74	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	18.52	0.64	0.00	33.30	9.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	11.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	23.97	0.00	0.00	53.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.02	0.00	0.29	0.00	2.52	0.29	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	21.89	0.51	0.00	28.58	0.26	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00
37	Ix	Intron	0	315.16	0.07	0.42	1.66	34.64	4.09	5.16	2.36	5.19	0.17	0.00	0.00	29.60	4.77	0.00	169.60	149.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	583.26	0.00	0.89	2.23	47.09	4.03	5.54	4.85	6.60	0.00	0.00	0.00	52.48	4.08	0.00	220.02	165.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	575.53	2.03	0.00	0.31	25.52	3.88	6.72	5.19	6.37	0.00	0.00	0.00	59.71	1.44	0.00	189.53	151.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	223.02	0.05	0.29	1.71	30.33	4.39	5.36	1.56	4.73	0.18	0.00	0.00	19.31	5.35	0.00	155.97	144.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	113.50	0.00	0.00	0.00	31.25	2.48	2.73	0.00	4.21	0.67	0.00	0.00	27.97	3.82	0.00	119.51	146.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER3a	ExonRegion	0	0.64	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	2.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	E3a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	Ix	Intron	1	165.12	0.00	1.18	1.76	30.07	4.56	5.01	1.67	3.78	0.00	0.00	0.00	89.83	5.57	0.00	214.20	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00
45	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	165.47	0.00	1.19	1.76	30.13	4.57	5.02	1.67	3.79	0.00	0.00	0.00	90.01	5.59	0.00	214.63	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00
46	Ix	Intron	1	252.69	0.00	1.53	1.70	47.87	5.83	10.41	5.60	6.46	0.29	0.00	0.00	150.80	2.64	0.00	161.02	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00
47	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	197.39	0.00	1.16	2.55	26.90	5.69	1.88	2.77	4.16	0.00	0.00	0.00	58.87	1.28	0.00	122.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	260.56	0.00	1.58	1.58	50.86	5.84	11.62	6.00	6.79	0.33	0.00	0.00	163.89	2.83	0.00	166.52	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00
49	Ix	Intron	1	87.96	0.00	2.11	0.43	32.18	2.01	6.61	1.41	5.21	0.21	0.00	0.00	235.22	5.29	0.00	136.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	165.24	0.00	1.83	0.68	55.04	1.84	10.41	1.29	2.77	0.00	0.00	0.00	523.99	7.40	0.00	130.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	85.42	0.00	1.35	0.64	32.42	2.71	9.49	0.27	4.46	0.36	0.00	0.00	279.32	4.15	0.00	85.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	73.62	0.00	1.57	0.24	29.02	2.20	4.34	3.31	8.46	0.18	0.00	0.00	146.46	4.64	0.00	216.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	56.95	0.00	4.58	0.00	23.71	1.64	3.67	0.86	4.83	0.28	0.00	0.00	65.56	5.98	0.00	96.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	40.59	0.00	0.80	0.89	8.16	0.00	1.73	1.12	4.01	0.00	0.00	0.00	121.14	4.83	0.00	183.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
55	Ix	Intron	1	9.21	0.00	0.00	0.00	5.12	0.00	0.23	0.90	0.00	0.00	17.83	0.00	0.00	0.00	807.25	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
56	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	9.34	0.00	0.00	0.00	5.19	0.00	0.23	0.91	0.00	0.00	18.08	0.00	0.00	0.00	818.25	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	Ix	Intron	0	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.07	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	135.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
58	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	137.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
59	ER4a	ExonRegion	0	5.50	0.20	0.00	0.27	0.54	0.55	0.53	0.00	1.98	0.00	0.00	0.00	0.00	10.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
60	ER4b	ExonRegion	0	8.37	0.28	0.00	1.34	0.81	0.80	0.83	0.00	5.46	0.00	0.00	271.29	0.00	65.15	0.00	0.00	167.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
61	E4_Da	NovelBoundary	0	1518.64	0.00	1.83	4.20	113.24	87.28	21.51	12.16	164.44	0.00	0.00	1749.87	0.00	861.68	0.00	0.00	1352.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
62	ER5a	ExonRegion	0	0.31	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
63	E5_Da	NovelBoundary	0	44.82	0.00	1.27	1.50	0.00	0.00	0.00	1.73	2.60	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
64	Ix	Intron	0	0.43	0.00	0.37	0.00	1.50	0.66	0.17	0.00	0.09	0.00	0.00	533.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.45	0.00	0.39	0.00	1.56	0.68	0.18	0.00	0.10	0.00	0.00	527.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
66	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1325.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
67	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	546.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
68	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	507.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
69	E6_Ab	NovelBoundary	0	8.59	0.00	0.00	0.00	3.99	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	453.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
70	ER6a	ExonRegion	0	24.87	0.00	0.00	0.34	3.34	0.00	0.33	0.43	4.01	0.00	0.00	2514.34	0.00	0.00	1.45	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
71	ER6b	ExonRegion	0	5.12	0.00	0.00	0.97	0.63	0.32	0.19	0.27	2.46	0.00	0.00	2253.80	0.00	61.85	0.02	0.00	174.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00