Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 TMPRSS3 Gene 0 2.31 1.23 2.02 0.31 1.76 1.03 1.65 2.85 9.65 0.29 0.78 1.80 1.85 2.20 2.13 1.77 1.19 0.46 1.87 1.74 0.46 0.49 1.40 2 422004 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 380399 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 455937 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 291532 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 398397 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 433957 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 398405 Transcript 0 1.59 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.43 1.11 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 452628 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 482761 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 398403 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 474596 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 476848 Transcript 0 1.42 0.00 2.02 0.24 1.67 0.23 0.00 1.59 5.43 0.04 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 0.00 0.08 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 14 478680 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER1a ExonRegion 0 1.00 0.00 0.00 0.41 1.44 0.00 0.18 0.28 0.77 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 1.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.52 0.00 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E1a_E1e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER1e ExonRegion 0 1.59 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.43 1.11 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E1_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER1f ExonRegion 0 1.23 0.72 0.39 0.00 1.90 0.00 0.00 2.68 17.52 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E1b_E2b KnownJunction 0 3.63 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 6.00 29.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E1b_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER2a ExonRegion 0 0.76 0.00 0.25 0.00 0.36 0.24 0.18 0.70 0.75 0.92 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.07 0.00 0.00 0.00 28 E2_Ab KnownBoundary 0 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.07 0.00 0.00 0.00 30 ER2b ExonRegion 0 4.23 0.00 3.68 0.00 0.00 0.00 0.00 3.46 25.73 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 31 ER2c ExonRegion 0 0.45 0.00 2.57 2.37 0.00 5.40 0.00 3.51 27.05 0.53 0.00 1.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.68 0.00 0.00 0.00 32 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 1.48 3.53 0.00 0.00 0.00 4.81 27.26 1.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.58 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.02 0.04 0.00 0.00 0.00 0.05 1.45 0.02 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 2.05 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER3b ExonRegion 0 3.72 0.00 3.23 0.54 2.35 0.73 0.00 4.62 29.46 0.81 0.85 1.38 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31.51 1.40 0.00 0.00 0.00 2.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER4a ExonRegion 0 1.74 0.00 1.87 1.63 1.10 3.55 0.00 6.06 27.75 0.58 0.79 0.17 0.00 3.27 0.00 1.22 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 38 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 4.58 0.00 0.00 0.00 0.00 2.30 15.54 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER5a ExonRegion 0 1.56 0.00 3.75 0.03 0.00 0.29 0.00 4.31 26.63 1.15 0.57 1.75 0.00 3.24 0.00 1.20 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 40 E5a_E6a KnownJunction 0 6.59 0.00 8.07 0.00 0.00 0.00 0.00 1.73 16.12 0.00 2.37 0.00 0.00 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER6a ExonRegion 0 1.15 0.00 3.43 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 12.13 1.15 0.62 0.00 0.00 3.99 0.00 2.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E6a_E7b KnownJunction 0 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.09 10.62 0.00 0.00 0.00 0.00 7.18 0.00 7.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER7a ExonRegion 0 0.39 0.00 1.64 0.00 0.67 0.68 0.00 1.11 3.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.00 0.01 0.00 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 44 E7_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.57 0.00 3.99 0.00 0.00 2.34 7.23 0.00 0.00 0.00 0.00 4.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER7b ExonRegion 0 1.68 0.00 3.32 0.23 1.51 0.00 0.00 6.05 17.99 0.10 0.00 0.00 0.00 4.95 0.00 1.55 0.00 0.15 1.78 0.00 0.00 0.00 0.00 46 E7_Da KnownBoundary 0 2.74 0.00 1.83 1.96 0.00 0.00 0.00 1.52 5.96 0.00 0.00 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E7a_E7c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 E7a_E7e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 8.57 0.00 0.00 6.41 22.71 0.00 0.00 0.00 0.00 4.83 0.00 4.36 0.00 1.82 3.86 0.00 0.00 0.00 0.00 49 ER7c ExonRegion 0 1.10 0.00 1.51 0.72 2.26 0.00 0.00 1.31 3.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 E7_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.53 4.33 0.00 0.00 3.57 3.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 ER7d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.48 0.27 1.04 0.00 0.00 3.62 3.65 0.00 0.00 0.00 0.00 1.89 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 52 E7_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 53 E7_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER7e ExonRegion 0 0.00 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 2.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 55 E7_Dc KnownBoundary 0 3.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.19 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 E7c_E7e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 ER7f ExonRegion 0 0.00 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 58 ER7g ExonRegion 0 2.77 0.00 2.91 0.00 2.08 0.00 0.00 2.35 9.47 0.12 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.01 0.00 0.24 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 59 E7_Ae KnownBoundary 0 6.22 0.00 5.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.51 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 ER7h ExonRegion 0 2.73 0.00 4.33 0.00 0.60 0.00 0.00 8.54 23.28 1.07 0.00 0.00 0.00 4.28 0.00 3.10 0.00 0.60 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 61 E7_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 E7d_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.55 0.00 3.90 0.00 0.00 12.36 12.53 1.45 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 8.85 0.00 0.00 0.00 0.00 63 ER7i ExonRegion 0 0.58 0.00 0.24 0.55 0.00 0.00 0.00 1.40 5.03 0.00 1.58 0.00 0.00 0.81 0.00 0.81 0.00 0.00 0.87 0.00 0.00 0.00 0.00 64 ER7j ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 65 ER8a ExonRegion 0 2.14 0.00 1.37 0.00 2.90 0.00 0.00 10.68 12.60 0.27 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 1.49 0.00 0.38 1.16 0.00 0.00 0.04 0.00 66 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 E8a_E9b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.07 0.00 0.00 7.48 19.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 68 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.00 0.67 0.00 0.00 2.16 9.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 69 ER9b ExonRegion 0 0.94 0.00 4.92 0.00 1.58 0.00 0.00 5.67 12.42 0.00 0.00 2.56 0.00 1.64 0.00 0.04 0.00 1.34 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 70 E9a_E10a KnownJunction 0 3.19 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 4.19 16.49 0.00 0.00 0.00 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 71 ER10a ExonRegion 0 2.63 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 3.22 10.18 0.00 0.27 2.38 0.00 2.51 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 0.00 0.69 0.00 72 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.45 0.00 0.00 0.00 0.00 4.52 21.30 0.00 2.68 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 2.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 73 ER11a ExonRegion 0 7.66 7.70 5.21 0.70 5.85 4.74 10.03 5.69 19.09 0.59 4.28 9.31 11.78 8.57 13.57 9.38 7.58 2.38 9.14 10.99 2.92 2.87 8.93 74 ER11b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00