Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AF127936.1 Gene 0 2.41 7.06 3.11 0.89 3.28 1.25 1.53 0.59 0.65 1.02 3.76 6.52 4.70 0.15 0.80 3.13 0.12 4.06 7.49 8.66 6.03 6.18 3.24 2 418954 Transcript 0 0.18 0.00 0.00 0.00 0.23 0.15 0.45 0.00 0.31 0.00 0.35 1.86 0.00 0.23 0.17 0.42 0.00 0.00 0.16 0.64 1.11 0.35 0.15 3 412426 Transcript 0 0.00 0.40 0.07 0.00 0.00 0.00 0.74 0.10 0.15 0.00 0.23 0.31 1.14 0.05 0.31 0.59 0.00 0.55 0.76 0.42 0.35 0.41 0.23 4 432230 Transcript 0 1.14 6.75 2.77 0.85 2.78 2.93 0.64 1.94 1.63 0.71 5.65 4.79 4.72 0.02 0.26 3.19 0.06 10.37 9.43 11.87 13.77 10.00 4.96 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 6 E1_Da NovelBoundary 0 147.51 195.29 210.84 286.81 129.03 109.65 265.42 253.84 270.34 190.32 23.37 101.73 124.02 49.80 39.68 151.93 103.79 221.61 132.62 210.93 64.74 44.52 119.08 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1b ExonRegion 0 0.64 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.78 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.57 3.11 2.57 2.70 3.20 0.56 0.40 1.06 0.71 0.01 7.21 0.13 1.18 0.00 0.63 6.41 0.00 6.97 8.20 14.77 16.57 8.97 7.26 10 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 2.96 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 5.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.81 11.86 10.93 5.93 2.76 0.00 11 E2a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.66 1.73 0.00 0.00 0.00 3.61 0.00 0.00 2.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.15 0.00 11.82 16.87 11.08 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 1.37 0.66 0.00 0.89 0.86 0.59 2.14 0.00 0.44 0.00 4.21 1.01 4.99 0.86 1.32 2.24 0.00 1.24 5.20 3.88 2.66 2.20 2.19 13 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 0.00 0.00 0.00 0.00 3.85 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 4.35 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER3b ExonRegion 0 0.36 0.00 0.00 0.00 0.45 0.31 0.89 0.00 0.62 0.00 0.70 2.40 0.00 0.45 0.34 0.83 0.00 0.00 0.32 0.38 2.22 0.70 0.29 16 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.81 0.15 0.00 0.00 0.00 1.47 0.20 0.29 0.00 0.46 0.63 2.28 0.09 0.62 1.18 0.00 1.09 1.52 0.85 0.70 0.83 0.47 17 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 2.76 0.00 0.00 0.00 0.00 1.85 1.73 0.00 0.00 0.00 13.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 0.00 7.78 2.37 0.29 5.46 1.60 0.66 3.42 1.65 0.83 4.93 7.64 4.64 0.00 0.00 4.75 0.00 9.62 14.58 13.56 18.77 7.29 7.05 19 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 6.38 1.33 0.00 0.00 7.89 0.00 0.00 4.08 0.00 10.06 0.00 6.82 0.00 0.00 3.76 0.00 13.64 11.39 8.31 11.61 11.51 8.11 20 ER6a ExonRegion 0 4.55 12.85 5.72 1.36 5.66 2.21 1.91 0.73 0.79 1.99 5.57 11.53 7.42 0.08 1.05 4.27 0.23 6.06 11.76 13.78 7.81 10.11 4.68 21 IG1_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 3.12 9.01 4.09 1.96 2.22 2.25 2.34 1.54 2.20 1.40 2.76 8.17 6.91 0.06 0.28 1.81 0.00 2.04 5.14 10.37 0.79 8.20 2.83 22 IG1_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.50 14.59 6.70 1.04 0.00 1.29 3.58 0.00 1.24 1.96 0.00 0.00 3.86 1.24 0.00 3.50 0.00 0.00 0.00 11.51 0.39 14.22 2.42 23 IG1_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.64 20.69 3.65 0.55 0.87 2.40 2.78 0.02 0.42 0.39 0.63 2.33 10.22 0.30 0.00 1.18 0.00 0.00 4.33 14.96 0.00 10.14 3.65 24 IG1_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 1.59 17.65 2.48 0.09 4.72 1.17 2.71 3.23 0.81 2.92 0.82 7.35 4.54 0.14 0.22 0.63 0.00 0.02 4.94 7.83 1.65 6.25 0.95 25 IG1_SR2 SilentIntergenicRegion 0 3.08 11.79 1.14 0.67 3.60 1.15 3.03 3.87 0.71 0.36 0.40 5.43 1.63 0.28 0.43 0.00 0.00 1.68 4.85 8.19 3.21 7.56 5.43 26 IG1_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 4.79 11.39 5.23 1.96 3.59 2.71 1.70 0.95 1.08 0.63 4.02 3.40 2.00 0.16 0.00 2.40 0.00 3.81 14.92 11.95 7.16 9.44 3.73