Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 LA16c-59E1.1 Gene 0 0.13 0.13 22.43 0.13 0.50 0.00 7.06 0.48 0.00 15.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.78 0.20 6.34 0.00 0.00 0.00 2 435410 Transcript 0 0.04 0.04 8.57 0.04 0.19 0.00 2.95 0.19 0.00 6.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.05 0.07 2.74 0.00 0.00 0.00 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 27.84 0.00 1.07 0.00 13.82 0.00 0.00 43.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 12.77 0.00 0.00 0.00 4 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 191.51 1.80 3.74 0.00 49.55 4.56 1.42 139.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27.48 0.00 20.45 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 I1 Intron 0 0.08 0.44 31.39 0.15 1.26 0.00 9.89 0.84 0.07 9.49 0.00 0.00 0.28 0.15 0.30 0.00 0.00 6.43 0.12 2.78 0.00 0.00 0.00 7 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.08 0.44 31.42 0.15 1.26 0.00 9.90 0.84 0.07 9.49 0.00 0.00 0.28 0.15 0.30 0.00 0.00 6.43 0.12 2.78 0.00 0.00 0.00 8 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 88.76 0.00 0.00 0.00 14.71 3.61 0.00 22.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36.60 0.00 14.57 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.56 0.54 58.19 0.54 1.42 0.00 11.61 0.68 0.00 18.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.45 0.85 6.79 0.00 0.00 0.00 10 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 55.50 0.00 0.00 0.00 8.30 0.00 0.00 30.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30.43 0.00 7.61 0.00 0.00 0.00 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 I2 Intron 0 0.08 0.07 16.26 0.00 0.29 0.00 2.86 0.00 0.00 5.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.63 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 13 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 22.52 0.00 1.23 0.00 6.10 0.00 0.00 7.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.57 0.00 2.76 0.00 0.00 0.00 14 I2_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.47 0.45 49.31 0.00 0.86 0.00 10.71 0.00 0.00 23.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.38 0.00 8.70 0.00 0.00 0.00 15 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 16 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 12.61 0.00 0.00 0.00 3.20 0.78 0.00 6.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.53 0.00 6.42 0.00 0.00 0.00 20 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 22 E6_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 14.13 0.00 0.00 0.00 2.25 0.00 0.00 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E7_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 19.28 0.00 0.00 0.00 3.58 1.60 0.00 2.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.24 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 25 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 11.26 0.00 0.00 0.00 9.72 1.00 0.00 19.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.52 0.00 8.20 0.00 0.00 0.00