Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AIRE Gene 0 2.09 0.97 0.87 0.30 0.88 0.45 2.36 0.42 1.03 0.20 0.45 1.11 1.46 0.87 2.03 0.29 1.09 0.34 0.53 1.33 0.40 6.60 13.75 2 291582 Transcript 0 0.37 0.23 0.37 0.51 0.00 0.00 1.53 0.06 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.15 0.00 5.13 12.32 3 468282 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 337909 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 397994 Transcript 0 0.84 0.31 0.77 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.20 0.00 0.00 0.36 0.00 0.11 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.10 4.53 6 329347 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 355347 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 ER1a ExonRegion 0 0.83 0.00 0.23 0.05 0.00 0.00 0.26 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.66 5.22 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.74 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.08 15.71 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.73 0.97 0.00 0.00 1.07 0.00 1.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 8.64 20.74 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 4.20 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.08 18.61 12 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.21 13 ER3a ExonRegion 0 2.08 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.96 0.84 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 8.07 10.18 14 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.95 15 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.46 16 E4_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 0.00 17.21 25.18 17 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.14 7.87 18 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 3.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.25 19.72 19 ER5a ExonRegion 0 0.02 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.73 14.94 20 E5_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.46 2.03 0.00 0.00 0.00 10.96 7.26 21 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.51 22 I5 Intron 0 1.66 0.12 0.22 0.12 0.16 0.00 1.28 1.55 1.00 0.21 0.00 0.22 0.00 0.24 0.00 0.00 0.20 0.17 0.00 1.67 0.93 6.92 19.32 23 I5_AR1 ActiveIntronRegion 0 1.66 0.12 0.22 0.12 0.16 0.00 1.28 1.56 1.00 0.21 0.00 0.22 0.00 0.24 0.00 0.00 0.20 0.17 0.00 1.67 0.93 6.93 19.37 24 E6_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 0.00 0.00 12.04 25 ER6a ExonRegion 0 2.20 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 3.31 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.74 0.00 10.80 11.99 26 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 5.74 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.18 11.52 27 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.24 0.66 0.00 0.00 2.19 0.00 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 3.60 11.35 28 E7a_E8e KnownJunction 0 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.57 4.61 29 ER8a ExonRegion 0 0.86 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.00 2.17 4.79 30 E8_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 3.12 0.00 31 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 5.70 9.89 32 E8_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 4.70 0.00 0.00 0.00 1.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.19 20.49 33 E8a_E8c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER8c ExonRegion 0 1.68 0.62 1.54 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.08 0.00 0.00 0.72 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.68 6.13 35 E8_Ac KnownBoundary 0 3.26 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.63 7.26 36 ER8d ExonRegion 0 0.49 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.49 1.86 37 E8_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER8e ExonRegion 0 1.80 0.81 0.36 0.81 0.00 0.00 0.26 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 2.47 39 E8_Db KnownBoundary 0 7.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.39 11.78 40 E8b_E8e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 E8_Ae KnownBoundary 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 11.27 42 ER8f ExonRegion 0 4.03 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 1.65 0.00 0.20 7.67 43 ER8g ExonRegion 0 1.58 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 1.41 0.00 0.00 2.15 0.00 6.85 11.64 44 E8c_E9a KnownJunction 0 3.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.94 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.88 0.00 0.00 7.77 45 ER9a ExonRegion 0 0.95 0.00 0.89 0.00 0.00 0.00 2.77 0.00 1.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.45 0.00 3.71 10.01 46 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.25 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.14 15.96 47 ER10a ExonRegion 0 2.69 0.00 1.04 0.00 0.00 0.00 2.65 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.04 15.66 48 E10_Da KnownBoundary 0 3.48 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.33 15.11 49 E10a_E10b KnownJunction 0 3.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER10b ExonRegion 0 2.22 0.00 1.33 0.41 0.00 0.00 0.29 1.04 0.33 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.59 23.42 51 E10_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.83 1.83 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 23.39 52 ER10c ExonRegion 0 2.97 0.00 1.85 1.04 0.00 0.00 0.24 2.50 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.28 7.50 53 E10b_E11a KnownJunction 0 6.59 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 1.90 1.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.63 7.00 54 ER11a ExonRegion 0 3.14 0.00 2.78 0.00 0.00 0.00 2.25 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.55 12.37 55 E11a_E12a KnownJunction 0 3.04 0.00 1.83 3.73 0.00 0.00 2.03 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 7.77 56 ER12a ExonRegion 0 4.05 0.00 0.95 0.81 0.00 0.85 1.77 0.27 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.87 12.74 57 E12a_E13a KnownJunction 0 14.37 0.00 2.99 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.14 0.00 58 ER13a ExonRegion 0 5.51 0.00 3.42 0.32 0.00 0.09 0.00 1.48 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.96 7.32 59 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 2.18 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.12 11.95 60 ER14a ExonRegion 0 3.19 1.89 0.83 0.62 1.36 1.48 4.43 0.11 3.52 0.52 1.68 1.69 1.73 1.00 1.95 0.18 2.93 0.00 0.00 1.17 0.90 12.73 25.07 61 E14_Da KnownBoundary 0 1101.31 1094.15 998.49 1008.70 1021.14 817.14 1436.04 1243.76 904.36 1077.78 683.70 204.82 332.93 302.08 369.74 927.45 1145.86 1224.82 801.43 1329.99 881.56 628.50 834.85 62 ER14b ExonRegion 0 6.16 8.53 0.87 0.00 9.89 3.54 13.82 1.71 1.87 1.52 3.55 11.52 17.15 9.63 23.46 3.68 8.18 4.51 7.10 11.99 4.06 14.33 43.49 63 ER14c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 2.94