Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 KCNJ15 Gene 0 3.55 0.11 0.94 0.56 1.20 0.29 0.05 0.82 0.12 0.27 0.00 0.00 0.00 2.79 4.97 0.00 0.57 0.35 0.00 0.00 3.70 14.81 27.43 2 398925 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 398928 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 328656 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 443341 Transcript 0 0.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 6 417042 Transcript 0 0.36 0.00 0.00 0.19 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 0.00 0.40 1.50 4.60 7 417813 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 398938 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 398932 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 438657 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 398930 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 398934 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 2.35 13 398927 Transcript 0 3.14 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 8.28 9.22 14 419868 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1a_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E1a_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER2a ExonRegion 0 1.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.08 5.96 22 E2_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.91 23 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 1.83 10.28 24 E2_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 25 ER2d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 1.36 3.23 26 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E2a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E2a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 8.02 29 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER4a ExonRegion 0 3.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 0.00 0.00 32 E4a_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E5_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER5c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 3.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 38 E5_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.94 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER5d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 3.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.18 40 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 E5a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.54 44 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 ER7a ExonRegion 0 2.87 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.42 4.98 14.09 46 E7a_E8a KnownJunction 0 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 11.57 4.35 47 ER8a ExonRegion 0 3.62 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 3.06 1.21 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 6.64 17.64 22.50 48 E8_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 18.43 7.34 49 E8a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 E8b_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E8b_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.12 1.73 0.00 0.00 0.00 2.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.36 0.00 0.00 11.43 11.51 16.05 52 E8b_E10b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 ER8b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.71 1.36 0.00 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.89 1.45 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 11.02 14.41 12.73 54 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.75 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 1.62 3.69 9.76 55 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.33 8.62 56 E10_Ab NovelBoundary 0 2.89 0.00 1.24 1.40 3.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 7.48 7.16 14.68 57 ER10a ExonRegion 0 1.90 0.00 1.23 1.36 2.68 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.14 2.90 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 11.90 16.67 24.67 58 ER10b ExonRegion 0 1.35 0.00 2.95 0.93 1.54 0.00 0.00 0.55 1.03 0.87 0.00 0.00 0.00 2.95 10.86 0.00 2.55 1.93 0.00 0.00 7.68 17.90 28.88 59 E10_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 1.53 0.00 0.00 0.00 5.00 5.19 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 2.59 20.82 39.69 60 ER10c ExonRegion 0 0.45 0.00 1.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.43 0.49 0.00 0.00 0.00 5.03 9.42 0.00 0.00 0.91 0.00 0.00 5.13 45.12 87.09 61 E10_Db KnownBoundary 0 6.96 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.12 13.35 0.00 0.00 3.56 0.00 0.00 6.30 112.12 176.53 62 ER10d ExonRegion 0 4.69 0.00 2.11 1.26 0.00 0.00 0.00 4.28 1.22 1.08 0.00 0.00 0.00 5.20 9.77 0.00 1.42 1.85 0.00 0.00 8.78 50.71 91.62 63 E10_Dc KnownBoundary 0 13.85 0.00 1.30 1.56 0.00 0.00 0.00 4.72 1.24 1.24 0.00 0.00 0.00 4.94 18.54 0.00 4.11 0.00 0.00 0.00 6.30 24.92 51.13 64 ER10e ExonRegion 0 10.60 0.00 1.27 0.73 1.17 0.40 0.00 2.65 0.06 0.82 0.00 0.00 0.00 7.91 11.54 0.00 1.77 1.02 0.00 0.00 6.21 32.22 73.76 65 E10_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.12 4.45 0.00 0.00 2.32 0.00 0.00 8.65 18.92 45.93 66 ER10f ExonRegion 0 1.88 0.00 3.70 1.11 0.00 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.02 11.39 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 6.53 23.35 60.34 67 E10_De KnownBoundary 0 3.04 0.00 6.45 0.00 0.00 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.24 24.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.72 22.72 62.06 68 ER10g ExonRegion 0 5.07 0.00 3.51 0.00 1.56 1.06 0.25 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.07 10.91 0.00 2.98 1.64 0.00 0.00 10.62 30.97 64.97 69 E10_Df KnownBoundary 0 17.34 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 0.00 2.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.77 8.90 0.00 4.30 0.00 0.00 0.00 14.21 25.60 20.06 70 ER10h ExonRegion 0 8.59 0.92 2.75 2.02 2.11 1.64 0.34 1.41 0.24 0.22 0.00 0.00 0.00 4.31 7.77 0.00 1.39 0.67 0.00 0.00 5.83 24.63 52.56 71 E10_Dg KnownBoundary 0 7.56 3.35 1.12 1.56 7.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 10.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.46 17.39 26.80 72 ER10i ExonRegion 0 3.93 0.04 0.51 0.59 2.22 0.00 0.00 1.32 0.17 0.40 0.00 0.00 0.00 2.73 5.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.40 15.34 17.76 73 E10_Dh KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.25 19.21 74 ER10j ExonRegion 0 1.32 0.00 0.30 0.00 1.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 4.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.02 9.83 24.44 75 ER10k ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 2.35