Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AP000525.4 Gene 0 0.15 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.39 0.28 0.20 0.77 0.00 0.00 0.07 0.00 0.16 0.00 0.08 0.00 2 477443 Transcript 0 0.11 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.27 0.19 0.13 0.53 0.00 0.00 0.05 0.00 0.11 0.00 0.05 0.00 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER6a ExonRegion 0 1.59 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.04 2.90 2.01 7.94 0.00 0.00 0.69 0.00 1.60 0.00 0.78 0.00 14 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 3.88 12.49 17.60 3.19 0.00 3.79 0.73 0.00 20.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.77 0.99 0.00 0.00 0.00 16 Ix Intron 0 2.45 25.86 38.29 36.33 8.46 1.96 7.48 4.73 0.00 17.14 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.41 5.85 23.44 0.00 0.06 0.17 17 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 2.54 13.83 45.67 37.84 6.91 0.99 6.68 5.56 0.00 20.53 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 0.96 16.35 0.00 0.13 0.00 18 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.48 20.93 20.57 34.66 4.13 3.50 8.73 2.28 0.00 7.80 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.98 9.23 18.94 0.00 0.00 0.00 19 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.92 41.15 35.05 35.17 11.53 2.64 8.06 4.50 0.00 16.01 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.57 10.50 32.94 0.00 0.00 0.40 20 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 Ix Intron 0 1.85 21.76 33.77 14.91 4.69 8.64 8.62 5.55 1.00 56.09 1.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55.29 25.27 34.01 0.00 0.00 0.00 23 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 2.40 16.05 49.31 23.25 4.66 6.77 6.80 8.33 1.19 65.86 2.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 111.88 56.89 62.99 0.00 0.00 0.00 24 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 3.04 40.46 16.52 5.21 1.10 5.52 5.82 0.70 0.99 18.81 2.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 3.56 0.00 0.00 0.00 25 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 6.35 41.35 10.01 8.18 8.03 9.17 22.51 0.00 0.41 17.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28.02 0.00 3.19 0.00 0.00 0.00 26 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 5.29 45.42 10.42 8.18 10.70 7.95 27.14 0.00 0.41 14.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32.64 0.00 3.90 0.00 0.00 0.00 27 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 4.23 44.74 16.34 10.45 13.38 3.36 28.91 0.00 1.24 17.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44.96 2.12 7.45 0.00 0.00 0.00 28 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 1.61 28.77 29.34 24.55 6.99 11.06 14.43 3.16 0.31 76.23 2.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67.91 20.42 26.52 0.00 0.00 0.00 29 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 2.15 21.90 85.71 7.84 10.33 13.04 6.99 6.28 4.49 121.90 1.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51.13 22.67 79.11 0.00 0.00 0.00 30 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00