Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AP001596.1 Gene 0 0.82 0.09 0.54 1.11 0.91 0.67 2.58 0.41 1.42 1.09 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 1.30 0.10 2.10 1.80 1.07 2 429340 Transcript 0 0.12 0.00 0.11 0.18 0.00 0.00 0.16 0.00 0.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.39 0.00 0.00 3 452460 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.15 0.00 0.07 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 4 421771 Transcript 0 0.79 0.00 0.00 0.78 0.91 0.31 2.03 0.18 1.43 0.87 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 1.35 0.00 1.40 2.15 1.55 5 444306 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.22 0.00 0.31 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E2_Aa NovelBoundary 0 61.57 31.18 144.79 278.39 44.82 28.51 59.58 293.02 237.15 255.67 17.69 0.00 6.66 7.59 11.74 46.23 72.09 105.04 36.61 79.13 42.07 12.19 25.18 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2_Da NovelBoundary 0 29.19 67.49 69.36 115.30 36.16 28.51 113.45 72.08 83.65 77.74 2.00 5.70 13.47 8.65 0.00 37.51 39.55 111.72 41.70 81.94 23.72 11.27 48.57 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER4b ExonRegion 0 0.04 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E4a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E4a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.86 0.82 3.46 19 E5a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.31 0.00 0.44 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 21 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.44 0.00 0.61 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E7a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER10a ExonRegion 0 1.22 0.00 1.07 1.11 0.00 0.00 1.55 0.00 2.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.73 0.00 3.88 0.00 0.00 28 E10_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 3.67 1.66 3.31 0.00 7.86 1.97 6.13 5.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.27 0.00 0.00 9.08 2.69 7.00 29 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER11a ExonRegion 0 0.61 0.59 2.87 2.72 1.94 2.13 4.89 1.87 2.18 1.79 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.88 1.93 0.62 5.47 2.18 2.98 31 E11_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 4.44 1.73 0.00 0.00 3.80 0.00 2.95 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.97 14.02 0.00 11.74 5.57 0.00 32 ER11b ExonRegion 0 3.37 0.00 1.11 1.50 0.00 1.95 6.67 0.00 1.80 2.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 1.99 0.00 7.09 3.56 1.62 33 E11_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.86 0.00 0.00 16.34 0.00 4.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.61 0.00 16.31 11.33 0.00 34 ER11c ExonRegion 0 2.37 0.00 0.00 2.35 2.73 0.94 6.08 0.53 3.56 2.61 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.41 2.81 0.00 3.33 5.64 1.19